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文檔簡介
非編碼RNA:是指不編碼蛋白質的RNA上行使各自的生物學功能。
管家非編碼RNA:rRNA、tRNA、snoRNA(核仁小調控非編碼RNA:長鏈非編碼RNAmiRNA常用數據 搜尋動物的microRNA靶。是預測microRNA開發的搜尋動物的microRNA靶。假陽性率也miRBase數據出 頁 搜索物可以直接寫具體物到其它數據預測到 顯示 組信 點擊顯 位點信列下方頁面具體顯示匹配位lncRNA常用 、ONCODE等,利用gene 以“ANRIL”為例,輸入名ANRIL的別有很多較新的lncRNA在Lncrnadb對于較新的lncRNA可以使用UCSC數據庫式包括: 預測lncRNA與蛋白結合的數據庫RBPDB以ANRIL為點擊搜索結果頁面的RBPname可顯示具體信反過來,從蛋白預測結合的如果已知蛋白的結合序列可以進行Blast搜 NONDMET033136.1如果想在NCBI上了解信息,可以用NCBIblast搜索該序 circRNA常用數 獲取環狀RNA點擊search后出 et數據 circularRNA 提供circRNA 注顯示結circRNA驗證反向引物設ncRNA相互關聯 (degradomesequencing)搜尋micorRNA靶標,提miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA和RNA-1根據lncRNA找microRNA以lncRNAHOTAIR為預測與3個腫瘤相2查找RNA的結合得到“HOTAIR”可能的靶向蛋與RNA結合的蛋白信Ensemble數據庫里的Hotair信HotaircDNA3根 找microRNA靶4查找ceRNA調控 名點擊miRNA后出現該miRNA的相關文 2【MirPathv.3】:顯示通路結可以同時分析多條miRNA通路交集的熱輸入miRNA名 搜索結4【miRGenv.3】:miRNA啟動子和5【MirExTrav2.0】:尋找差異的miRNA 選擇好后點擊顯示下調最顯著
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