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文檔簡介
第二章DNA損傷與修復(fù)DNA的損傷與修復(fù)講義課件第二節(jié)DNA損傷DNA的損傷與修復(fù)講義課件一、DNA損傷因素(一)內(nèi)源性損傷(體內(nèi)因素)1、DNA復(fù)制錯誤:堿基配對從A-T轉(zhuǎn)換成G-C。2、堿基自身互變異構(gòu)體:C的異構(gòu)體與A錯誤配對。3、自發(fā)的化學(xué)變化4、氧化損傷(二)外源性損傷(體外因素)1、物理因素2、化學(xué)因素(化學(xué)試劑)一、DNA損傷因素(一)內(nèi)源性損傷(體內(nèi)因素)二、多種化學(xué)或物理因素可誘發(fā)突變1、大量的突變屬于自發(fā)突變,發(fā)生頻率只不過在10-9左右。但由于生物基因組龐大,細(xì)胞繁殖速度快,因此它的作用是不可低估的。2、實驗室用來誘發(fā)突變,也是生活環(huán)境中導(dǎo)致突變的因素,主要有物理和化學(xué)因素。
二、多種化學(xué)或物理因素可誘發(fā)突變1、大量的突變屬于自發(fā)突變,物理因素:紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射
UV物理因素:UV化學(xué)因素:化學(xué)因素:三、突變在生物界普遍存在(一)突變是進化、分化的分子基礎(chǔ)1、DNA突變具體指個別dNMP殘基以至片段DNA在構(gòu)成、復(fù)制或表型功能的異常變化,也稱為DNA損傷(DNAdamage)。2、從分子水平來看,突變就是DNA分子上堿基的改變。三、突變在生物界普遍存在(一)突變是進化、分化的分子基礎(chǔ)1、3、從長遠(yuǎn)的生物史看,進化過程是突變的不斷發(fā)生所造成的。4、大量的突變都是屬于這種類型,只是目前還未能認(rèn)識其發(fā)生的真正原因,因而名為自發(fā)突變或自然突變(spontaneousmutation)。3、從長遠(yuǎn)的生物史看,進化過程是突變的不(二)只有基因型改變的突變形成DNA的多態(tài)性1、這種突變沒有可察覺的表型改變,例如在簡并密碼子上第三位堿基的改變,蛋白質(zhì)非功能區(qū)段上編碼序列的改變等。這些現(xiàn)象也相當(dāng)普遍。2、多態(tài)性(polymorphism)一詞用來描述個體之間的基因型差別現(xiàn)象。
(二)只有基因型改變的突變形成DNA的多態(tài)性1、這種突變沒有(三)致死性的突變可導(dǎo)致個體、細(xì)胞的死亡
(四)突變是某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)(三)致死性的突變可導(dǎo)致個體、細(xì)胞的死亡四、引起突變的分子改變類型有多種錯配(mismatch)缺失(deletion)插入(insertion)重排(rearrangement)
框移(frame-shift)
四、引起突變的分子改變類型有多種錯配(mismatch)框DNA分子上的堿基錯配稱點突變(pointmutation)。自發(fā)突變和不少化學(xué)誘變都能引起DNA上某一堿基的置換。點突變發(fā)生在基因的編碼區(qū),可導(dǎo)致氨基酸改變。
(一)錯配可導(dǎo)致編碼氨基酸的改變DNA分子上的堿基錯配稱點突變(pointmutation鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val
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his
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leu
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thr
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pro·
val
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glu
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C肽鏈CACGTG基因正常成人Hb(HbA)β亞基N-val
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C肽鏈CTCGAG基因鐮形紅細(xì)胞貧血病人鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val·h(二)缺失、插入和框移突變造成蛋白質(zhì)氨基酸排列順序發(fā)生改變1、缺失:一個堿基或一段核苷酸鏈從DNA大分子上消失。2、插入:原來沒有的一個堿基或一段核苷酸鏈插入到DNA大分子中間。缺失或插入都可導(dǎo)致框移突變。3、框移突變是指三聯(lián)體密碼的閱讀方式改變,造成蛋白質(zhì)氨基酸排列順序發(fā)生改變。(二)缺失、插入和框移突變造成蛋白質(zhì)氨基酸排列順序發(fā)生改變1谷酪蛋絲5’……GCA
GUA
CAU
GUC……丙纈組纈正常5’……GAG
UAC
AUG
UC……缺失C缺失引起框移突變:谷酪蛋(三)重組或重排常可引起遺傳、腫瘤等疾病1、DNA分子內(nèi)較大片段的交換,稱為重組或重排。2、移位的DNA可以在新位點上顛倒方向反置(倒位),也可以在染色體之間發(fā)生交換重組。(三)重組或重排常可引起遺傳、腫瘤等疾病1、DNA分子內(nèi)較大DNA損傷(突變)可能造成兩種結(jié)果:其一是導(dǎo)致復(fù)制或轉(zhuǎn)錄障礙(如胸腺嘧啶二聚體,DNA骨架中產(chǎn)生切口或斷裂);其二是導(dǎo)致復(fù)制后基因突變(如胞嘧啶自發(fā)脫氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ笵NA序列發(fā)生永久性改變。所以,必須通過進化使細(xì)胞擁有靈敏的機制,以識別和修復(fù)這些損傷,否則細(xì)胞無法維持正常代謝。DNA損傷(突變)可能造成兩種結(jié)果:其一是導(dǎo)致復(fù)制或轉(zhuǎn)錄障礙
第三節(jié)DNA損傷修復(fù)
DNA損傷修復(fù)(repair):是對已發(fā)生分子改變的補償措施,使其盡可能回復(fù)為原有的天然狀態(tài)。修復(fù)的意義:保證DNA攜帶的遺傳信息能完全地忠實轉(zhuǎn)給子代、維持生物特征的穩(wěn)定性和完整性。DNA損傷修復(fù)(repair):一、DNA損傷的修復(fù)有多種類型錯配修復(fù)(mismatchrepair)直接修復(fù)(directrepair)光修復(fù)(lightrepairing)切除修復(fù)(excisionrepairing)重組修復(fù)(recombinationrepairing)SOS修復(fù)
一、DNA損傷的修復(fù)有多種類型錯配修復(fù)(mismatchr1、嘧啶二聚體的直接修復(fù)(lightrepair)這是一種廣泛存在的修復(fù)作用,能夠修復(fù)任何嘧啶二聚體的損傷。修復(fù)過程由光修復(fù)酶(photolyase)催化完成。一、有些DNA損傷可以直接修復(fù)1、嘧啶二聚體的直接修復(fù)(lightrepair)一、有些(一)直接修復(fù)系統(tǒng)利用酶簡單地逆轉(zhuǎn)DNA損傷光修復(fù)酶(photolyase)
UV(一)直接修復(fù)系統(tǒng)利用酶簡單地逆轉(zhuǎn)DNA損傷光修復(fù)酶(pho修復(fù)過程:⑴修復(fù)酶(photolyase)識別嘧啶二聚體并與之結(jié)合形成復(fù)合物;⑵在300~600nm可見光照射下,酶獲得能量,將嘧啶二聚體的丁酰環(huán)打開;⑶光修復(fù)酶從DNA上解離。修復(fù)過程:二、切除修復(fù)是最普遍的DNA損傷修復(fù)方式1、堿基切除修復(fù)2、核苷酸切除修復(fù)3、堿基錯配修復(fù)二、切除修復(fù)是最普遍的DNA損傷修復(fù)方式1、堿基切除修復(fù)
堿基切除修復(fù)依賴于生物體內(nèi)存在的一類特異的DNA糖基化酶。切除修復(fù)過程:(1)識別水解(2)切除(3)合成(4)連接1、堿基切除修復(fù)(baseexcisionrepair)堿基切除修復(fù)依賴于生物體內(nèi)存在的一類特異的DNADNA的損傷與修復(fù)講義課件(二)核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)識別DNA雙螺旋變形這是細(xì)胞內(nèi)最重要和有效的修復(fù)方式。其過程包括去除損傷的DNA,填補空隙和連接。主要由DNA-polⅠ和連接酶完成。(二)核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)識別DNA雙螺旋變形這是細(xì)胞內(nèi)最重要這也是一種廣泛存在的修復(fù)機制,可適用于多種DNA損傷的修復(fù)。切除修復(fù)機制的基本過程是將受損的DNA片段切除,然后再以對側(cè)鏈為模板,重新合成新鏈進行修復(fù)。由核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)負(fù)責(zé)進行修復(fù)。這也是一種廣泛存在的修復(fù)機制,可適用于多種DNA損傷的修復(fù)。切除修復(fù)系統(tǒng)步驟⑴核酸內(nèi)切酶UvrA、UvrB和UvrC蛋白識別損傷部位⑵UvrC將受損片段切除⑶DNApolⅠ填補缺口⑷連接酶封口UvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶ⅠOHPDNA連接酶ATP切除修復(fù)系統(tǒng)步驟UvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶Ⅰ堿基丟失堿基缺陷或錯配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶插入酶堿基取代堿基丟失堿基缺陷或錯配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除D
核苷酸切除修復(fù)不僅能夠修復(fù)整個基因組中的損傷,而且能拯救因轉(zhuǎn)錄模板鏈損傷而暫停轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶,即參與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)(transcription-coupledrepair)。轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)的意義在于,將修復(fù)酶集中于正在轉(zhuǎn)錄的DNA,使該區(qū)域的損傷盡快得以修復(fù)。核苷酸切除修復(fù)不僅能夠修復(fù)整個基因組中的損傷,錯配修復(fù)對DNA復(fù)制忠實性的貢獻力達102-103,DNA子鏈中的錯配幾乎完全都被修正,充分反映了母鏈的重要性。錯誤的堿基配對可以通過母鏈中識別標(biāo)記區(qū)分;標(biāo)記是GATC(回文結(jié)構(gòu))中A甲基化,E.coli中的3個蛋白質(zhì)(MutS、MutH和MutL)校正。該修復(fù)系統(tǒng)只校正新合成的DNA,因為新合成DNA鏈的GATC序列中的A(腺苷酸殘基)開始未被甲基化。GATC中A甲基化與否常用來區(qū)別新合成的鏈(未甲基化)和模板鏈(甲基化)。3、堿基錯配修復(fù)錯配修復(fù)對DNA復(fù)制忠實性的貢獻力達102-103,DNA子錯配修復(fù)系統(tǒng)作用機制:⑴MutS蛋白識別錯配的堿基;并吸引MutL蛋白到這個位置,新生鏈的GATC序列未甲基化;⑵MutL蛋白激活MutH蛋白,在新鏈的未甲基化的GATC打開缺口;⑶外切核酸酶切除3’到5’方向錯配堿基與GATC序列之間的間隔的DNA序列,聚合酶填補空缺;⑷DNA連接酶封閉缺口,甲基化酶在新鏈甲基化。錯配修復(fù)系統(tǒng)作用機制:新復(fù)制DNA的新舊鏈區(qū)別新復(fù)制DNA的新舊鏈區(qū)別E.Coli錯配修復(fù)系統(tǒng)作用機制E.ColiDNA的損傷與修復(fù)講義課件重組修復(fù)(recombinationrepair)這是DNA的復(fù)制過程中所采用的一種有差錯的修復(fù)方式。修復(fù)時,利用重組蛋白RecA的核酸酶活性,將另一股健康親鏈與損傷缺口相互交換。某些DNA修復(fù)發(fā)生在跨越損傷DNA的復(fù)制事件之后(了解)重組修復(fù)(recombinationrepair)某些DN重組修復(fù)步驟:⑴將正常母鏈上一段與損傷子鏈缺口同源片段轉(zhuǎn)移進行重組,使母鏈上帶有缺口;⑵DNA聚合酶填補母鏈上的缺口;⑶DNA連接酶封口。損傷的DNA經(jīng)過數(shù)代復(fù)制可得到稀釋,從而對細(xì)胞的影響減至最小。重組修復(fù)步驟:重組修復(fù)重組修復(fù)DNA的損傷與修復(fù)講義課件DNA的損傷與修復(fù)講義課件SOS修復(fù)1、當(dāng)DNA損傷廣泛難以繼續(xù)復(fù)制時,由此而誘發(fā)出一系列復(fù)雜的反應(yīng)。2、在E.coli,各種與修復(fù)有關(guān)的基因,組成一個稱為調(diào)節(jié)子(regulon)的網(wǎng)絡(luò)式調(diào)控系統(tǒng)。3、這種修復(fù)特異性低,對堿基識別、選擇能力差。通過SOS修復(fù),復(fù)制如能繼續(xù),細(xì)胞是可存活的。但DNA保留的錯誤較多,導(dǎo)致較廣泛、長期突變。SOS修復(fù)1、當(dāng)DNA損傷廣泛難以繼續(xù)復(fù)制時,由此而誘
SOS反應(yīng)的機制(大腸桿菌應(yīng)急修復(fù)系統(tǒng))未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因lexA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏recA基因被LexA
蛋白質(zhì)部分阻遏(40個不同的位點被阻遏)LexA(阻遏物)
RecA(輔蛋白酶)靶基因表達lexA靶基因表達但產(chǎn)物被分解recA大量表達RecA促使分解LexA誘導(dǎo)的細(xì)胞單鏈DNAATPSOS反應(yīng)的機制(大腸桿菌應(yīng)急修復(fù)系統(tǒng))未誘導(dǎo)的細(xì)胞靶基因DNA的損傷與修復(fù)講義課件五、DNA損傷修復(fù)系統(tǒng)與疾病(了解)五、DNA損傷修復(fù)系統(tǒng)與疾病(了解)DNA的損傷與修復(fù)講義課件第二章DNA損傷與修復(fù)DNA的損傷與修復(fù)講義課件第二節(jié)DNA損傷DNA的損傷與修復(fù)講義課件一、DNA損傷因素(一)內(nèi)源性損傷(體內(nèi)因素)1、DNA復(fù)制錯誤:堿基配對從A-T轉(zhuǎn)換成G-C。2、堿基自身互變異構(gòu)體:C的異構(gòu)體與A錯誤配對。3、自發(fā)的化學(xué)變化4、氧化損傷(二)外源性損傷(體外因素)1、物理因素2、化學(xué)因素(化學(xué)試劑)一、DNA損傷因素(一)內(nèi)源性損傷(體內(nèi)因素)二、多種化學(xué)或物理因素可誘發(fā)突變1、大量的突變屬于自發(fā)突變,發(fā)生頻率只不過在10-9左右。但由于生物基因組龐大,細(xì)胞繁殖速度快,因此它的作用是不可低估的。2、實驗室用來誘發(fā)突變,也是生活環(huán)境中導(dǎo)致突變的因素,主要有物理和化學(xué)因素。
二、多種化學(xué)或物理因素可誘發(fā)突變1、大量的突變屬于自發(fā)突變,物理因素:紫外線(ultraviolet,UV)、各種輻射
UV物理因素:UV化學(xué)因素:化學(xué)因素:三、突變在生物界普遍存在(一)突變是進化、分化的分子基礎(chǔ)1、DNA突變具體指個別dNMP殘基以至片段DNA在構(gòu)成、復(fù)制或表型功能的異常變化,也稱為DNA損傷(DNAdamage)。2、從分子水平來看,突變就是DNA分子上堿基的改變。三、突變在生物界普遍存在(一)突變是進化、分化的分子基礎(chǔ)1、3、從長遠(yuǎn)的生物史看,進化過程是突變的不斷發(fā)生所造成的。4、大量的突變都是屬于這種類型,只是目前還未能認(rèn)識其發(fā)生的真正原因,因而名為自發(fā)突變或自然突變(spontaneousmutation)。3、從長遠(yuǎn)的生物史看,進化過程是突變的不(二)只有基因型改變的突變形成DNA的多態(tài)性1、這種突變沒有可察覺的表型改變,例如在簡并密碼子上第三位堿基的改變,蛋白質(zhì)非功能區(qū)段上編碼序列的改變等。這些現(xiàn)象也相當(dāng)普遍。2、多態(tài)性(polymorphism)一詞用來描述個體之間的基因型差別現(xiàn)象。
(二)只有基因型改變的突變形成DNA的多態(tài)性1、這種突變沒有(三)致死性的突變可導(dǎo)致個體、細(xì)胞的死亡
(四)突變是某些疾病的發(fā)病基礎(chǔ)(三)致死性的突變可導(dǎo)致個體、細(xì)胞的死亡四、引起突變的分子改變類型有多種錯配(mismatch)缺失(deletion)插入(insertion)重排(rearrangement)
框移(frame-shift)
四、引起突變的分子改變類型有多種錯配(mismatch)框DNA分子上的堿基錯配稱點突變(pointmutation)。自發(fā)突變和不少化學(xué)誘變都能引起DNA上某一堿基的置換。點突變發(fā)生在基因的編碼區(qū),可導(dǎo)致氨基酸改變。
(一)錯配可導(dǎo)致編碼氨基酸的改變DNA分子上的堿基錯配稱點突變(pointmutation鐮形紅細(xì)胞貧血病人Hb(HbS)β亞基N-val
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GUA
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GUC……丙纈組纈正常5’……GAG
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UC……缺失C缺失引起框移突變:谷酪蛋(三)重組或重排常可引起遺傳、腫瘤等疾病1、DNA分子內(nèi)較大片段的交換,稱為重組或重排。2、移位的DNA可以在新位點上顛倒方向反置(倒位),也可以在染色體之間發(fā)生交換重組。(三)重組或重排常可引起遺傳、腫瘤等疾病1、DNA分子內(nèi)較大DNA損傷(突變)可能造成兩種結(jié)果:其一是導(dǎo)致復(fù)制或轉(zhuǎn)錄障礙(如胸腺嘧啶二聚體,DNA骨架中產(chǎn)生切口或斷裂);其二是導(dǎo)致復(fù)制后基因突變(如胞嘧啶自發(fā)脫氨基轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ笵NA序列發(fā)生永久性改變。所以,必須通過進化使細(xì)胞擁有靈敏的機制,以識別和修復(fù)這些損傷,否則細(xì)胞無法維持正常代謝。DNA損傷(突變)可能造成兩種結(jié)果:其一是導(dǎo)致復(fù)制或轉(zhuǎn)錄障礙
第三節(jié)DNA損傷修復(fù)
DNA損傷修復(fù)(repair):是對已發(fā)生分子改變的補償措施,使其盡可能回復(fù)為原有的天然狀態(tài)。修復(fù)的意義:保證DNA攜帶的遺傳信息能完全地忠實轉(zhuǎn)給子代、維持生物特征的穩(wěn)定性和完整性。DNA損傷修復(fù)(repair):一、DNA損傷的修復(fù)有多種類型錯配修復(fù)(mismatchrepair)直接修復(fù)(directrepair)光修復(fù)(lightrepairing)切除修復(fù)(excisionrepairing)重組修復(fù)(recombinationrepairing)SOS修復(fù)
一、DNA損傷的修復(fù)有多種類型錯配修復(fù)(mismatchr1、嘧啶二聚體的直接修復(fù)(lightrepair)這是一種廣泛存在的修復(fù)作用,能夠修復(fù)任何嘧啶二聚體的損傷。修復(fù)過程由光修復(fù)酶(photolyase)催化完成。一、有些DNA損傷可以直接修復(fù)1、嘧啶二聚體的直接修復(fù)(lightrepair)一、有些(一)直接修復(fù)系統(tǒng)利用酶簡單地逆轉(zhuǎn)DNA損傷光修復(fù)酶(photolyase)
UV(一)直接修復(fù)系統(tǒng)利用酶簡單地逆轉(zhuǎn)DNA損傷光修復(fù)酶(pho修復(fù)過程:⑴修復(fù)酶(photolyase)識別嘧啶二聚體并與之結(jié)合形成復(fù)合物;⑵在300~600nm可見光照射下,酶獲得能量,將嘧啶二聚體的丁酰環(huán)打開;⑶光修復(fù)酶從DNA上解離。修復(fù)過程:二、切除修復(fù)是最普遍的DNA損傷修復(fù)方式1、堿基切除修復(fù)2、核苷酸切除修復(fù)3、堿基錯配修復(fù)二、切除修復(fù)是最普遍的DNA損傷修復(fù)方式1、堿基切除修復(fù)
堿基切除修復(fù)依賴于生物體內(nèi)存在的一類特異的DNA糖基化酶。切除修復(fù)過程:(1)識別水解(2)切除(3)合成(4)連接1、堿基切除修復(fù)(baseexcisionrepair)堿基切除修復(fù)依賴于生物體內(nèi)存在的一類特異的DNADNA的損傷與修復(fù)講義課件(二)核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)識別DNA雙螺旋變形這是細(xì)胞內(nèi)最重要和有效的修復(fù)方式。其過程包括去除損傷的DNA,填補空隙和連接。主要由DNA-polⅠ和連接酶完成。(二)核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)識別DNA雙螺旋變形這是細(xì)胞內(nèi)最重要這也是一種廣泛存在的修復(fù)機制,可適用于多種DNA損傷的修復(fù)。切除修復(fù)機制的基本過程是將受損的DNA片段切除,然后再以對側(cè)鏈為模板,重新合成新鏈進行修復(fù)。由核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)負(fù)責(zé)進行修復(fù)。這也是一種廣泛存在的修復(fù)機制,可適用于多種DNA損傷的修復(fù)。切除修復(fù)系統(tǒng)步驟⑴核酸內(nèi)切酶UvrA、UvrB和UvrC蛋白識別損傷部位⑵UvrC將受損片段切除⑶DNApolⅠ填補缺口⑷連接酶封口UvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶ⅠOHPDNA連接酶ATP切除修復(fù)系統(tǒng)步驟UvrAUvrBUvrCOHPDNA聚合酶Ⅰ堿基丟失堿基缺陷或錯配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除DNA聚合酶DNA連接酶AP核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切開切除修復(fù)連接糖苷酶插入酶堿基取代堿基丟失堿基缺陷或錯配結(jié)構(gòu)缺陷切開核酸內(nèi)切酶核酸外切酶切除D
核苷酸切除修復(fù)不僅能夠修復(fù)整個基因組中的損傷,而且能拯救因轉(zhuǎn)錄模板鏈損傷而暫停轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶,即參與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)(transcription-coupledrepair)。轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)的意義在于,將修復(fù)酶集中于正在轉(zhuǎn)錄的DNA,使該區(qū)域的損傷盡快得以修復(fù)。核苷酸切除修復(fù)不僅能夠修復(fù)整個基因組中的損傷,錯配修復(fù)對DNA復(fù)制忠實性的貢獻力達102-103,DNA子鏈中的錯配幾乎完全都被修正,充分反映了母鏈的重要性。錯誤的堿基配對可以通過母鏈中識別標(biāo)記區(qū)分;標(biāo)記是GATC(回文結(jié)構(gòu))中A甲基化,E.coli中的3個蛋白質(zhì)(MutS、MutH和MutL)校正。該修復(fù)系統(tǒng)只校正新合成的DNA,因為新合成DNA鏈的GATC序列中的A(腺苷酸殘基)開始未被甲基化。GATC中A甲基化與否常用來區(qū)別新合成的鏈(未甲基化)和模板鏈(甲基化)。3、堿基錯配修復(fù)錯配修復(fù)對DNA復(fù)制忠實性的貢獻力達102-103,DNA子錯配修復(fù)系統(tǒng)作用機制:⑴MutS蛋白識別錯配的堿基;并吸引Mu
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