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文檔簡介
1、第一節臨床標本的處理一. 臨床標本處理的一般原則(一 )標本采集的時間和注意事項(二 )標本的類型和數量(三 )標本采集部位的準備(四 )標本的運送(五 )標本的保存(六 )標本處理中的生物安全問題二、常見臨床標本的處理方法(一 )血液標本. 全血標本.血清 (漿 )標本.外周血單個核細胞(二 )棉拭子(三 )體液標本(四 )痰液標本(五 )組織標本(六 )細胞標本第二節生物樣本分離純化與質量鑒定一、生物樣本分離純化策略、 DNA 的分離純化(一 )基因組DNA 的純化(二 )吸附柱法提取DNA(三 )質粒DNA 的分離純化(四 )線粒體DNA 的分離純化(五 )血漿中游離DNA 的分離純化.
2、 RNA 的分離純化(一)總 RNA 的制備(二) mRNA 的制備(三 )循環miRNA 的制備(四 )長鏈非編碼RNA 的制備四、自動化核酸提取系統五、蛋白質的分離純化(一 )蛋白質的性質與純化原則(二 )從細胞或組織中提取蛋白的常用方法. 根據蛋白分子大小不同分離純化.根據蛋白分子溶解度不同分離純化.根據蛋白表面電荷不同分離純化.采用配體的特異性親和力分離純化(三 )膜蛋白的分離與純化六、核酸和蛋白的鑒定(一 )核酸的鑒定. 核酸含量測定.核酸的純度鑒定.核酸的完整性檢測(二 )蛋白質的鑒定第一節臨床分子生物學檢驗技術的發展一.從分子生物學到臨床分子生物學檢驗二. 臨床分子生物學檢驗技術
3、的發展第二節臨床分子生物學檢驗技術應用一.病原生物基因組.菌種鑒定.確定病毒感染和病毒載量.病毒分析.細菌耐藥監測和分子流行病學調查二、基因變異.致病基因的分子缺陷.線粒體基因突變.腫瘤相關基因. DNA 重排形成融合基因三、基因多態性.基因定位和遺傳病相關性分析.藥物代謝酶與血藥濃度.疾病診斷和遺傳咨詢.多基因病的研究.器官移植配型和個體識別四、循環游離核酸.循環游離核酸與腫瘤.游離核酸與產前診斷.循環 microRNA 與腫瘤診斷第三節臨床分子生物學檢驗發展與應用. 臨床分子生物學檢驗與感染性疾病診斷與治療二、遺傳性疾病的臨床分子生物學檢驗三、腫瘤的臨床分子生物學檢驗四、臨床分子生物學檢驗
4、與個體化醫學第一節分子生物標志物的概念與分類一、生物標志物的概念與分類.分子生物標志物的概念與分類(一 ) DNA 生物標志物(二 ) RNA 生物標志物(三 )蛋白質生物標志物第二節核酸分子生 物標志物一、基因組和基因組特征(一 )原核生物基因組. 原核生物基因組特征.質粒(二 )病毒基因組. 基因組的堿基組成.基因組的核酸類型.基因組中有基因重疊現象.基因組中具有操縱子結構.病毒基因可連續也可間斷.基因組中重復序列少.基因組中非編碼區少.基因組是單倍體.相關基因叢集. 病毒基因組含有不規則結構基因(三 )人類基因組. 單一序列.重復序列.多基因家族和假基因二、基于基因突變的分子生物標志物(
5、一 )點突變錯義突變無義突變RNA 加工突變(二 )插入 / 缺失突變(三 )動態突變三、基于基因多態性的分子生物標志物(一 )限制性片段長度多態性(二 )小衛星和微衛星多態性(三 )單核苷酸多態性(四 )拷貝數多態性四、基于 DNA 甲基化修飾的分子生物標志物五.基于轉錄產物的分子生物標志物mRNA 標志物miRNA 標志物(三)長鏈非編碼RNA 標志物六、基于線粒體DNA 的分子生物標志物七、基于循環核酸的分子生物標志物(一 )循環腫瘤細胞DNA(二 )母體血清中的胎兒DNA(三 )循環DNA 的其他應用(四 )血漿RNA第三節分子生物標志物的發 現與評價一.高通量技術與分子生物標志物的發
6、現(一 )基因組學(二 )轉錄組學(三 )蛋白質組學(四 )代謝組學二、分子生物標志物的特征和評估(一 )分子生物標志物的特征(二 )分子生物標志物評估的基本統計學方法(三 )生物標志物的評價階段第一節核酸分子雜交的概念一.核酸探針(一 )核酸探針的種類DNA 探針RNA 探針寡核苷酸探針(二 )探針的長度.DNA 和 RNA 探針.寡核苷酸探針(三 )核酸探針的標記. 探針標記物的選擇.探針標記方法的選擇二、分子雜交信號檢測(一 )放射性標記探針檢測. 放射自顯影.液體閃爍計數法.(二 )非放射性標記探針的雜交檢測. 酶促顯色檢測.熒光檢測.化學發光檢測.多探針檢測第二節經典的核酸分子雜交技
7、術一、固相雜交(一 )反向點雜交1. 反向點雜交的原理2.反向點雜交法的應用(二 ) Southern 印跡雜交1.Southerm 印跡雜交的原理2.Southern 印跡雜交的應用(三 ) Northem 印跡雜交.Northerm 印跡雜交的原理.Northem 印跡雜交的應用二、液相雜交三、原位雜交第三節 DNA 芯片技術. DNA 芯片的概念、 DNA 芯片原理三, DNA 芯片技術(一 )芯片制備探針的設計載體選擇與預處理DNA 芯片制備(二 )樣品的制備四、雜交與結果分析. 雜交反應.雜交信號的檢測.數據分析五、 DNA 芯片在醫學中的應用1. 基因表達分析.基因型、基因突變和多態性分析.疾病診斷.藥物篩選.指導用藥及治療方案.預防醫學第四節影響雜交信號檢測的因素一.探針的選擇二、探針的標記方法三.探針的濃度四、雜交率五、雜交溫度六,雜交的嚴謹性七、雜交反應時間八、雜交促進劑第一節靶序列擴增一.PCR擴增技術(一)PCR技術原理及基本過程(二)PCR反應體系及擴增參數. 反應體系.擴增參數二、其他PCR技術,(一)多重 PCR(二)序列特異PCR(三)逆轉錄PCR(四 )巢式 PCR(五)轉錄依賴擴增系統(六)隨機引物PCR(七)全基因組擴增(八)微乳液擴增(九)錨定擴增(十)長片段PCR三、PCR產物分析(一)PCR-限制性片段長
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