1、生命科學資源運用與探討生命科學資源運用與探討 BIOSIS Previews美國美國 BIOSIS 公司東南亞地區代表公司東南亞地區代表飛資得信息有限公司飛資得信息有限公司 梁銘心梁銘心主要內容主要內容BIOSIS Previews簡介簡介OVID版版 BIOSIS Previews檢索模式檢索模式常用檢索方法與技巧常用檢索方法與技巧檢索策略的保存、運行與刪除檢索策略的保存、運行與刪除檢索結果顯示設計、輸出檢索結果顯示設計、輸出第一部分第一部分BIOSIS Previews 簡簡介介Life ScienceBiologyMedicineChemistryTechnologyLife Scien

2、ce Researchn研究主題nBiology, Medicine, Chemistryn研究型式nJournals, Books, Gray Literature (Reviews, Reports, Meetings), Patentsn出版類型nDigit, PrintAbout BIOSIS BIOSIS成立于公元1926年，總部設在美國費城 “提供生命科學知識，促進生命科學發展”，為 BIOSIS 公司的成立宗旨和使命 2004 年正式與加入 Thomson 集團公司Life Science Solutions of BIOSIS電子版電子版nBIOSIS PreviewsnBio

3、logical AbstractsnBiological Abstracts/RRMnBasic BIOSISnZoological Record紙本刊紙本刊nBiological AbstractsnBiological Abstracts/RRMnZoological RecordnAbstracts of EntomologynAbstracts of MycologyBIOSIS Previews簡介簡介BIOSIS PreviewsBiological Abstracts(生物學文摘生物學文摘)Biological Abstracts/RRM(Reports, Reviews &am

4、p; Meetings)BIOSIS PreviewsBIOSIS Previews，結合 Biological Abstracts 和 Biological Abstracts/RRM (Reports, Reviews, Meetings) 這兩個數據庫的內容，而成為一個單一的數據庫，因此BIOSIS Previews 為兼具深度和廣度的生命科學暨生物醫學數據庫。BIOSIS PreviewsBIOSIS數據庫內容，不但廣泛收錄來自全世界上千萬筆的文獻數據，并且以有系統，方便使用的方式呈現給使用者。使用者只需要具備基本的專業知識和簡單的查詢技巧，就可以在復雜而大量的數據庫中，迅速確實的找到

5、完整的相關信息。Literature SourcesBIOSIS Previews的獨特之處在于，其整合會議記錄文獻和專利內容，以及學術期刊論文于單一的數據庫。也就是說，當使用者在做檢索時，可以同時在這許多不同的文獻型態中找到相關數據。nJournalsnBooksnConferences and meetingsnReview ArticlesnPatentsBIOSIS Previews CoverageBIOSIS Previews 收錄的文獻包括有下列幾種型態收錄的文獻包括有下列幾種型態Journals 期刊收錄的學術性研究論文等。Books 針對主題的深度討論和完整研究結果可在 bo

6、ok literature 中找到Patents BIOSIS Previews 收錄的專利法案，多與藥物，基因工程技術，食品技術等生化科技產品有關，使研究者了解如何讓生命科學研究發揮具體的經濟效益。BIOSIS Previews CoverageBIOSIS Previews 特有收錄的文獻包括有下列幾種型態特有收錄的文獻包括有下列幾種型態 Reports與生命科學研究相關之報導 Review Articles專題評論性論文 Meetings BIOSIS Previews收錄了在meetings, conferences and symposia中所發表的會議論文，使研究人員能得到最新生命

7、科學發展的第一手資料。并收錄會議的相關信息, 包含會議贊助者, 會議議程, 會議相關網站BIOSIS資料統計資料統計nBIOSIS Previews 的更新頻率專線版 (online)：周更新CD/Local server：月更新nBIOSIS Previews 每年平均增加五十七萬筆數據；自1969年起至目前為止，已累計了一千四百多萬筆的資料BIOSIS Previews 數據量數據量文獻型態文獻型態19692002Article9,836,991Meeting3,497,192Book611,865Patent194,104Letter51,238Technical report831So

8、ftware50Company profile47BIOSIS Previews 數據量數據量文獻型態文獻型態1969200219692003 1969presentArticle9,836,991 10,194,397 10,481,227 Meeting3,497,192 3,661,390 3,681,717 Book611,865 612,372 622,150 Patent194,104 214,682 220,915 Letter51,238 56,507 57,562 Geographical CoveragenBIOSIS涵蓋的內容具高度國際性。從地理分布來看，BIOSIS收錄

9、了超過100個國家的出版品。完整清單詳列在BIOSIS Serial Sources。nBIOSIS收錄的文獻來自全球各大洲，其中n北美洲占 31%n歐洲及中東地區占 52%n亞洲及澳洲占 14%n中美洲及南美洲 2%n非洲地區 1%North America (31%)Asia, Australasia(14%)Europe &Middle East (52%)Central & S. America (2%)Africa (1%)Geographical CoverageSubject Coveragen什么樣的文章才能被BIOSIS收錄？已出版之論文或書籍與生命科學主題相

10、關具研究性或學術性Subject CoveragenTraditional topicsnInterdisciplinary areasnRelated areasSubject CoveragenTraditional areasnMolecular Biology (分子生物學)nBotany (植物學)nZoology (動物學)nEcology and the Environment(生態學和環境學)nMicrobiology (微生物學)Subject CoveragenInterdisciplinary areas (跨學科跨學科) 包括包括nExperimental, Clini

11、cal and Veterinary Medicine(實驗醫學，臨床醫學，和獸醫學)nBiotechnology and Genetics (生物科技和遺傳學)nAgriculture and Nutrition (農業學和營養學)nBiochemistry (生物化學)nPharmacology (藥物學)nPublic Health (公共衛生學)Subject CoveragenRelated areas 包括包括nMethods (研究方法)nInstrument (實驗儀器)MedicineMolecularBiologyBehavior &EcologyAgricultu

12、ral &Plant SciencesBiotechnologyPhysiologyAppliedZoologyMicrobiologyBIOSIS PreviewsBIOSIS與其它數據庫之特色比較與其它數據庫之特色比較nBIOSIS and MEDLINE are NOT the samenBIOSIS Previews / AGRICOLAnCompare BIOSIS and EMBASEnBIOSIS vs MEDLINE vs EMBASE Three-way search comparisonsBIOSIS/MedLinePrimary EmphasisBIOSISAll

13、 life science areas, including:AgricultureBiochemistryBiomedicineBiotechnologyBotanyEcologyEnvironmental SciencesGeneticsMicrobiologyPharmacologyExperimental MedicineMedLineBiomedicine,including:Clinical MedicineNursingDentistryPublic HealthGeneticsToxicologyPharmacologyAllied Health SciencesBIOSIS與

14、其它數據庫之特色比較與其它數據庫之特色比較nBIOSIS and MEDLINE are NOT the samenBIOSIS Previews / AGRICOLAnCompare BIOSIS and EMBASEnBIOSIS vs MEDLINE vs EMBASE Three-way search comparisonsBIOSIS與其它數據庫之特色比較與其它數據庫之特色比較nBIOSIS and MEDLINE are NOT the samenBIOSIS Previews / AGRICOLAnCompare BIOSIS and EMBASEnBIOSIS vs MEDLI

15、NE vs EMBASE Three-way search comparisonsBIOSIS與其它數據庫之特色比較與其它數據庫之特色比較nBIOSIS and MEDLINE are NOT the samenBIOSIS Previews / AGRICOLAnCompare BIOSIS and EMBASEnBIOSIS vs MEDLINE vs EMBASE Three-way search comparisonsMedical Genetics SEARCH CRITERIACOMBINED TOTALBIOSISUNIQUEMEDLINE UNIQUEEMBASE UNIQUE

16、BIOSIS,MEDLINE AND EMBASE OVERLAPBIOSISAND MEDLINE OVERLAPBIOSISAND EMBASE OVERLAPMEDLINEAND EMBASE OVERLAPgenetics and apoptosis and gene therapy1,6727682931969415465102Proteomics SEARCH CRITERIACOMBINED TOTALBIOSISUNIQUEMEDLINE UNIQUEEMBASE UNIQUEBIOSIS, MEDLINE AND EMBASE OVERLAPBIOSISAND MEDLINE

17、 OVERLAPBIOSISAND EMBASE OVERLAPMEDLINEAND EMBASE OVERLAPproteomics and methods see illustration2,6351,79793153320948593PharmacognosySEARCH CRITERIACOMBINED TOTALBIOSISUNIQUEMEDLINE UNIQUEEMBASE UNIQUEBIOSIS,MEDLINE AND EMBASE OVERLAPBIOSISAND MEDLINE OVERLAPBIOSISAND EMBASE OVERLAPMEDLINEAND EMBASE

18、 OVERLAPpharmacognosy flavonoid and fruit see illustration1,13851381179114918278BIOSIS 檢索特色檢索特色BIOSIS Specialized Indexingn為什么需要為什么需要 Indexing？BIOSIS Previews的主要宗旨是讓研究者取得與生命科學相關的信息。如果您想在某一本書里找尋與特定主題有關的部份，您會翻到這本書最末幾頁的 “索引”(Index)部份，以得知在書本的第幾頁可以找到這個特定主題。然而，學術期刊論文和其它文獻數據并沒有提供像書本一樣的 “索引” 部份以供讀者查閱，因此BIOS

19、IS根據生命科學領域的內容，建立了一套獨特的indexing system。BIOSIS Specialized IndexingBIOSIS DBIndexing.系統化字段系統化字段檢索數量的擴增檢索質量的提升BIOSIS Specialized IndexingnBIOSIS 發展出全新的獨有標引方法 (indexing methodology)，稱為關連性標引 (relational indexing)其特色在于能夠處理每一個檢索字詞和控制字匯之間的關連性。這個加值化的索引系統使研究者能快速而正確的找到數據，同時也為信息科技專業人員提供進一步的檢索設計。Specialized Inde

20、xing for better retrievalnBIOSIS 所獨有的編制索引方式, 提供從事生命科學研究專業人員一個極佳的數據庫檢索途徑nBIOSIS Specialized indexing 提供不同研究主題一個統一的檢索架構, 使用者可以透過這個架構獲取兼具質與量的資料BIOSIS Searching FieldsexampleAuthor.AU.Major Concept.MC.Chemical/Biochemical.CB.Methods & Equipment.ME.Disease.DS.Organisms.OR.Geopolitical Locations.GE.Me

21、eting Information.MF.CAS Registry Number.RN.Patent Number.PN.在在 BIOSIS Previews 中中, 提供多種提供多種不同檢不同檢索字段索字段, 以方便使用者利用以方便使用者利用SamplenLimit searches to specific fieldsTurkey (不限制字段) 759 hitsTurkey (Geopolitical Location) 399 hitsTurkey (Organism) 245 hitsBIOSIS Specialized indexingnCA Registry Numbers an

22、d MEDLINE MeSH disease terms make searches more effective為了能達到跨數據庫字段檢索，BIOSIS也采納了其它數據庫的標引方式，使之具有和其它數據庫共有的檢索字段。BIOSIS Value added indexingnControlled & Natural language keywords 控制詞匯與自然語言BIOSIS 在Authority File中加入大量的自然語言 (natural language) 做為控制字匯(controlled vocabulary)，而不再只以編碼(codes) 做為專有名詞的控制查詢。并

23、且研究人員不需記憶大量專有名詞，即可做檢索的動作BIOSIS Value added indexingAuthority FilenMajor ConceptsnOrganismsNew Taxon modifiersFossil modifiersnSuper TaxanTaxa NotesnDiseasesDisease modifiersnParts, Structures, & SystemsnOrgan System modifiersnChemicals & BiochemicalsDrug modifiersnSequence DataSequence type

24、modifiersnGeopolitical LocationsnInstitutions and OrganizationsInstitution type modifiersSearching for Subject InformationIndexing syntax exampleModifierKey TermVariantClassifierSearching for Subject InformationIndexing syntax exampleZoological Record動物學刊動物學刊Zoological Recordn公元1865年, 一群動物學家與大不列顛博物館

25、開始建立 ZR 數據庫n自公元1980起, 與美國BIOSIS公司及倫敦動物協會合作n透過不同媒體管道, 皆可使用Zoological Recordnin printnon compact disc (銀盤)non the Web (CSA, OVID, 銀盤, WoK)Zoological RecordnElectronic media (電子數據庫):nZR completenPrint (印刷版):nZR 完整版n29 種個別專業學科, 例如:nInsectanMammalianAvesnReptilian更新頻率 : 月更新Zoological Recordn二大功能:nAuthori

26、tative record of taxonomic nomenclature極具權威與可信度之動物學命名數據庫nrecords discovery of new organismsndocuments changes in nomenclaturenIndex to the literature of zoological researchn“exotic” speciesZoological RecordNorth America (20%)Asia, Australasia(19%)Europe &Middle East (55%)Africa (2%)Ecology &

27、EnvironmentPhysiology &MorphologyBehaviorEvolutionSystematicDiseases &DisordersZoogeographyTechniques& MethodsZoological RecordZoological Record CoverageBehaviour 行為學Biochemistry 生物化學Evolution進化學Ecology 生態學Genetics 遺傳學DevelopmentFeedingMorphology 形態學Parasitology 寄生生物學Physiology 生理學Reprod

28、uction 遺傳學Zoogeography 動物地理學Systematics 系統分類學TechniquesZoological Record Statistics & Sourcesn每年增加 72,000 筆數據n自1978年至今, 已收錄超過 1.3 million 筆資料n資料來源n4,500 scientific serialsn1,200 - 1,500 BooksnMeetings & conferencesnReviewsnIn Database:?Zoo Record v.137 2001nTITLE: Culture of microalgae using

29、 interstitial water extracted from shrimp pond bottom sediments.AUTHOR: Yusoff,-Fatimah-M.-a; Matias,-Hazel-B.; Khalid,-Zarina-A.; Phang,-Siew-MoiCORPORATE SOURCE : a Department of Biology, Faculty of Science and Environmental Studies, Universiti Putra Malaysia, 43400 UPM, Serdang, Selangor D.E., Ma

30、laysia (Federation of)SOURCE: AQUACULTURE 201(3-4), 1 October, 2001: 263-270.ISSN: 0044-8486PUBLICATION YEAR: 2001LANGUAGE: EnglishLANGUAGE OF SUMMARY: EnglishAbstract: Interstitial water, extracted from the bottom sediment of a shrimp culture pond, was rich in nutrients containing total phosphorus

31、with concentration of 25.98 mg/l and total nitrogen of 65.45 mg/l. A diatom, Chaetoceros calcitrans, a green alga, Nannochloropsis oculata, and a cyanobacterium, Oscillatoria sp., were cultured in pure interstitial water (PIW), diluted interstitial water (DIW) and in Conway medium (CM). C. calcitran

32、s showed a significantly higher (P 0.05) growth rate in DIW compared to CM and PIW. Alternatively, Oscillatoria sp. had a significantly lower (P 0.05) growth rate when grown in DIW compared to CM. Similar to the other algae, Oscillatoria sp. showed the lowest growth rate in PIW. C. calcitrans and Os

33、cillatoria sp. were also grown in DIW with the addition of nitrogen, phosphorus, silica and the combination of the three nutrients. The addition of nitrogen and silica to the diluted interstitial water significantly improved (P 0.05) the growth rate of C. calcitrans, but the addition of phosphorus s

34、ignificantly decreased (P 0.05) its growth. On the other hand, the growth rate of Oscillatoria sp. significantly decreased (P 0.05) with the addition of nitrogen, but increased (P 0.05) with the addition of phosphorus. There was no significant difference (P 0.05) in the growth rate of Oscillatoria s

35、p. cultured in interstitial water and that with added silica or a combination of nitrogen, phosphorus and silica. This study indicates that interstitial water extracted from aquaculture ponds, in sterilized diluted form, has the potential to be used as an effective medium for the culture of microalg

36、ae.DESCRIPTORS: Nannochloropsis oculata; LABORATORY-CULTURE; Culture using interstitial water extracted from shrimp pond bottom sediments SYSTEMATICS: * PROTOZOA-; Nannochloropsis oculataSUPER TAXA: Invertebrates; ProtozoansDOCUMENT TYPE: ArticleJOURNAL ANNOUNCEMENT: Zoological-Record-Volume-137, Se

37、ction-2-ProtozoaACCESSION NUMBER:PDATE CODE: 13712 檢索模式檢索模式常用檢索方法與技巧常用檢索方法與技巧檢索策略的保存、運行與刪除檢索策略的保存、運行與刪除檢索結果顯示設計、輸出檢索結果顯示設計、輸出第二部分第二部分OVID版版Biosis Previews一一 高級檢索模式高級檢索模式( (系統默認）系統默認）檢索詞輸入框檢索詞輸入框限制項限制項檢索歷史檢索歷史工具欄工具欄數據庫數據庫工具列說明工具列說明篇名篇名查詢查詢作者作者查詢查詢刊名刊名查詢查詢檢索檢索模式模式組合功組合功能鍵能鍵欄位欄位查詢查詢注銷注銷工具工

38、具查詢查詢限制限制條件條件資料庫資料庫更換更換二二 基本檢索模式基本檢索模式關鍵詞或關鍵詞或作者查詢作者查詢常用檢索方法和技巧常用檢索方法和技巧關鍵詞（自由詞檢索）關鍵詞（自由詞檢索）A.任意的字母、數字、單詞或詞組任意的字母、數字、單詞或詞組如如123，cancer ,AIDS等等B.連綴詞組連綴詞組如如: Interleukin-6 “$” “:” 右端無限截詞，代替任意個字符右端無限截詞，代替任意個字符,如如hypno$可檢索出可檢索出hypnotize、hypnotized、hypnotist、hypnotizing等等；等等；“#” 代表任何單個字母，但只可取代存在的字符代表任何單個

39、字母，但只可取代存在的字符,可出現在詞的中間，也可出現在詞的右端，如可出現在詞的中間，也可出現在詞的右端，如wom#n表示可檢索表示可檢索woman和和women；“？” 代表任單個字母，也可以代表空字母，代表任單個字母，也可以代表空字母，如如colo?r表示可檢索表示可檢索color和和colourc.c.帶截詞算符的單詞帶截詞算符的單詞 ，“$ $”, ”, “: :”,“”,“# #”,“”,“? ?”舉例見舉例見23D.D. 位置運算符位置運算符 ADJADJ檢索式：檢索式： A ADJ BA 和和B 同時出現在同一句子中，先后順序不可顛倒同時出現在同一句子中，先后順序不可顛倒檢索式：

40、檢索式： A ADJn BA和和B之間最多可插入之間最多可插入n個其它單詞，且無先后順序個其它單詞，且無先后順序舉例見舉例見25第第4步步E.E.字符出現頻率的設定字符出現頻率的設定利用利用freq，可設定某字出現頻率。可設定某字出現頻率。語法為語法為x.yy./freq=nX代表關鍵詞；代表關鍵詞；yy代表欲檢索的字段（一次只能代表欲檢索的字段（一次只能設定一個字段）；設定一個字段）；n代表關鍵詞出現的頻率。代表關鍵詞出現的頻率。如設定如設定bacteriophage在文摘中出現在文摘中出現5次以上，則次以上，則檢索式為檢索式為bacteriophage.ab. /freq=5F. 邏輯檢索

41、式，可達到用戶較為復雜的 檢索目的 and ,or ,not，其中 and 和 or也可使用combine欄位檢索式：檢索式：A and B 表示文獻中同時包含表示文獻中同時包含 A和和B檢索式：檢索式：A or B 表示文獻中包含表示文獻中包含A或或B或或 同時包含同時包含A和和B檢索式：檢索式：A not B 表示文獻中包含表示文獻中包含A同時不包含同時不包含BCombine欄位檢索欄位檢索檢索低密度脂蛋白與冠狀動脈粥樣硬化方面的文獻檢索低密度脂蛋白與冠狀動脈粥樣硬化方面的文獻Map Term to Subject Heading檢索檢索2001-2002年間發表的有關年間發表的有關PCR

42、方面的綜述文獻方面的綜述文獻字段檢索字段檢索a. 基本欄位檢索，直接點擊基本欄位檢索，直接點擊“Auther”、”Title”、”Journal”,再在指令框里輸入相應的詞或短語即再在指令框里輸入相應的詞或短語即可。可。Auther 姓全稱空格名縮寫（首字 母）Title 篇名中的關鍵單詞或詞組Journal 期刊名用全稱期刊名用全稱b. 直接在指令框里輸入，加“.字段標識.”如，Smith bj.au.tuberculosis.ti.cancer research.jn.c. Search Fields欄位欄位針對針對BP特有欄位與不同讀者需求，設計特有欄位與不同讀者需求，設計58種檢種檢索

43、欄位索欄位 選擇所需要選擇所需要的檢索欄位的檢索欄位選擇所需要選擇所需要的檢索欄位的檢索欄位選擇所需要選擇所需要的檢索欄位的檢索欄位按查詢功能使用檢索字段按查詢功能使用檢索字段 （A B C D E)A 查詢文獻相關信息查詢文獻相關信息Journals可利用的檢索欄位有可利用的檢索欄位有：jn: Journal Name（期刊名）is: ISSN （國際標準刊號）ip: Issue （期）vo: Volume（卷）jl: Journal URL（期刊URL)pg: Pagination （頁碼）Books可利用的檢索欄位有：可利用的檢索欄位有：nbe: Book Author/Editor（書

44、籍作者或編者）nbt: Book Title（書名）nbo: Original Language Book Title（書名原始語言）(non-English)nib: ISBN （國際標準書號）Patents可利用的檢索欄位有：可利用的檢索欄位有：nau: Author/Editor/Inventor（專利發明者）npa: Patent Assignee（專利權人）ncl: Patent Class（專利分類號）npc: Patent Country（專利國）npn: Patent Number（專利號）Meetingsmf: Meeting Information（會議相關信息）sp: M

45、eeting Sponsor （會議主辦單位）可利用的檢索欄位可利用的檢索欄位A 查詢文獻相關信息查詢文獻相關信息 -其它其它nyr: Year of Publication（出版年代）ncy: Country（出版國）nls: Summary Language（摘要使用語言）nlg: Language（語言）npi: Publisher Information（出版信息）npt: Publication Type（出版類型）B 查詢特定記錄查詢特定記錄an: Accession Number（記錄號）如：PREV200000170837.an.C 查詢作者信息查詢作者信息au: Author

46、/Editor/Inventor（作者/編者/發明者）be: Book Author/Editor （書籍的作者/編者）D 查詢研究主題查詢研究主題mc: Major Concepts（大范圍學科主題查詢，共168個）如：Clinical Immunology.mc.cc: Concept Codes（相當于次標題，由5個數字編碼組成）如：140.cc.（檢索所有次標題含有Digestive system的資料）D 查詢研究主題查詢研究主題Ti : Title (English)（文獻標題出現的字詞）ab: Abstract（摘要出現的字詞）ps: Parts, Structures &

47、; Systems of Organisms（生物體的大分子結構，包括組織，器官，系統等）如：Liver tissue.ps.ds: Diseases（各種動物，植物，人類的疾病及異常現象）如：AIDS.ds.D 查詢研究主題查詢研究主題ai: Alternate Indexing（便于跨庫檢索，相當于MEDLINE中的MESH)如：arthritis rheumatoid.ai.cb: Chemicals & Biochemicals(化學物和生化物，包括藥物）如：captopril.cb.rn: Registry Numbers（化學物質登錄號）如：69049-74-7.rn.D 查詢研究主題查詢研究主題mq: Methods & Equipment(研究方法，儀器，實驗技術）如：diagnostic method.mq.sq: Sequence Data（大分子物質序列）如：amino acid sequence.sq.tm: Time（事件發生的年代）如：Paleozoic.tm.D 查詢研究主題查詢研究主題ge: Geopolitical Locations（國家，大陸和動物地理區域 ）如：Turkey.ge.np: Persons（文獻中討論到的人物）如：Albert Einstein.np.id: Industry（文獻中提到的行