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文檔簡介

1、生化復習資料(Lynx)生物化學名詞解釋及基本概念整理第一章蛋白質化學I基本概念1、 等電點(pI):使氨基酸離解成陽性離子和陰性離子的趨勢和程度相等,總帶電荷為零(呈電中性)時的溶液pH彳1.A溶液pH<pI,氨基酸帶正電荷,在電泳時向負極運動;B pH=pI,氨基酸所帶總電荷為零,在電泳時不移動;C pH>pI氨基酸帶負電荷,在電泳時向正極運動。2、 修飾氨基酸(稀有氨基酸):蛋白質合成后,氨基酸殘基的某些基團被修飾后形成的氨基酸。沒有相應的密碼子,如甲基化、乙酰化、羥基化、竣基化、磷酸化等。3、 肽鍵(peptide bond ):合成肽鏈時,前一個氨基酸的a 竣基與下一個氨

2、基酸的a 氨基通過脫水作用形成的酰胺鍵,具有部分雙鍵性質。4、 肽鍵平面(酰胺平面):參與肽鍵的六個原子位于同一平面,該平面稱為肽鍵平面。肽鍵平面不能自由轉動。5、 蛋白質結構:A一級結構:是指多肽鏈從N端到C端的氨基殘基種類、數量和順序。主要的化學鍵:肽鍵 ,二硫鍵。B二級結構:是指蛋白質分子中某一段肽鏈的局部空間結構,即蛋白質主鏈原子的局部空間排布(不涉及側鏈原子的位置)。分a-螺旋(-helix):較重要,為右手螺旋,每圈螺旋含 3.6個氨基酸殘基(13個原子),螺距為0.54nm、3片層(,折疊,-pleated sheet)、p-轉角(-turn 卜 無規貝U卷曲(randomcoi

3、l)、上螺旋(無-helix )。維持二級結構的化學鍵:氫鍵。模體:蛋白質分子中,二級結構單元有規則地聚集在一起形成混合或均有的空間構象,又稱超二級結構。C結構域:蛋白質三級結構中,折疊緊湊、可被分割成獨立的球狀或纖維狀,具有特定功能的 區域,稱為結構域。為構成三級結構的基本單元。D三級結構:是指整條多肽鏈中所有氨基酸殘基的相對空間位置(肽鏈上所有原子的相對空間位置).化學健:疏水鍵和氫鍵、離子鍵、范德華力等來維持其空間結構的相對穩定。E四級結構:蛋白質分子中幾條各具獨立三級結構的多肽鏈間相互結集和相互作用,排列形成 的更高層次的空間構象。作用力:亞基間以離子鍵、氫鍵、疏水力連接。此外,范德華

4、力、二 硫鍵(如抗體)。6、 分子伴侶:一類在序列上沒有相關性但有共同功能,在細胞中能夠幫助其他多肽鏈(或核酸)折疊或解折疊、組裝或分解的蛋白稱為分子伴侶。如熱休克蛋白。7、 一級結構是形成高級結構的分子基礎,蛋白質一級結構的改變,可能引起其功能的異常或喪失(“分子病”同功能蛋白質序列具有種屬差異與保守性。蛋白質分子的空間結構是其發揮生物學活性的基礎,蛋白質分子構象的改變影響生物學功能或 導致疾病的發生,蛋白質一級結構不變,但由于折疊錯誤,導致蛋白質構象改變而引起的疾病, 稱為蛋白質構象病(折疊病)。8、 蛋白質變性:在某些理化因素的作用下,特定的空間結構被破壞而導致其理化性質改變及生物活 性

5、喪失的過程。為非共價鍵和二硫鍵斷裂,物理(高溫、高壓、紫外線) ,化學(強酸堿、有機溶 齊心重金屬鹽)等因素導致。9、 20種AA名稱及縮寫:A 非極性疏水性 AA:甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、繳氨酸(Val)、亮氨酸(Leu)、異亮氨酸(Ile)、 苯丙氨酸(Phe)、脯氨酸(Pro)、蛋氨酸(Met)B 極性中性AA:色氨酸(Trp)、絲氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)、半胱氨酸(Cys)天冬酰胺(Asn)、 谷氨酰胺(Gln)、蘇氨酸(Thr)C 酸性AA:天冬氨酸(Asp)、谷氨酸(Glu)D 堿性AA:賴氨酸(Lys)、精氨酸(Arg)、組氨酸(His)E 芳香族AA:苯丙氨

6、酸(Phe)、色氨酸(Trp)、絲氨酸(Ser)10、 蛋白質理化性質:兩性電離及等電點(多接近 5.0,少數為堿性)、親水膠體性質(具有水化層、雙電層,保持其膠體穩定)、紫外吸收峰在280nm波長、顯色反應(苛三酮反應、雙縮月尿反應)。11、 蛋白質的分離純化:利用不同蛋白質分子的溶解性 (solubility )、分子大小(size)、帶電情況(charge)、親和能力等的不同將其提純。粗提:透析、鹽析、沉淀法等;7精提:層析法(凝膠過慮層析、離子交換層析、親和層析)、電泳法(蛋白質分子在高于或低于其pI的溶液中為帶電的顆粒,在電場中能向正極或負極移動,如薄膜電泳、SDSPAGE電泳、凝膠

7、電泳)、離心法(不同顆粒之間存在沉降系數差時,在一定離心力作用下,顆粒各自以一定速度沉降,在密度梯度不同區域上形成區帶的方法)o第二章酶1、 酶:一類由活細胞合成的、對其特異底物具有高效催化能力的蛋白質或核酸。2、 酶活性中心:酶分子中與底物結合并與催化活性直接有關的化學基團所構成的特殊空間區域,具底物結合位點和催化位點。3、 誘導契合學說:當底物與酶接近時,能誘導酶的構象發生有利于底物與之結合的變化,使酶與底物特異結合,催化反應的進行。4、 酶分類:氧化還原酶類、轉移酶類、水解酶類、裂解酶類、異構酶類、合成酶類。5、 輔助因子:分輔酶和輔基、輔酶與酶蛋白結合不緊密,輔基與酶蛋白結合牢固。6、

8、 酶促反應動力學:研究底物濃度、酶 E濃度、pH值、溫度、激活劑和抑制劑等因素對酶促反應速度影響。7、米-曼式方程:。Km (米氏常知等王酶黑應速時最大速度一半時的底物濃度,單位為mol/L.Vmax是酶完全被底物飽和時的反應速度,與酶杰度成正比|回7、 酶的轉換數:當酶被底物充分飽和時,單位時間內每個酶分子催化底物轉變為產物的分子數。用于比較 每單位酶的催化能力。8、 酶的抑制劑:能使酶活性下降而不引起酶蛋白變性的物質。分可逆性抑制和不可逆性抑制,可逆性抑制:抑制劑與酶通過不太穩定的非共價鍵結合,分競爭性抑制(均能與酶的底物中心結合,抑制作用的強弱取決于I與S的濃度比,增大底物濃度可解除抑制

9、作用,如丙二酸抑制琥珀酸脫氫酶)、非競爭性抑制(抑制劑與底物結合中心以外的位點結合,不可轉化為產物,增加底物濃度不能解除非競爭性抑制劑的抑制作用,磺胺類藥物抑菌作用)、反競爭性抑制(I只能與ES復合物結合生成 ESI后酶失去催化活性)。不可逆性抑制:抑制劑與酶的必需基團以共價鍵 (或非常穩定的非共價鍵)結合,如有機磷中毒及重金屬鹽中毒。KmVmax競爭性抑制增大不變非競爭性抑制不變減小反競爭性抑制減小減小Vmax是酶完全被底物飽和時的反應速度,與酶濃度成正比。Km等于酶促反應速度為最大速度一半時的底物濃度,單位為mol/L.12、 酶結構調節:通過對現有酶分子結構的影響來改變酶催化活性的調節方

10、式,為快速調節。形式:酶原激活、變構、共價修飾調控。酶原?活:無活性的酶原去掉一個或幾個特定肽鍵后轉變為有活性酶的過程。構象發生改變,活 性中心暴露或形成。酶的變構調節:調節物通過非共價鍵與酶分子上的調節位點結合,使酶的構象發生改變而調節 酶的活性。關鍵酶(限速酶):可以通過改變其催化活性而使整個代謝途徑的速度或方向發生改變的酶。共價修飾調控:酶分子上的某些基團在另一種酶的催化下發生可逆的共價修飾,從而引起酶活 性的改變。有(去)磷酸化,(去)尿甘酸化等形式。13、 同功酶:分子結構、底物親和力、抑制劑等不相同但催化相同化學反應的一組酶。14、 酶活力:酶催化一定化學反應的能力。15、 LDH

11、:乳酸脫氫酶,體內具五種形式,同功酶類。第三章維生素1、TPP(硫胺素焦磷酸卜FMN(黃素單核昔酸卜FAD僮素腺嗯吟二核昔酸卜NAD+ (尼克酰胺腺嗯吟二核音酸)、尼克酰胺腺嗯吟二核昔酸磷酸 (NAD?)、輔酶A(CoA-SH四氫葉酸(FH4)、磷酸叱哆醛(PLP)2、各種維生素簡介:化學名稱活性形式生理功能典型缺乏癥來源維生素AAi、A2、視黃醛、視黃酸視覺細胞中的感光成分、保護上皮細胞結構和功能的完整性、 抗氧化夜盲癥、干眼癥、皮膚干燥角質化肝臟、胡蘿卜、玉米維生素D1 , 25- ( OH )2-D3(D2)促進腸道對鈣的吸收、促進骨對鈣的吸收和沉積佝僂病、軟骨病肝、奶、蛋黃維生素E(生

12、育酚)原型重要的抗氧化劑、與動物生育有關、促進血紅素的合成小腦萎縮、貧血、不育小麥胚芽、葵花籽油、各種油料種子維生素KK1, K2 (天然)K3和K4 (合成)T -竣化酶(催化凝血因子Glu殘基竣化)的輔酶凝血障礙(雙香豆素為 Vk拮抗劑)K1-綠葉菜K2腸困合成維生素B1TPPa -酮酸氧化脫竣酶和轉酮醇酶等的輔酶腳氣病肝臟、瘦肉、種子的外皮、酵母維生素B2FMN、FAD黃素脫氫酶的輔酶,充當氫和電子 的傳遞體。口角炎、舌炎、口腔 (喉)潰瘍、眼睛充 血等。肝、腎、蛋、奶、酵母、蔬菜、青草維生素B3 (pp)NAD+、NADP+大多數脫氫酶的輔酶,參與氫的傳遞糙皮病(癩皮病,皮 炎)、癡呆

13、、腹瀉、色 素沉積等肝臟、心臟、腎臟、肉類、花生、 谷物的種皮、苜蓿草、色氨酸轉 化維生素B5CoA SH輔酶A是酰化酶的輔酶,是酰基的載體生長受阻,繁殖障礙肉類、谷類、蔬菜、酵母維生素B6PLR磷酸叱哆胺轉氨酶等氨基酸代謝酶類的輔酶,傳遞氨基、參與血紅素的合成、參與血紅蛋白的功能脂溢性皮炎、口角炎、神經系統機能障礙肉類、全谷食品、蔬菜、腸菌合成維生素B7 (生物素)生物素原型脂肪酸合成、糖異生等代謝過程中 的竣化酶的輔基脫屑性皮炎、禿頭癥、結膜炎、嗜睡及厭食等神經癥狀肝臟、蛋黃、葉菜、花菜、酵母維生素B9(葉酸)FH4一碳單位的載體,是一碳基團轉移酶的輔酶巨幼紅細胞性貧血內臟、蔬菜、酵母維生

14、素B12甲基鉆胺素、5'-脫氧腺普鉆胺素轉甲基酶的輔酶、參與分子內的重排巨幼紅細胞性貧血動物內臟、牛奶、蛋黃、微生物 制品(微生物能合成,動植物不 能)維生素C強還原劑,參與氧化還原反應、羥化酶的輔酶、有利于腸道中鐵的吸收壞血病、貧血第四章生物氧化1、氧化磷酸化:呼吸鏈中電子的傳遞過程偶聯ADP磷酸化,生成ATP的過程。底物磷酸化(次要方式):高能鍵斷裂偶聯ADP磷酸化為ATP(或GDP/GTP)的過程。偶聯部位:NADH與CoQ之間(復合體I)、CoQ與Cytc之間(復合體W)、Cytc 02之間(復合體IV)。化學滲透學說:電子沿呼吸鏈傳遞時,泵出H+形成跨膜電化學梯度,H+順電化

15、學梯度回流,釋放能量會偶聯ATP的生成。H+由ATP合成酶的Fo亞單位回流時才會偶聯 ATP的生成。影響磷酸化的因素:I抑制劑: a、呼吸鏈抑制劑:魚藤酮、粉蝶霉素 A、異戊巴比妥(復合體I);抗 霉素A (HI) ; CO CW、H2s (IV) o b、解偶聯劑:使H+不經ATP合酶的Fo回流,2,4-二硝基苯酚。c、氧 化磷酸化抑制劑:寡霉素。口 AD的調節作用;m 甲狀腺激素:誘導細胞膜上Na+, K+-ATP酶的生成,解 偶聯蛋白基因表達增加。2、呼吸鏈:代謝物脫下的氫原子通過多種酶所催化的連鎖反應逐步傳遞,最終與氧結合生成水的傳遞鏈,也叫電子傳遞鏈。A、遞氫體:傳遞氫的酶或輔酶,亦

16、可以作為電子傳遞體。B、電子傳遞體:傳遞電子的酶或輔基/輔酶。C、呼吸鏈組成:4種復合體、CoQ、Cytc組成兩條主要的呼吸鏈(NADH氧化呼吸鏈、琥珀酸氧 化呼吸鏈(FADH2氧化呼吸鏈)D、復合體組成:復合體I ( NADH-CoQ還原酶):是NADH + 4的電子進入呼吸鏈的入口,FMN為其輔基,傳遞途徑為NADHFMN, Fe-S CoQHh;復合體口(琥珀酸-輔酶Q還原酶),FAD為 其輔基,傳遞途徑為琥珀酸-FAD, Fe-S簇一CoQHh;復合體皿(CoQ-CytC還原酶)接受 CoQ 傳遞來的電子,并泵出 4個H+/2e,傳遞途徑為CoQH2-Cytb, Fe-S, Cytc1

17、 Cytc,血紅素為其 輔基;復合體IV ( Cytc氧化酶)將電子從 Cyt c傳遞給分子氧,催化分子氧還原為吐。,泵出2個H+ /2e , Fe- Cu中心等為其輔基,傳遞途徑為Cytc-CuA-Cyt aa3-CuB-O2。每傳遞一對電子,復合體I、皿、IV分別泵出 4、4、2個H+生化復習資料(Lynx)E、呼吸鏈組份排序確定:根據標準氧化還原電位的高低;檢測電子傳遞體氧化的順序;體外將呼吸鏈的各復合體進行拆分和重組;利用阻斷劑研究 分析。3、P/O比值:物質氧化時,每消耗1mol氧原子所消耗無機磷酸的mol 數。4、胞液中NADH+H+穿梭形式:a磷酸甘油穿梭(NADH+ H+-FA

18、DH2生成1.5molATP)、蘋果酸-天冬氨酸穿梭(NADH+H+-NADH+ H+生成2.5molATP)。第五章糖代謝1、糖酵解:通過一系列酶促反應將葡萄糖降解為丙酮酸的過程。(各組織器官的細胞液中均進行)能量:第一階段為15步,共消耗2molATP (1和3步)形成兩分子磷酸丙糖;第二階段為6 10步,共生成4molATP,均為底物水平磷酸化,由磷酸丙糖氧化為丙酮酸,6步發生一次氧化還原反應生成2分子NADH+H +。酶調節:a、第一步:己糖激酶(HK)肝臟中為葡萄糖激酶(GK):變構抑制劑為 G-6-P, GK則為F-6-P ;b、第三步:磷酸果糖激酶-I (PFK-I):變構抑制劑

19、為 ATP檸檬酸、H+,變構激活劑為 F-2,6-BP、AMPADPc、第十步:丙酮酸激酶:變構調節:抑制劑為ATP乙酰輔酶A、長FFA Ala(肝臟),激活劑為F-1 , 6-BP ; 共價修飾:磷酸化修飾活性降低。反應式: 葡萄糖+2ADP+ 2NAD+2Pi -2丙酮酸+2ATP+ 2NADH- 2HI+2H2O生理意義:糖有氧氧化的第一階段;缺氧時迅速提供能量;紅細胞僅以此途徑獲能;一些中間產物是氨基酸(如丙酮酸)、脂類(如磷酸二羥丙酮)等合成的前體2、丙酮酸還原為乳酸的意義:使NADH+1重新氧化為NAD,保證無氧條件下,糖酵解可以繼續進行。3、糖的有氧氧化:G -丙酮酸(胞漿)、丙

20、酮酸-乙酰輔酶 A (線粒體)、TCA循環(線粒體)、氧化磷酸 化(線粒體)。丙酮酸-乙酰輔酶 A:線粒體基質中進行,丙酮酸脫氫酶系催化(輔基及輔酶有TPP硫辛酸、FADNA6 CoA M/),總反應為:7+ HSCxjA + NAD*CH3CO - SCoA + NA1>H + H 1生化復習資料(Lynx)12三竣酸循環(TCA):生物體內糖類、脂肪和氨基酸等的氧化產物乙酰輔酶A與草酰乙酸縮合生成檸檬酸,檸檬酸再通過一系列氧化步驟產生CO2 NADH+儂FADH2并重新生成草酰乙酸,從而降解乙酰基并產生能量的代謝過程,在線粒體基質里完成。I 能量:乙酰 CoA+3NAl+FAD+GD

21、P+Pi+2H)CoA-SH+3(NADH+H+FADH+2CO+GTP一分子乙酰CoA徹底氧化所生成的能量為 10ATP,一分子G徹底氧化產生的總ATP為3032,口酶調節:a、丙酮酸脫氫酶系:變構調節抑制劑為ATR乙酰輔酶A、NADH激活劑為AMP共價修飾磷酸化失活。b、檸檬酸合成酶:變構抑制劑為檸檬酸、NADH琥珀酰CoA抑制劑為ADPc、異檸檬酸脫氫酶:變構抑制劑為 ATP NADH琥珀酰CoA激活劑為ADP NAa Ca"d、a-酮戊二酸脫氫酶系: 變構抑制劑為ATP NADH琥珀酰CoA,激活劑為ADP NAD、 Ca2+m生理意義:氧化供能;糖、脂、蛋白質等徹底氧化分解

22、的共有途徑;中間代謝物是許多生物合成的 前體物。4、巴斯德(Pasteur )效應:在有氧的條件下,糖的有氧氧化抑制無氧酵解的現象。反Pasteur效應:在某些代謝旺盛的正常組織或腫瘤細胞中,即使在有氧的條件下,仍然以糖的無氧酵 解為產生ATP的主要方式的現象。5、磷酸戊糖途徑:G-6-P經一系列反應生成 NADPH+H口 5-磷酸核糖,并完成三碳、四碳、五碳、六碳、七 碳糖轉換的代謝途徑,在胞漿進行。分氧化階段(G-6-P氧化為5-磷酸核酮糖,生成2NADPHH)和非氧化階段(生成 5-磷酸核糖,完成 5C/3C/7C/4C/6c糖的相互轉換,利用轉醛醇酶和轉酮醇酶)。生理意義:提供生物合成

23、的原料(戊糖和NADPH;為細胞提供還原態的環境:NADPK谷胱甘肽還原酶的輔酶;為戊糖的利用及 3c (甘油醛-3-磷酸)、4G 5G 6C (F-6-P)、7c糖互相轉換提供通路。G或糖原的過程稱為糖異A轉化為丙酮酸)。1ATP,在線粒體進行;6、糖異生作用:由非糖物質(生糖氨基酸、甘油、乳酸、丙酮酸、丙酸等)合成 生,反應器官主要在肝臟、腎臟,反應場所為線粒體及胞漿(動物不能將乙酰輔酶 反應途徑:糖異生并不是糖酵解的逆轉,但多數反應相同,I丙酮酸-草酰乙酸-PEP:第一步以丙酮酸竣化酶(生物素)催化,消耗 第二步以PEP竣激酶催化,消耗1GTP在線粒體及胞漿進行。UF-1 , 6-BP

24、-F-6-P :果糖-1 , 6-二磷酸酶,消耗 1ATRWG-6-PfG:葡萄糖-6-磷酸酶,消耗1ATR 反應式:2丙酮酸+4ATP+ 2GT巴2NADH- 2H+ +4H28葡萄糖+4ADP+ 2GDP 6Pi+2NAD+,共消耗 6ATP和 2NADH+ H 生理意義:饑餓時維持血糖濃度的相對恒定(主要);乳酸再利用;降低原尿的H+,緩解酸中毒(腎臟);反芻動物血糖的主要來源:丙酸異生為葡萄糖。7、糖原合成與分解:糖原合成:由G合成糖原的過程,糖原為帶有分枝的高分子葡萄糖聚合物,化學鍵形式有«-1, 4糖昔鍵、a 1, 6糖昔鍵。主要在肝臟和肌肉的胞漿中合成。I反應途徑: G

25、-G-6-P-G-1-P+UT- UDP-G(尿昔二磷酸葡萄糖) +糖原(n)-糖原(n+1)+UDP, 最后一步以糖原合酶催化,UDP-G為G殘基供體,每加一個 G殘基,消耗2ATP.糖原合酶:僅催化鏈的延伸,形成 a 1, 4糖昔鍵,不催化其從頭合成。糖原的分支以糖原分支酶催化,分支處為a 1, 6糖昔鍵。糖原降解:糖原(n)+Pi -糖原(n-1)+ G-1-P ,由糖原磷酸化酶催化,僅作用于a 1, 4糖昔鍵,還有糖原脫支酶。G-1-P-G-6-P-G (葡萄糖-6-磷酸酶催化,肌肉中無此酶,G-6-P直接進入糖酵解,肝腎中可形成G) 酶的調節:I糖原磷酸化酶:原理:磷酸化活性高,去磷

26、酸化活性降低;共價修飾:腎上腺激素和胰高血糖素升高,活性增強;變構調節:肌肉中激活劑為AMP抑制劑為ATP、G-6-P;肝臟中抑制劑為G.口糖原合成酶:原理:磷酸化活性低,去磷酸化活性增高;共價修飾:腎上腺激素降低其活性;變構調節:激活劑為G-6-P o8、共有的代謝產物:主要的為乙酰輔酶 A,G-6-P,在糖的循環中較為重要,乙酰輔酶A在脂肪代謝中也有利用,將脂肪代謝和糖代謝相互聯系,另外a-酮戊二酸在核昔酸代謝中有重要作用,與糖代謝相互聯系。第六章脂肪代謝1、0氧化:脂肪酸氧化時,每次脂酰基竣基端0 C被氧化為酮基,然后裂解一分子的乙酰輔酶A,因此脂肪酸的氧化稱為 0 -氧化。2、脂類:脂

27、肪及類脂、衍生脂類的總稱,其主要功能有:細胞的結構成分;能量的貯存形式;生理調節作用,如激素(性激素)、第二信使(甘油二酯);共價修飾蛋白質;保溫作用;物質運輸和消化相關;調節 機體密度。3、脂肪酸的合成與氧化分解:I合成:在肝、脂肪、乳腺、腦等的胞液中,原料為乙酰 CoA NADPH+H,產物主要以C6飽和脂肪酸為 主a、乙酰CoA由線粒體轉運進胞液中,利用檸檬酸丙酮酸轉運系統共消耗2ATP和2NADPH+Hb 、合成過程及能量消耗:乙酰 CoQ丙二酸單酰CoA,乙酰CoA竣化酶進行催化,消耗 1ATP,生成一 分子16c的棕桐酸需要8分子乙酰CoA (7分子轉化為丙二酸單酰 CoA, (8

28、-16+7) ATP, 14NADPH+R合成過程中利用脂肪酸合酶進行催化,哺乳類中共有7種酶活性,酰基載體蛋白(ACP為其中一種,較為重要。合成過程中重復縮合、加氫、脫水、加氫的合成過程,每重復一次,增加一個二碳單位。c、合成調節:乙酰CoA竣化酶:變構調節:激活劑為檸檬酸、異檸檬酸,抑制劑為脂酰 CoA棕桐酰CoA; 共價調節:其磷酸化時活性降低,如胰島素可以使其去磷酸化活性增高,胰高血糖素、腎上腺素和生長激素使其磷酸化,活性降低,與糖原合酶的共價調節類似;誘導調節:調節乙酰CoA竣化酶合成。口氧化分解:活化:脂肪酸-脂酰CoA,在胞漿中進彳共消耗 2ATP,由脂酰CoA合成酶催化。脂酰C

29、oA的轉運:進入線粒體,由肉堿進行攜帶,肉堿脂酰轉移酶(I、口)及肉堿-脂酰肉堿轉位酶催化。脂肪酸的0氧化:線粒體中進行,產物為乙酰輔酶A, FADH,NADH+R重復脫氫水化再脫氫硫解過程,逐步生成乙酰輔酶 A,如16C則0氧化7次,生成7FADH, 7NADH- H+,酮體:脂酸在肝分解氧化時特有的中間代謝物(乙酰乙酸、0-羥丁酸和丙酮),生成部位主要在肝的線粒體基質中,原料為來自脂肪酸氧化的乙酰輔酶Ao酮體在肝內生成,在肝外組織(線粒體中)利用,均為糖異生或TCA循環的原料如乙酰乙酸一乙酰輔酶A丙酮-丙酮酸或乳酸、0-羥丁酸-乙酰乙酸。生理意義:酮體是肝輸出能源的一種形式;是肌肉、腦組織

30、在饑餓等狀態下的重要能源。4、甘油三酯的合成與分解:以甘油和乙酰輔酶 A為材料,在肝臟及脂肪組織(甘油二脂途徑)中或小腸黏膜細胞(甘油一酯途徑)合成。甘油三酯的水解發生在脂肪細胞的胞漿中,分解成為甘油和脂肪酸(FFA), FFA由載脂蛋白經過血漿進行運輸,激素敏感酯酶(HSD為其限速酶。調節:經共價修飾調節,磷酸化活性升高,胰高血糖素、腎上腺素、去甲腎上腺素、腎上腺皮質激素 和甲狀腺素等可通過第二信使使其活性升高,胰島素和前列腺素使其活性降低。甘油去向:直接運至肝、腎、腸等組織。主要在肝、腎進行糖異生,脂肪細胞及骨骼肌等組織因甘油 激酶活性很低,故不能很好利用甘油。5、甘油磷脂:由甘油、脂酸、

31、磷酸及含氮化合物等(如絲氨酸)組成。主要作用有構成生物膜脂質雙分子 層;乳化劑,促進脂類的消化吸收與轉運。其合成主要在肝腎腸的滑面內質網上,途徑有CDP甘油二酯途徑和甘油二酯途徑,可在多種磷脂酶(PL) 作用下水解。6、膽固醇:主要肝臟(占80%,其次是小腸粘膜上皮、皮膚的胞漿和內質網上以乙酰CoA NADPH+H ATP為原料合成。HMGCo必原酶(羥甲基戊二酸單酰 CoA是限速酶,膽固醇在體內可以轉化為類固醇激素、7-脫氫膽固醇或膽汁酸,亦可組成膜結構。7、脂蛋白:載脂蛋白與脂類以非共價鍵形成的球狀復合物 。分四種乳糜微粒 CM(運輸外源性甘油三酯及 膽固醇)、極低密度脂蛋白 VLDL (

32、運輸內源性甘油三酯及膽固醇)、低密度脂蛋白LDL (運輸內源性膽固醇 回肝臟或至肝外組織 )、高密度脂蛋白HDL (肝外組織的膽固醇運回肝臟)。第七章氨基酸代謝1、來源與去路:生化復習資料(Lynx)25食物蛋白質尿素一氨酮體收合成組織蛋白質分解體內合成氨基酸(非必需aa)氨基酸代謝庫代1變其它含氮化合物 (噂吟、喀咤等)胺類EAA指必需氨基酸,體內不能合成,Lys、Met、Trp、Val、Leu、Ile、Thr、Phe His、Arg, Tyr 和 Cys為條件必需AA2、AA的脫氨基作用:有轉氨基、氧化脫氨基、聯合脫氨基、非氧化脫氨基等方式。I轉氨基作用:在轉氨酶催化下,-氨基酸的氨基轉移

33、到 -酮酸的酮基上,生成另一種氨基酸和另一種-酮酸的過程。體內最為重要的兩種轉氨酶為谷丙轉氨酶( GPT肝中活性最強)和谷草轉氨酶( GOT心臟中活性最強)。意義:動物體合成非必氨基、聯系糖代謝與氨基酸代謝的橋梁。口氧化脫氨基作用: 關鍵酶有L-氨基酸氧化酶(輔基 FMN、D-氨基酸氧化酶(輔基 FAD)o主要為L-谷氨酸的氧化脫氨,反應場所主要為肝臟的線粒體基質中,L-谷氨酸+HM -酮戊二酸+NH+NADH(NADPH +H+o關鍵酶為L-谷氨酸脫氫酶,變構抑制劑為 GTP、 ATP,激活劑為ADP GDPW聯合脫氨基作用: 氨基酸的氨基經轉氨基作用轉移給-酮戊二酸生成L-谷氨酸,L-谷氨

34、酸再經氧化脫氨基作用生成-酮戊二酸和游離氨的過程。反應主要在肝臟的線粒體基質中進行。在骨骼肌中進行喋吟 核昔酸循環,快速利用 AA,其中有次黃嗯吟核昔酸(IMP)的參與。3、AA脫竣:氨基酸脫竣酶的輔酶為 PLP,脫竣形成相應的胺,體內的胺有-氨基丁酸(GABA、牛磺酸、 組胺、5-羥色胺(5-HT)等,為體內生理活性物質。4、氨的代謝:體內氨的來源主要為 AA脫氨作用,去路:在肝臟內可進行生物合成或合成尿素;肝外組織中可進行生物合成或者轉運入肝形成尿素或進入腎臟形成鏤鹽。12肝外組織產生的NH主要是以無毒的谷氨酰胺 (Gln:腦和肌肉中,Glu結合氨形成Gln ,在轉運到肝及 腎中)及丙氨酸

35、(Ala :骨骼肌中進行)兩種形式運輸到肝臟或腎臟。5、尿素形成(鳥氨酸循環):主要發生在肝臟的線粒體及胞液中,過程:NH-氨甲酰磷酸+鳥A瓜AA+As廠精氨酸代琥珀酸- Arg ( +延胡索酸)-尿素+鳥AA繼續循環。總反應:CO+NH+3ATP+AS葉2Ho尿素+2AD巴2Pi+AMP+PP延胡索酸。共消耗 4個高能磷酸鍵,Asp 是氨的中間傳遞體,延胡索酸和Asp將尿素循環和TCA聯系起來。尿素分子中一個N來自于NH,另一個來 自于Asp。調節:第一步反應的酶為氨甲酰磷酸合成酶-I (CPS-I)。第三步酶為精氨酸代琥珀酸合成酶。(高血氨癥)6、動物體氨基酸的合成:a酮酸氨基化: Ala

36、 :丙酮酸;Asp (Asn):草酰乙酸;Glu (Gln): a 一酮戊二酸;其他 AA轉化:Gly : Ser; Cys: Ser 與 Met; Pro:Glu ; Tyr: Phe ;尿素循環:Arg。7碳單位:某些氨基酸(Ser、Gly、His和Trp、Met)在分解代謝過程中產生的含有一個碳原子的基團,如-CH、-Cd-、-CHO四氫葉酸(FH4) 一碳基團轉移酶的輔酶,是一碳單位的載體;功能部位是N5和N10。生理功能:合成嗤吟卻噬唾等的原料、為體內的甲基化反應間接提供甲基。8、芳香族AA代謝:包括Phe Tyr、Trp (色AA),主要在肝臟中代謝。Tyr代謝可產生兒茶酚胺類物質

37、, 酪氨酸羥化酶為其合成的限速酶(缺乏得白化病),Phe代謝產生苯丙酮酸(苯丙酮酸尿癥PUK, Trp代謝合成褪黑素及5-羥色胺。第八章核甘酸代謝1、核昔酸:是核酸的構件分子,有核糖、堿基及磷酸三個組成成分,紫外吸收(260nm)。生物學功能:核酸的基本組成單位;參與能量的轉移:ATP/GTP/UTP第二信使:cAMP和cGMP是重要物質(如輔酶、SAM等)的構成成分;某些核音酸的衍生物是多種生物合成過程的活性中間物質:UDP葡萄糖和CDP-甘油二酯。2、嗯吟核昔酸的從頭合成途徑:利用簡單的前體分子合成核音酸的途徑,在肝、小腸、胸腺等的胞液中合成。先合成IMP,再以IMP合成AMPW GMP

38、IMP的合成是在磷酸核糖的基礎上合成嗯吟環。CO、Asp, 合成原料:R-5-P、Gln、Gly、N10-甲酰四氫葉酸、消耗ATP. 簡單過程:R-5-P轉化為PRPP循化),磷酸核糖焦磷酸合成酶催化該反應,再以PRP兩基礎進行合成IMP。共消耗1分子PRPP 2分子谷氨酰胺、1分子甘氨酸、1分 子天冬氨酸和1分子CO和2個甲酰基(N10甲酰四氫葉酸),消耗了 7分子ATR關鍵酶為PRPP酰胺轉移酶(變構酶)。 AM麗GMP勺生成:IMP+As尸腺昔酸彳琥珀酸(AMPS尸延胡索酸+AMP第一步由AMP總成酶催化,第二步由 AMPSS解酶催化,消耗1GTPIMP-黃嗯吟核昔酸(XMP -GMP第

39、一步由IMP脫氫酶催化,生成 1NADH+H第二步由GM哈成酶催 化,消耗2ATP.合成特點:PRP吃5-磷酸核糖的活性供體;喋吟核甘酸是在磷酸核糖分子上逐步合成喋吟環的;先合 成IMP ,再轉變成AMP或GMP調節:主要受反饋抑制調節。PRPP合成酶:受變構調節(嗯吟核昔酸和嗑咤核昔酸為其抑制劑);PRPP酰胺轉移酶:受變構調節(抑制劑: IMP /AMP /GMP,激活劑:PRPP)3、嗯吟核昔酸的補救合成:堿基與PRPPt接合成。腺嗯吟 +PRPP> AMP+PP i次黃嗯吟(或鳥嗯吟)+PRPP> IMP (GMP)次黃嗯吟-鳥嗯吟磷酸核糖轉移酶 (HGPRT進行催化。HG

40、PRT 不足時為高尿酸尿癥和高尿酸血癥,完全缺乏時為自毀容貌癥。4、嗑咤核昔酸的從頭合成:特點:先合成嗑咤環,再與磷酸核糖連接。原料:Gln、HCO-、Asp、PRPR過程:先合成UMP(氨甲酰磷酸合成酶口為該反應的限速酶,UMM其抑制劑),再以UTP合成CTP(是以UM唯三磷酸水平上轉化而來的 UMP>UTP消耗2ATP,UTP+Gln CTP+Glu,消耗1ATP),以dUMP 成 dTMR5、嗑咤核昔酸的補救合成:尿嗑咤+PRPA UMP- PPi6、補救合成的意義: 簡單,消耗ATP少,節省AA;腦主要以補救合成途徑合成核昔酸。7、脫氧核糖核甘酸的合成:由相應的NDP(二磷酸水平

41、)還原生成(除dTMP,NDPdNDP消耗1NADPH旬核糖核普酸還原酶(RR)催化該反應進行,受變構調節:激活劑為ATP抑制劑為dATR dTTP、dCTRdTMP的生成是在脫氧一磷酸水平上進行的,以dUMPt接合成或補救合成。8、核昔酸合成的抗代謝物:堿基類似物:6-疏基嗯吟(IMP的類似物)競爭抑制 HGPRT抑制嗯吟核昔酸的補救合成途徑,可用作 抗癌藥物;5-氟尿嗑咤抑制dTMP的合成;氨基酸類似物:氮雜絲氨酸(Gln類似物)抑制嗯吟核昔酸的從頭合成途徑;抑制UM吸CTP的合成;葉酸類似物:葉酸還原酶和二氫葉酸還原酶的抑制劑,可做抗腫瘤藥物;核昔酸類似物:如阿糖胞昔(胞昔類似物),抑制

42、CD好原為dCDP9、嗯吟核昔酸的分解代謝:終產物為尿酸,疾病有腺普脫氨酶(ADA基因缺陷,導致重癥聯合免疫缺陷病;痛風癥。10、嗑咤核昔酸的分解代謝:終產物為嗑咤堿。第十章核酸的化學1、核酸:核酸是由核昔酸通過 3"5"-磷酸二酯鍵聚合而成的生物大分子,包括DN所口 RNA 2、 DNA與RNA的區另業組成結構生物學功能DNA脫氧核糖核甘酸1) 一級結構:DNA分子的核昔酸組成和連2) 接順序,以3"5 " -磷酸二酯鍵連接,5' -P,3 ' -OH, 通常由5 ' -3 '方向寫;3) DNA的二級結構:兩條脫氧多核

43、昔酸鏈反向平行盤繞所形成的雙螺旋結構;4) DNA的三級結構:DNAg旋雙鏈進一步扭曲盤旋形成的超螺旋結構,雙鏈環狀DN砌子和線性 DNA大分子易形成超螺旋結構;1) 多數生物的遺傳物質2) 是遺傳信息的載體,通過基因表達決定蛋白質的結構和功能5) 染色質:真核細胞核內,DNA分子被蛋白質包裝形成的高度壓縮結構,是真核生物DNA的高級結構,在細胞周期不同時期壓縮程度及形態不同。RNA核糖核甘酸1) 一級結構:單鏈分子2) 二級結構:多單鏈,局部形成雙螺旋結構(發卡或莖環,如tRNA)3) 三級結構:二級結構進一步折疊形成4) 四級結構:RNA與蛋白質相結合(如rRNAO1)是一些病毒的遺傳物質

44、;2)mRNA遺傳信息的中間載體;tRNA:轉運氨基酸,識別密碼子;rRNA:蛋白質合成的場所3)某些RNAM有催化作用:核酶4) 一些小分子RN砥與基因表達的調控(如microRNA)3、B型DNA螺旋結構模型要點:1) 兩條鏈反向平行,圍繞同一中心軸構成右手雙螺旋。2) 螺旋表面有大溝和一個小溝;3) 每圈螺旋含10個堿基對(bp),螺旋直徑2nm,螺距為3.4nm;4) 磷酸-脫氧核糖骨架位于螺旋外側;堿基平面伸入內側,與縱軸垂直;糖環平面與縱軸平行;5) 兩條單鏈通過堿基間的氫鍵相連,A與T配對,形成兩個氫鍵,C對G配對,形成三個氫鍵;6) 影響雙螺旋穩定的作用力:堿基堆積力、氫鍵、疏

45、水相互作用和靜電排斥力。4、DNA堿基組成的Chargaff法則:1) DNA勺堿基組成具有種屬特異性;2) DNA勺堿基組成無組織和器官特異性,組成穩定;3) 一種生物DNA的堿基組成不受年齡、環境和營養等的影響;4) 堿基配對遵循當量規律:所有雙鏈DNA分子中,A= T, G= C (摩爾數相等),A+ G= T+ C。5、染色質的基本包裝單位 -核小體:DNA組蛋白的復合體,也叫 10nm纖維,為念珠狀結構。由核心顆粒(由8聚體蛋白質復合體H2A、H2B H3和H4各2個與纏繞在蛋白質8聚體上的146bp DNA構成)、連接DNA 1分子H1構成。6、基因(gene):編碼某一多肽鏈或

46、RN頌必需的全部核昔酸序列。基因組(genom6 : 一個生物所攜帶的遺傳信息總和。包括:核基因組(單倍體細胞核內的全部DNA分子)線粒體基因組(線粒體內的單個DNA分子)葉綠體基因組(葉綠體內的單個DNA分子)7、tRNA轉運氨基酸的一類 RNA約占總 RNA勺15%結構特點:1) 一級:共70 95個核昔酸殘基;約10%勺堿基為修飾堿基;3'-末端都具有-CCA-OH的結構。2) 二級:四臂五環,AA臂3'-末端為一CCA-OH攜帶AA反密碼環:7個堿基組成,正中的 3個核昔酸 殘基為反密碼子。3) 三級:倒L型8、mRNA占總RNA的1 %5%,是蛋白質生物合成(翻譯)的

47、模板。一級結構特點:1) 原核生物:多順反子(一個 mRN粉子往往含有幾個功能上相關蛋白質的編碼序列),分子大小不一;2) 真核生物:為單順反子(一個 mRN冊子只編碼一條多肽鏈),5'端有帽子結構,3'端有poly (A)尾。9、rRNA占總RNA的80%fc右,與幾十種蛋白質一起形成核糖體:蛋白質合成的場所。原核生物:5S、16S 和 23S rRNA;真核生物:5S、5.8S、18S 和 28S rRNA10、核酸的性質:具有兩性性質,等電點為酸性。11、DNA變性:在溫度升高、極端pH值、變性劑等條件下,DNA雙鏈中的氫鍵被破壞,兩條單鏈部分或全部分開。Tm為溶解溫度,

48、一般在 70-85 0Co增色效應:DNAft變性后,紫外吸收值增加的現象。12、DNA復性:在變性條件消除后,兩條彼此分開的單鏈可以重新形成雙螺旋DNA勺過程。退火:熱變性的DNAft溶液冷卻后的復性。減色效應:DNAft復性后,紫外吸收值降低的現象。影響因素:溫度、濃度、堿基組成、片段大小。13、核算雜交:具有互補序列的不同來源的兩條單鏈核酸分子,按堿基配對原則結合在一起形成雙鏈分子稱為雜交(hybridization ),有 DNA-DNA RNA-RNA DNV RNA十一章核酸的生物合成1、DNA復制:以一個親代DN砌子為模板合成兩個子代 DN砌子的過程。1) 一般原則:半保留復制(

49、以母鏈為模板合成的子代 DNA分子,其一條鏈是來自親代的 DNA1,另一條 鏈是新合成的鏈,指導互補鏈合成的DNA稱為模板鏈,也叫做無意義鏈);復制是起始于起始位點的雙向復 制(復制叉:DNAM制時,親代DNA解旋,DN項鏈合成的部位形成的 丫形結構);半不連續復制(DNA的 合成是5-f3,方向的聚合; 前導鏈:復制叉處,以親代DN份子的3' -5'鏈為模板的新鏈以 5' -3' 方向連續合成的DNA鏈;在復制叉處以5' -3'鏈為模板的新鏈合成方向與模板的解鏈方向相反,該鏈的 合成以不連續方式一段一段合成,短片稱為崗崎片段,這條不連續合成的新

50、鏈為 滯后鏈);DNA的合成消耗能量(聚合:dNTP+(dNMP)-(dNMP,i+PPi);2) 原核生物DNA的復制:I參與DN砧成的主要物質: 底物:dNTPs,模板:親代DNA#子,酶及蛋白類:酶及蛋白類酶及蛋白功能DNA聚合酶特點DNA聚合酶(依束D DNA的DN課合酶)DNA poll :參與切去滯后鏈上的 RNA引物,并聚合核昔酸;DNA修復;需要模板、需要引物、校讀功能有 3' -5'外切活性、5, -3,方向 聚合DNA pol II : DNA修復;DNA pollll :復制叉處DNA勺復制,活性最高。DnaA蛋白識別復制起始點(Oric )的特殊序列并與

51、之結合解旋酶(DnaB)使DNA的兩條互補鏈分離DnaC協助DnaB結合在起始點并打開雙鏈DNAffi撲異構酶除去超螺旋,克服雙鏈解鏈時形成的緊密扭結現象單鏈DNA結合蛋白(SSB)穩定DN鏈引物酶催化RNA引物的合成滑動鉗使DNA聚合酶穩定在模板上RNAse H酶切RNA引物DN上接酶連接缺口,在崗崎片段的連接、DNA的修復和DNA1組中,DNA連接酶都是不可缺少的。口復制過程:a) 起始:復制是在基因組中特殊序列開始的,該特殊序列為復制的起始點,原核生物染色體、病毒和核外DNA只有一個復制起始點。DnaA識別和結合起始點,并使之解鏈-合成RN閱物(解旋酶、引物酶參與)-引物被 DNA po

52、l HI識別,前導鏈開始合成-解鏈至1kb左右,2條滯后鏈的模板指導合成引物,滯后鏈的合成起始b) 延伸:解旋酶、拓撲異構酶、SSB引物酶、DNA1合酶、連接酶等參與。前導鏈合成:邊解鏈邊聚合。滯后鏈延伸:合成引物-合成崗崎片段(DN課合酶III )-切除引物(RNAse H和DNA poll )-缺口平移(DNA pol I )-連接崗崎片段(DNA接酶)。c) 終止:具有終止區(Ter)(順時針復制叉陷阱和反時針復制叉陷阱),Ter+終止子利用物質(Tus)形成復合物,阻止解旋,僅阻斷一個方向的復制叉,當兩個復制叉相遇時,DNA復制終止。d) 子代DNA分離:DN隔撲異構酶IV。3)真核生

53、物的DNA1制J: DN課合酶“、0、丫、6和£I特點及參與物質: 多復制起點、復制起始點比原核生物短,結合速度較慢。有DNA聚合酶a (引物酶活性)、DNA聚合酶S (解旋酶活性)、拓撲酶、復制因子 RF等參與。起始:G1期形成前復制復合物,(G1) -S期形成活性的復制叉,復制起始。W終止:端粒:線性染色體的兩個末端,維持染色體的穩定性,短序列(TG豐富)的串聯重復。端粒酶:蛋白質和 RNAS成,含逆轉錄酶(依賴 RNA的DNA聚合酶),RNA( 450bases ,其中-AAUCCCAAU- 為合成端粒-TTAGGG的模板)o4) DNA損傷和修復:復制時的錯配、自發、環境因素

54、(化學誘變劑、紫外輻射、電離輻射)可以引發。、喋吟核甘酸殘基自發DNA損傷形式:形成胸腺嗑咤二聚體(輻射)、胞嗑咤脫氨-尿嗑咤(亞硝酸鹽)脫喋吟、缺失和插入、重排。修復方式:光修復、切除修復、重組修復、sosa復。2、RNA的生物合成I轉錄:以DNNJ模板合成RNA分子的過程口與DNAM制的區別:原料為NTP;是基因序列的轉錄;可連續轉錄多copy;不需要引物;只有一條鏈作為模板;轉錄的精確性低。W原核生物RNA的合成:a) 參與物質:RNA1合酶(細菌只有一種RNA聚合酶”200' w a,a亞基識別啟動子,無 3 ' -5'外切酶活性,所以轉錄保真性不高)。功能:D

55、NA勺解鏈、聚合核昔酸,形成 3' -5'磷酸二酯鍵、校正功能、 DNA1的復性、RNA鏈從模板上釋 放。b) 啟動子:基因轉錄起始區域內與 RNA1合酶結合并起始轉錄的一段DNAf列,具兩個高度保守 DNAf列,與聚合酶的b相互作用的部位。c) 起始:RNA1合酶(b亞基)識別并結合啟動子,形成封閉式復合體-聚合酶構象改變,-10區的序列解鏈,形成開放性復合體,轉錄開始-啟動子逃逸,b脫離全酶, 聚合酶離開啟動子區。d) 延伸:RNA1合酶沿DNA鏈移動,聚合核昔酸,進入轉錄延伸階段。e) 終止:至轉錄終止子序列時, RNA- DNAfe和體分離,DNA恢復為雙鏈,RNA聚合酶、RNA鏈從DNMI板上釋放出來。機制:不依賴p因子的終止(兩個特殊序列:自我互補序列,可形成發卡;高度保守的48A序列):發卡的形成能斷裂A=U堿基對,破壞RNA與模板、RNA聚合酶之間的相互作用,導致轉錄復合體的解體而終止 轉錄。依賴P因子的終止: 終止序列富含CA的序列,p因子和 RNA±的特殊位點(rut位點)結合,并滑行至終 止序列,使RNA釋放出來。IV真核生物RNA的合成: a) RNA聚合酶:RNA pol I ( rRNA合成)、RNA pol 口(

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