CONEFOR2.6用戶手冊(Saura&Torne,2012年4月)通過空間圖和生境可用性(可達性)度量量化生境斑塊和鏈接對維持或增強景觀連接性的重要性目錄1。Conefor是什么?12。作者23所示。本手冊范圍24所示。與2.2版本相比，2.6版本的主要新特性5。安裝、操作系統和計算機配置6。使用條件37所示。問題或進一步的信息3。8。對Conefor2.6的圖形用戶界面中新特性的概述9。計算節點的重要值，包括IIC或PC(intra,flux,connector)的分數10。廣義中介中心性度量711。只計算整個景觀的整體指數值1012。計算整個景觀的等效連接性(EC)(總體索引值)1113。只計算添加節點11的重要性14。計算不同模式(刪除、改進、更改)的鏈路重要性值15。計算精度(高或標準)17。16。其他有關Conefor2.6.17的評論。17所示。GIS擴展1718歲。應用1819所示。實證支持1820.參考文獻181。Conefor是什么?Conefor是一個軟件包，它允許量化生境區域的重要性，以及維持或改善景觀連通性的鏈接，以及評估生境和土地利用變化對連通性的影響。它被認為是在保護和景觀規劃方面的決策支持的工具，通過確定和確定關鍵地點的生態連通性。Conefor包括新功能連通性指數(積分連接性指數(IIC)的概率連接(PC)),已經被證明可以提供了一個改進的性能比其他現有的指數和特別適合景觀保護規劃和改變監視應用程序(Pascual-Hortal和012006、01和Pascual-Hortal2007年012010年盧比奧,01etal.2011年)。這些指標是基于空間圖，以及在景觀尺度上測量棲息地的可用性(可達性)的概念。這一概念包含在將生境斑塊本身視為連接發生的空間，將斑塊內存在的連接資源(intrapatch連接性)與景觀中與其他生境斑塊(斑塊連接性)的連接所提供的資源(可通過)集成在一起。這樣,連接是構思(測量)作為景觀的性質決定的數量可及棲息地景觀,無論這種可及棲息地來自大型和/或高質量的生境斑塊(intrapatch連接),從不同的補丁(interpatch連接)或之間存在密切聯系,更頻繁,從兩者的結合。2.作者Conefor2.6是由馬德里政治大學的SantiagoSaura和JosepTorne開發的，作為先前2.2版本的改進(Saura和Torne2009)。詳情請參閱，并參考第20節。ConeforSensinode2.2(2007年6月發布)是由Lleida大學的相同作者開發的。西班牙科學和創新部通過AGL2009-07140和REN2003-01628項目為發展Conefor提供了資金。Sensinode1.0(LandGraphspackage)由DeanUrban(DukeUniversity)開發。3所示。本手冊的范圍本用戶手冊只解釋了在Conefor2.6中實現的那些新特性，并且沒有包含在2.2版本中。這個軟件包的所有其他功能、基本功能和說明與2.2版本相同。關于如何使用Conefor的其余(大部分)信息，請參閱版本2.2(附件)的手冊。稍后，我們計劃制作一個整合這兩個手冊內容的單一更新手冊。查看Conefor網站()的更新。在該網站，你也可以訂閱一個電子郵件列表，自動通知你任何有關Conefor的相關新聞。4所示。與2.2版本相比，2.6版本的主要新特性的三個分數dPC和dIIC指數(內部、通量、連接器)計算(見9節),除了總dPC/dIIC值已經提供的2.2版。這允許單獨評估棲息地斑塊對景觀中的棲息地連接和可用性的不同貢獻方式，即它們作為連接性提供者的不同角色(Saura和Rubio2010)。連接的重要性(sensilink)可以計算個人聯系,除了節點的重要性(sensinode)已經提供的2.2版。版本2.6中包含了一些敏感鏈接功能，如第14節所述(鏈接刪除、鏈接改進、鏈接更改)。考慮到Conefor現在不僅執行與節點(sensinode)相關的分析，而且還執行與網絡中的鏈接(sensilink)相關的分析，因此在這個版本2.6和未來版本中，軟件包的名稱已經從“Coneforsensinode”簡化為“Conefor”。等效連接(EC)的值對應于IIC和PC標準(2011年01etal.2011a,b)也提出了整體指數的結果(參見12)。中間性的價值中心(BC)指標可以計算并提出的節點重要性的結果文件。這包括由Freeman定義的經典BC度量，更重要的是，廣義和改進版本BC(IIC)和BC(PC)，它為這個度量提供了更多的生態現實主義，并允許它與IIC和PC的需求和理想屬性相匹配(參見第10節)。正如Bodin和Saura(2010)所詳細描述的，所有這些度量都集成在一個具有相同度量單位的分析框架中。5。安裝、操作系統和計算機配置這個新版本2.6沒有特定的安裝要求。只需將可執行文件(Conefor26.exe)復制到您的計算機的任何位置，并雙擊該文件以運行該軟件(您甚至可以直接通過USB棒運行該軟件)。至于2.2版，Conefor只在使用Windows操作系統的計算機上運行(任何Windows版本都可以，包括WindowsXP、Vista、7和其他版本)。它同時在32位和64位架構中運行，盡管當前的Conefor編譯只使用32位(即不能在您的計算機中使用超過4GB的RAM)。在未來，我們計劃為64位和不同于Windows的其他操作系統生成Conefor編譯(如果您希望自動獲得未來版本或其他相關新聞的通知，請查看Conefor網站的更新和/或訂閱Conefor電子郵件列表)。Conefor注意,在輸入文件(節點和連接文件)點(而不是逗號)應該設定為小數點符號,符號不應該被用作一千分離器(例如一個正確的數字格式是1235.45,1.234,45或1235,45或1235.451.234.45不正確)。Conefor將根據這些規范期望輸入文件中的所有數值，并以相同的格式寫入結果。如果輸入文件中的任何數值都不是按照這種格式編寫的，那么當試圖使用這些輸入文件運行Conefor時，會發生錯誤。這意味著在通過專門為此目的開發的任何GIS擴展為Conefor生成輸入文件之前，應該相應地設置計算機的區域配置設置(參見第17節)。否則，GIS擴展將以錯誤的數字格式編寫Conefor輸入文件，這些文件將不能用于Conefor的后續處理。6。使用條件Conefor是免費軟件，與2.2版本具有相同的使用條件。這意味著它可以不受任何非商業目的的限制，只需要引用軟件、其網站和適當的引用(參見和下文第20節)。7任何問題或進一步的信息有關任何問題或進一步信息，請訪問，在那里您可以找到Conefor軟件包的最新版本、用戶手冊、GIS擴展、相關論文、Conefor在全球應用的概述、實證支持研究和其他相關信息。你也可以通過conefor@聯系我們。作者希望了解使用Conefor的應用程序，以及報告錯誤和改進建議的幫助。但是，將提供非常有限的用戶支持，并且只針對與此軟件及其實現的方法有關的特定問題，這不能用其他方法來解決(例如仔細閱讀手冊和不同的相關文件)。8。概述了圖形用戶界面的新特性，用于Conefor2.6。Conefor2.6中的大多數新特性都位于下圖所示的紅色框中。其余部分與2.2版本完全相同。每個紅色框旁邊的數字表示您可以在本用戶手冊的哪個部分找到該特定選項或功能的描述。請參閱第12節，以獲得在此映像中沒有圖形化的附加新特性。

9。計算節點的重要值，包括IIC或PC的分數(內部、流量、連接器)除非您指定“唯一的整體索引”選項(請參閱下面的第11節)，Conefor將計算每個節點的重要性，作為將單個節點從景觀中移除所導致的連接性度量值的減少(請參閱手冊中的2.2版本和相關論文以了解更多細節)。這包括Saura和Rubio(2010)所描述的IIC或PC的內部、通量和連接器部分;如果選擇這兩個指標中的任何一個進行分析，這些分數將自動計算出來。一個節點的重要性(或鏈接，參見第14節)根據給定的連接性索引(度量)M可以用相關的術語表示(在Conefor2.6,dM中)或絕對的術語(“vars”在Conefor2.6,varM)中表示:其中M為景觀中所有節點都存在時的整體連通性指數(metric)值(即初始、完整、未擾動景觀的公制值)，Mafter為從景觀中去除單個節點后的整體指標值。因此，dM和varM分別量化了特定節點/patch丟失后整個景觀(M)整體連通性度量值的相對變化和絕對變化。同樣的方程也適用于與補丁之間的鏈接相關的其他更改，如將在第14節后面描述的那樣。在運行軟件之前，您應該至少選擇“Showdeltas”或“Showvars”(除非“Onlyoverallindex”選項被激活，參見下面第11節)。如果您選擇“Showdeltas”選項(這是默認選項)，Conefor將計算并顯示每個節點和為分析選擇的每個索引的dM值。如果您選擇“Showvars”選項，Conefor將計算并顯示每個節點和為分析選擇的每個索引的varM值。您還可以同時選擇“Showdeltas”和“Showvars”，然后Conefor將計算和顯示dM和varM的值。但是，請注意，這可能在節點重要性文件中生成大量列，并且根據dM或varM(因為這兩個變量是成比例的，varM=(dM·M)/100給出的)，棲息地斑塊(節點)對景觀連接性的貢獻是相同的。雖然在某些情況下，dM值更容易解釋，但這將取決于所選的索引和用戶首選項。在某些情況下，如果景觀/網絡非常大，那么dM值可能非常低(如果網絡由數千個節點組成，那么單個節點很難對連接具有較大的相對重要性)，也很難處理(最終無法區分為0)。在這些情況下，varM值可能是更好的選擇。索引M可以對應于Conefor2.6中包含的任何連接指標:NL、NC、H、LCP、IICnum、F、AWF、PCnum。注意，在Conefor中，IICnum和PCnum值(IIC和PC指標的數值分別參見下面的公式)是用于計算dIIC、dPC、varIIC和varPC值的。這使得無需根據IIC或PC計算節點輸入的任何AL值。即使使用特定AL的IIC和PC值(而不是IICnum或PCnum)來計算節點的重要性值，dIIC和dPC將與使用IICnum或PCnum獲得的值完全相同。這是因為AL是一個常數，不隨節點或鏈接的刪除而變化從景觀。(如果您希望獲得變量或varPC值，就像使用IIC和PC值(對于給定的AL值)所產生的結果一樣，您只需將用Conefor2.6和a2計算的變量或varPC值除以2。)IfyouwishtoobtainthevarIICorvarPCvaluesastheywouldresultfromusingtheIICandPCvalues(foragivenALvalue)youjustneedtodividethevarIICorvarPCvaluesthatarecalculatedbyConefor2.6byA2.

有關這些度量和公式的詳細信息，請參閱手冊2.2版和兩篇相關論文(Pascual-Hortal和Saura2006、Saura和Pascual-Hortal2007)。Saura和Rubio(2010)指出，IIC和PC度量的重要性值可以劃分為三個不同的部分(intra、flux、connector)，考慮到棲息地斑塊(節點)或鏈接對總體棲息地連接和景觀可用性的不同影響。當選擇IIC和/或PC進行分析時，Conefor2.6將自動為每個節點計算這三個部分的值。這適用于由Conefor計算的dM和varM值(除了分割的分數值外，還將給出總dIIC、varIIC、dPC和varPC值):

對于現有的節點(標準分析/節點刪除)和由于棲息地恢復措施可能添加到景觀中的節點，將對這三個部分進行計算(見選項“節點添加”在版本2.2的手冊中)。雖然棲息地補丁可以通過這三個部分實現連接，但是鏈接(走廊、連接器)只能通過連接器部分實現連接:請參見Saura和Rubio(2010)。Baranyietal。(2011)表明,通過聚類分析和多維標度,內部,通量和連接器分數提供非冗余和互補信息的重要性一片景觀網絡,他們捕獲的大部分變化補丁保護優先,來自使用更大的組連接度量研究(見圖5),也許由中心補充指標(見下面的部分10)。唯一的例外的dM和varM計算節點重要性文件(如前所述)的值是中間性中心指標(公元前公元前公元前(IIC),(PC)):這些指標計算方式不同(見下面的部分10),而不是根據上面所示的公式dM或varM。Conefor2.6中包含的中間度中心性度量是根據每個節點在完整的(初始)環境中的位置來計算的，而不是像其他指標那樣遵循節點(補丁)移除過程。逐句翻譯

最后需要注意的是，在Conefor2.6中不再包含CCP索引(類符合概率)。這是因為與其他指標相比，CCP沒有提供良好的優先級能力(參見Pascual-Hortal和Saura(2006)))，如果沒有必要，我們打算避免Conefor計算過多的指標。另一方面，在分析上，CCP與LCP非常相似。由于LCP包含在Conefor2.6中，如果您希望這樣做，那么很容易從Conefor2.6計算的LCP中獲得CCP值;參見Pascual-Hortal和Saura(2006)的公式，了解如何進行這個簡單的計算。在您仍然希望直接獲取CCP值的罕見情況下，您可以為這個特殊目的使用舊版本ConeforSensinode2.2(這個舊版本仍然可以在Conefor網站上下載)。10。廣義中間性中心指標10.1。哪個網絡中心指標是由Conefor計算的?對于每個節點計算Conefor2.6:-BC，最初由Freeman定義的經典中間度中心性度量(1977);社會人際學40:35-41)。——公元前公元前(IIC)和(PC),公元前度量的改進版本,博丹提出的,01(2010)為了把一些重要的考慮增加這個指標的生態現實主義,使它與IIC和PC的特點和可取的屬性。這樣，BC(IIC)和BC(PC)就被放置(集成)在與IIC和PC度量相同的分析框架中。所有這些度量都用相同的度量單位表示，可以直接進行比較。特別是，每個節點的歸一化BC(IIC)和BC(PC)值分別等于或高于IIC和PC指標的連接器部分(見下文10.5節)，如Bodin和Saura(2010)所示。BC、BC(IIC)和BC(PC)的值只計算景觀中存在的節點(標準節點重要性分析)，而不計算要添加的鏈接或節點。10.2。中間度中心性度量衡量什么?它們是如何計算的?這些中心度量基線的概念(公元前公元前(IIC),(PC))是一樣的:他們衡量一個特定的節點位于所有其他對網絡中節點之間,即這些指標獲取的程度的最短或最優路徑運動其他生境斑塊之間通過一個特定的節點。當一個節點作為一個中間的墊腳石補丁參與到許多其他對補丁之間的最短/最優移動路徑時，它將是高度集中的(通過這些度量量化)。這些中間度中心性度量與Conefor中實現的所有其他度量指標不同，因為它們只能在單個節點的級別上計算，也就是說，這些BC度量不能提供描述整個場景的連接性的總體值。對于這些度量，不存在M景觀級值(參見第9節中的公式)。因此，當您選擇這些中心指標時，它們的值只會出現在節點重要性文件中，而不會出現在整個索引值的結果中。逐句翻譯

每個節點的中心性度量值(如節點重要性文件所示)的計算與其他度量值是不同的。單個節點的中心性值是考慮到該節點在完整(初始)環境中的拓撲位置，而不執行任何節點刪除過程(上面第9節中dM或varM的公式不適用于這些度量)。詳情請參見Bodin和Saura(2010)。因此，即使BC、BC(IIC)和BC(PC)的值與dM或varM值一起顯示在節點重要性文件中，其余的指標也是如此，應該記住，它們是使用不同的方法/過程來計算的。10.3。經典BC和廣義BC(IIC)和BC(PC)度量之間的區別是什么?BC只考慮通過特定節點的所有對補丁之間的最短路徑數，而不考慮正在連接的補丁的區域(或屬性)以及這些路徑的長度或強度。公元前公元前(IIC)和(PC),然而,考慮到區域的補丁(或任何其他屬性)正在通過一個特定的連接節點,這些節點考慮更多的中央,作為墊腳石大型和高質量的補丁之間比那些坐在補丁與稀缺或窮人之間棲息地資源。BC(IIC)還考慮到涉及特定節點的補丁之間路徑的長度(鏈接數);較長的路徑被認為對進行有效運動不太可行，因此在中心性計算中它們的權重較小。類似地，BC(PC)考慮了在特定路徑上移動的概率(最大積概率p*ij，見Pascual-Hortal和Saura(2007)))，因此p*ij較高的路徑在中心性計算中具有更大的權重。詳情請參見Bodin和Saura(2010)。注意，BC(IIC)和BC(PC)是在Conefor中實現的所有度量中計算密集型的。因此，在具有多個節點的大型場景中計算這兩個指標時，應該小心謹慎。在非常大的網絡中計算BC(IIC)或BC(PC)可能是不可行的，因為需要過多的計算時間。但是，標準BC度量可以更快地計算。10.4。如何在Conefor接口中選擇BC、BC(IIC)和BC(PC)度量進行計算?如果您希望計算經典的BC度量，那么您應該在方框中選擇BC作為Conefor接口中的二進制連接性指標。每個節點的結果值將顯示在節點重要性文件的一列中。BCConefor特定節點計算k值對應不同的總和所有成對的補丁之間最短路徑經過k(k)不同,之間的最短路徑總數除以所有成對的補丁博丹(方程5和01(2010))。無論如果你選擇“顯示三角洲”或“var”相同的結果將出現在公元前的節點重要性文件(即使你選擇“顯示三角洲”和“增值”,只會產生一列公元前的節點重要性文件,與值計算如上所述)。如果您希望計算BC(IIC)度量，那么您應該在Conefor接口的二進制連接索引框中選擇BC和IIC。Conefor將會理解你不僅要計算BC和IIC，還要計算BC(IIC)。這將導致在節點重要性文件的不同列中顯示BC、IIC和BC(IIC)的值。這三個度量(BC、IIC和BC(IIC))將被計算，即使您只對BC(IIC)感興趣，但這并不重要，因為BC(IIC)是這三個度量中計算最密集的度量。計算BC(IIC)將消耗最多總處理時間。另一方面，為了獲得BC和IIC值而進行的一些計算也需要獲得BC(IIC)的結果。如果您希望計算BC和IIC，而不是BC(IIC)，那么您應該運行兩次Conefor，一個只選擇BC，另一個只選擇IIC。逐句翻譯

如果您希望計算BC(PC)度量，那么您應該在框中為二進制指標選擇BC，在框中為概率指標選擇PC。Conefor將會理解您不僅要計算BC和PC，還要計算BC(PC)。這將導致在節點重要性文件的不同列中顯示BC、PC和BC(PC)的值。即使您只對BC(PC)感興趣，也會計算這三個度量(BC、PC和BC(PC))，但這并不重要，因為BC(PC)是這三個度量中計算最密集的度量。計算BC(PC)將消耗大部分的處理時間。另一方面，為了獲得BC值和PC值而進行的一些計算也需要獲得BC(PC)的結果。請注意,如果您的輸入連接文件是一個遠程文件,選擇BC和PC時你需要提供一個距離閾值,將用于計算BC(至于其他二進制連接度量)和一對probability-distance值將用于計算PC和BC(PC)。二進制指標框中指定的距離閾值對BC(PC)的所有計算都沒有影響，它只是基于為概率指標指定的概率距離值。同樣，BC的計算完全不受為概率指標指定的概率距離值的影響。如果您的輸入連接文件是一個概率文件，則同樣適用。在這種情況下，計算BC需要一個概率閾值，但這不會影響PC或BC(PC)的所有計算，PC或BC(PC)將直接使用連接文件中的概率值運行，而不需要在概率指標框中添加任何距離或概率值。如果您不熟悉后一種考慮，請參閱版本2.2的手冊。如果您希望計算BC和PC，而不是BC(PC)，那么您應該運行Conefor2次，一個只有BC選擇，另一個只選擇PC。10.5。廣義中介中心性度量如何與IIC和PC的連接器部分相關?如何解釋這種關系?如果您選擇“Showdelta”，BC(IIC)和BC(PC)的值將按照dIIC和dPC(dIICconnector和dPCconnector)的相同方式進行縮放，每個節點的結果值將顯示在兩個列中，名稱為dBC(IIC)和dBC(PC)。在這種情況下,dBC(IIC)≥dIICconnector和dBC(PC)≥dPCconnector。然而，請注意，dBC(IIC)和dBC(PC)這兩個名稱僅僅表明，這些值與dIICconnector和dPCconnector的值具有直接可比性。這并不意味著dBC(IIC)和dBC(PC)的值被計算為在任何補片去除過程之后的任何連接性度量值的相對變化。詳見Bodin和Saura(2010)。如果您選擇“Showvars”，那么BC(IIC)和BC(PC)的值將按照與varIIC和varPC(varIICconnector和varPCconnector)的值相同的方式進行縮放，每個節點的合成值將顯示在名為varBC(IIC)和varBC(PC)的兩列中。在這種情況下varBC(IIC)≥varIICconnector和varBC(PC)≥varPCconnector。但是請注意，varBC(IIC)和varBC(PC)的名稱僅僅表明，這些值與varIICconnector和varPCconnector的值直接具有可比性。這并不意味著dBC(IIC)和dBC(PC)的值被計算為在任何補片去除過程中任何連接性度量值的絕對變化。如果同時選擇“Showdeltas”和“Showvars”，則節點重要文件中的BC(IIC)和BC(PC)的值將分別按比例縮放，分別顯示為dBC(IIC)和dBC(PC)，以及varBC(IIC)和varBC(PC)。逐句翻譯

中心性度量在完整的場景中計算，不考慮由于丟失特定補丁而導致的流如何變化。與IIC和PC度量的連接器部分不同的是，它們不提供補丁刪除對連接丟失的影響的估計。給定節點k的dBC(IIC)和dIICconnector的值對應該按照以下方式進行解釋(對于varBC(IIC)和varIICconnector、dBC(PC)和dPCconnector，以及varBC(PC)和varPCconnector的值對應該完全相同):dBC(IIC)量化了在完整的景觀(沒有生境斑塊消失的原狀景觀)中通過k的通量，因為k是其他生境斑塊之間最好(最短或最有可能)路徑的一部分。然而，dBC(IIC)并沒有量化其他棲息地之間的連接程度如何依賴于k在景觀中的存在，也就是說，它沒有測量到在其他生境區域之間的連接元素k是如何不可替代的。后一個方面是由dIICconnector測量的。它可能發生,即使k是相當參與通量發生在當前景觀(高dBC(IIC))、k的損失不會有很大影響其他棲息地之間的連接性(dIICconnector低,遠小于dB(IIC)),因為提供的連接是k作為連接元素或墊腳石基本上或完全補償由其他補丁和替代路徑可供運動景觀。然而,如果k是唯一元素維持其他棲息地之間的連接性,并且沒有其他補丁或路徑可用來彌補其損失,消除k將有很大影響殘余網絡的連通性(dIICconnector將在這種情況下高達dBC(IIC))。因此，這些度量標準捕獲了在完整的環境中，一個特定的補丁(dBC(IIC))中所扮演的角色扮演了多大的角色(連接)，當該補丁從景觀(dIICconnector)中移除時，它就丟失了。參見Bodin和Saura(2010)進一步了解這些指標及其生態解釋。BC(IIC)或BC(PC)可以被認為是IIC或PC指標的“第四部分”，用相同的單位和相同的分析框架來度量，而不是內部、流量和連接器部分(連接的通用貨幣)。這四個指標/分數提供多方面的,完整的和冗余的觀點不同生境斑塊的重要連通性提供方,在分析理由支持(2010年01和盧比奧,博丹和012010)和統計評估的實際結果與更廣泛的連接度量,如圖5所示,其余的內容在Baranyietal。(2011)。11。只計算整個景觀的總體索引值當您只想獲取整個景觀(M)的總體索引值，而不是每個節點或鏈接(dM或varM)的重要性值時，應該選擇“唯一整體索引”選項(“模式”框中的第一個選項)。當興趣僅在M值時，此選項允許用戶節省大量處理時間。這是因為總體索引值M比每個節點的dM或varM值要快得多。獲取M只需要一個度量值的計算，而獲取dM或varM則需要n個度量值的額外計算(每個節點一個)，其中n是景觀中的節點總數。如果選擇了任何鏈接重要性分析選項，則獲取dM或varM時需要更多的度量值計算(一般是n·(n-1)/2)。顯然，如果選擇“唯一的整體索引”，則不會計算dM或varM值(節點或鏈接重要文件)。如前一節所述，總體索引值的結果將不包含中間中心度量的任何值，即使它們已經被選擇用于計算。逐句翻譯

12。計算整個景觀的等效連接性(EC)(總體索引值)如果你計算IIC或電腦,“結果->整體指數的價值觀”,您將注意到在這個新版本中,除了IIC或電腦(或者IICnumPCnum)值已經提供的2.2版本,結果還包括歐共體(等效連接)值這兩個指標:EC(IIC)和EC(PC)。這對應于Saura等(2011a,2011b)中所描述的等效連通區域(ECA)指數，其中斑塊生境區域被用作節點屬性。ECA(IIC)和ECA(PC)被定義為單個棲息地斑塊(最大連接)的大小，該斑塊將提供IIC和PC度量(分別)與景觀中的實際棲息地模式相同的值。在更一般的情況下，節點的屬性可能與僅生境區域(如生境質量、種群大小等)不同的其他特征相對應，這個索引最好改名為EC(等效連接)。因此，這個更通用的名稱(EC)是在Conefor2.6中使用的。EC或ECA只是作為IIC和PC指標(IICnum和PCnum)分子的平方根，分別產生EC(IIC)和EC(PC)。雖然Saura等(2011a,2011b)只使用EC/ECA作為PC指數(EC(PC)，但同樣的方法和優勢(見下文)適用于IIC(EC(IIC))。EC(PC)和EC(IIC)都是通過這個新版本計算的。您只需選擇IIC或PC進行分析，整體索引值的結果也將分別顯示EC(IIC)和EC(PC)值。EC(IIC)和EC(PC)維護所有IIC的可取的屬性和優先級能力和PC但有以下優點(作為一個整體指數的值)相比,IIC和PC:(a)他們避免度量值很低,可能獲得IIC和PC當棲息地的數量非常小的總程度分析景觀相比,自EC(IIC)和EC(PC)不會小于最大的屬性(如棲息地面積)斑塊的景觀;(b)EC(IIC)和EC(PC)與節點的屬性具有相同的單位，有助于解釋和理解由此產生的值;(c)EC(IIC)和EC(PC)避免指定任何AL值，這是IIC和PC所需要的，在某些情況下可能不是直接的，在某種程度上可能是任意的;,更重要的是(d)的相對變化EC(IIC)或EC(PC)在一個特定的空間變化(或一組變化)景觀可以直接與棲息地的總量的變化區域景觀(或任何其他考慮節點屬性)相同的更改之后,用一個簡單的解釋,可以獲得額外的見解,比較(2011年01etal.2011a,b)。后一種屬性使得EC(IIC)和EC(PC)非常方便地量化景觀連接性的變化，并與Saura等人描述的景觀中棲息地數量的變化進行比較(2011a,2011b)。見Saura等圖1(2011a)和Saura等圖1(2011b)。13。只計算添加節點的重要性選項時選擇“只添加節點”,Conefor將dM的計算或varM值只對景觀的潛在的節點,可以添加(由于潛在棲息地恢復行動,可能會改善連接),而不是已經存在的節點在其中(不會評估它們潛在損失對連接性的影響)。選擇“僅添加節點”還將禁用鏈接重要性分析的任何選項。此選項(“僅添加節點”)只有在“有要添加的節點”選項之前在節點文件的框中被選中時才會激活。當有節點添加”被選中Conefor會期望一個節點文件三列(見4.2節的手冊版本2.2)和一般計算(a)表示連接的dM或varM值損失,將由每個節點的刪除,存在于當前/最初的景觀,(b)dM或varM值表示由于棲息地恢復措施在景觀中增加新節點而導致的連接性改善(詳見手冊2.2版本)。如果選擇“只添加節點”選項，Conefor將只計算(b)，也就是說，它只會評估如果添加到景觀中，每一個新的潛在生境區域(要添加的節點)對提高連接性的貢獻有多大。以后,一般來說,添加候選節點的數量在景觀(b)遠小于所有節點/補丁存在(a),這個選項可以節省大量處理時間的dM或varM值通過計算節點添加并不是現有的節點。注意，沒有計算BC、BC(IIC)和BC(PC)度量，以便添加節點;在節點重要性文件中，這些度量的值將等于零，但這僅僅意味著它們沒有被計算。14。計算不同模式下的鏈路重要性值(移除、改進、更改)14.1。“鏈接重要性”是什么意思?通過這個分析得到了哪些結果?Conefor2.6包含計算單個鏈接對維護或改進整體景觀連接的貢獻的可能性。這超出了以前的Conefor版本的功能，在這些版本中，這種類型的分析只能用于節點，而不能用于鏈接。最近的一些研究已經從Conefor的這個新功能中獲益(請參閱Conefor網站上的應用部分以獲得完整的參考資料):Gurrutxaga等人(2011;景觀與城市規劃101:310-320)，Sauraetal.(2011;森林生態與管理262:150-160)，Carranza等(2012);景觀生態學27:281-290)，盧比奧等。森林系統)。維持或改善一個鏈接連接的重要性以同樣的方式計算的節點(參見9),即為相對(dM)或絕對(varM)在給定的值連接矩陣M變化在一定變化影響中的鏈接景觀之一。注意，鏈接只能通過連接器部分對棲息地的連接和可用性(如IIC和PC)做出貢獻。由于一個鏈接被定義為一個不包含生境區域的連接元素，所以一個鏈接不能通過intra分數來貢獻。出于同樣的原因，一個鏈接不能成為任何分散流的最終/永久的目的地。因此，在景觀中的任何一個環節，都將由定義為零和通量分數為零。如果一個連接元素包含一些棲息地面積,這應該是建模為圖中的一個節點,和它的值連接元素或墊腳石將無論如何量化通過IIC的連接器分數或PC指標,通過內部的潛在貢獻和通量分數。鏈接的連接器值可以直接與節點的連接器值進行比較。詳見Saura和Rubio(2010)。總之，即使Conefor將鏈接重要性值的結果表示為dIIC、varIIC、dPC和varPC(取決于在Conefor接口中選擇的結果的度量和類型)，用戶也應該知道，對于鏈接，這些值實際上是對應的專用于連接器部分，即它們分別對應于dIICconnector、varIICconnector、dPCconnector和varPCconnector，即使在linkimportant結果文件中沒有顯式地寫入。逐句翻譯

還要注意，鏈接重要性分析可能比節點重要性分析花費更多的時間。當一個節點重要性分析需要n+1度規的計算值(M)與n個節點圖,鏈接重要性分析在同一圖需要n(n-1)/2+1度規的計算值(因為n(n-1)/2完整鏈接的數量在一個無向圖與n個節點)。這在大型網絡中是相當緩慢甚至不可行的，特別是對于像PC這樣的計算密集型度量。當用戶試圖通過Conefor2.6中的這個新功能分析大型數據集時，應該記住這一點。一些可能允許用戶減少計算數量和所需處理時間的選項正在評估中，并且可能包含在這個軟件包的未來版本中(如果需要，請查看以獲得更新或訂閱Conefor電子郵件列表)。Conefor2.6中的鏈接重要性分析不包括任何中介中心性度量(參見第10節)的計算，這些度量只針對單個節點進行計算。鏈接重要性分析可以在Conefor接口的“鏈接重要性”框中選擇以下三種不同的模式進行:鏈接刪除、鏈接改進和鏈接更改。14.2。鏈接刪除:丟失現有鏈接的影響。除“鏈接”選項被選中時,Conefor將刪除一個接一個的每個鏈接存在的景觀網絡(個人鏈接刪除,只有一個鏈接刪除同時)和計算該鏈接的影響損失景觀連通性根據dM或varM(M指標實現的可以是任何Conefor除了中間性中心指標,雖然IIC和PC的建議和其他類型的分析)。這將為景觀中的所有對補丁/節點生成一個dM或varM值，每個鏈接由它連接的節點的id表示。在二進制連接模型(IIC)適用于那些無關的補丁在最初/完整的風景一定會有dM=0和varM=0(顯然是沒有影響的潛在損失之間的聯系兩個補丁如果這樣的鏈接并不實際存在于最初的景觀)。對于那些在初始場景中確實有鏈接的補丁，Conefor將在刪除鏈接(Mafter，請參見第9節)后重新計算索引值，這將導致dM和varM可能(盡管不一定)高于0。由于上述原因，在概率連接模型(適用于PC的那個)中，它們之間沒有直接連接的那些對補丁(pij=0)肯定會有dM=0和varM=0。剩下的情況下(雙補丁j>0),Conefor將改變每一對補丁的j值的初始值在完整的景觀j=0,和M的值重新計算之后變化(Mafter),這將導致糖尿病和varM可能高于零。在二元連接模型中，所有的鏈路損失在它們所代表的變化量上都是可比較的(在初始場景中存在的鏈路被完全移除以評估其損失的影響)。然而，在概率模型中，最初的景觀中每個環節的pij的初始值在不同的鏈接中可能是非常不同的。這在嘗試時引入了一些復雜性。對于概率模型中不同的鏈接，直接比較該分析產生的dM或varM值，因為每個鏈接的強度或使用概率的實際變化幅度(如pij所示)對于每個鏈接可能是完全不同的。例如，在最初的場景中，與在初始場景中有pij=0.9的另一個鏈接獲得相同的dM=10%的鏈接，獲得的dM=10%是不一樣的。在試圖解釋和總結這個概率連接模型的鏈接刪除分析結果時，必須考慮到這一點。14.3。鏈接改進:加強生境斑塊之間聯系的潛在好處當選擇“鏈接改進”選項時，Conefor將執行與“刪除鏈接”選項完全相反的分析。在二進制連接模型(適用于IIC)中，Conefor將在初始場景中沒有直接鏈接的每對補丁中添加一個鏈接(每次只添加一個)，并在修改/添加之后重新計算M值。這可能導致度量M測量的連接增益，在這種情況下，dM<0和varM<0。注意，在這種情況下，IIC和PC度量(dM和varM)的相對和絕對變化將具有負值，因為Mafter大于M(參見第9節中dM和varM的公式)，但實際上這些負值意味著連接性得到了改善。顯然，對于那些在初始場景中已經鏈接的補丁，通過添加一個實際上已經存在的鏈接，連接不能增加，因此dM=0和varM=0。在概率連接模型(適用于PC)中，Conefor將計算盡可能多地改進每對補丁之間的直接連接(鏈接)的潛在(積極)影響(每次只改進一個)。在這個概率模型翻譯分配每一對補丁j=1,這意味著力量或使用頻率之間的直接連接i和j(量化的j)將改善所有成對的補丁,除了那些已經j=1在最初的景觀。對于初始景觀中pij=1的這些斑塊，結果必然是dM=0,varM=0。對于其余的，每個鏈接的pij值的增加可能導致(盡管不一定)由dM或varM量化的連接的改進(如上所述，這種改進將對應于負dM和varM值)。在二元連接模型中，所有的鏈路增益在它們所代表的變化量上都是可比較的(添加在初始場景中不存在的鏈路，以評估其創建或恢復的潛在好處)。然而，在概率模型中，初始景觀中每個鏈接的pij的初始值在不同的鏈接中可能是非常可變的。當試圖直接比較該分析產生的dM或varM值時，這會帶來一些麻煩。概率模型中的不同鏈接，因為每個鏈接的強度或使用概率的實際變化幅度(用pij表示)對于每個鏈接可能會有很大的不同。例如，在最初的場景中，與在初始場景中有pij=0.9的另一個鏈接獲得相同的dM=10%的鏈接，獲得的dM=10%是不一樣的。在試圖解釋和總結這種概率連接模型的鏈接改進分析結果時，必須考慮到這一點。注意，不是所有由“鏈接改進”選項設置的鏈接更改都可以認為是現實的。例如,如果你的傳播能力分析物種在幾百米的范圍,這將是當然不現實的考慮,j可以提高多達兩個相隔數百公里的補丁,無論增加多少景觀基質的滲透率或人們頭腦你可以實現。然而，鏈接改進選項將評估這種假設的(和不現實的)改進在使用該鏈接(如pij所示)的強度或可行性方面的效果，其方式與所有其他對補丁相同。因此，合成的dM或varM值可能僅適用于圖中鏈接(直接連接)總數的一小部分。為了克服這個問題，并執行與景觀中鏈接的潛在更改相關的更精細和詳細的分析，您可以考慮“鏈接更改”模式，在下一小節中進行描述。最后，與上面描述的“鏈接刪除”分析一樣，如果選擇“鏈接改進”選項，也有可能使用“減少計算”選項(參見Conefor接口中的鏈接重要性選項框)。這種“減少計算”選項允許指定一個最大距離(如果連接文件是一個距離文件)或最低概率(如果連接文件是一個概率文件),這樣的計算只對補丁(鏈接),距離不超過指定的最大值或概率j不小于指定的最小值。注意，在這種情況下，其余的鏈路(那些距離較大或概率較小的弱鏈路)將得到dM=0和varM=0，因為在分析中沒有對它們進行評估;這并不意味著如果“減少計算”選項沒有被選擇，它們將為零。14.4。鏈接更改:用戶在鏈接中定義的更改如何轉換為連接的增益或損耗這是鏈接重要性分析中最強大、最靈活的模式。但是，與鏈接刪除和鏈接改進選項相比，它需要用戶提供額外的輸入信息。如果選擇“Linkchange”選項，那么Conefor將要求連接文件有4列而不是通常情況下的3列(實際上，這是連接文件需要有4列而不是3列的惟一處理選項)。前三列是一樣的在任何連接申請Conefor:ID的節點,節點j的ID,一個值(通常是某種形式的距離或直接傳播概率j)描述之間的連接節點i和j在最初的景觀(參見手冊2.2版詳情)。“Linkchange”選項所需的第四列也將包含一個值，該值表示節點i和j之間的連接，但該值將對應于節點i和j之間的新距離或直接分散概率，從而導致給定的更改場景。第四列的值與第三列的值一般不同;第四列的距離比第三列的距離小或概率大，將對應于鏈接的質量或強度在給定的更改場景中，兩個補丁之間增加;第四列的距離比第三列的距離大或者概率小意味著這兩個斑塊之間的聯系變弱了。對于給定的景觀和“鏈接更改”分析中的每個鏈接，所有類型的組合和不同類型的更改都是可能的。例如,一些連接可能會改善,其他一些可能會降低它的質量甚至完全消失,和其他一些鏈接可能遭受同樣沒有變化的分析,根據特定值中指定的每個鏈接的第三和第四列連接文件。顯然，對于連接文件的第三和第四列中具有相同值的鏈接，結果必然是dM=0和varM=0，因為這意味著該特定鏈接不會發生任何更改(計算)。還可以使用鏈接文件的連接文件”鏈接改變”選項,盡管在這種情況下只能計算二進制指標如IIC,唯一可能的變化對個人被完全消失的一個現有的鏈接或鏈接的鏈接(直接連接)補丁之間并不存在在最初的風景。因此,在這種情況下,第三和第四列連接的文件只能包含0或1每一對補丁,指示是否存在聯系(1)(0)之間的補丁在最初的景觀(第三列),如果它將丟失,獲得或將保持不變在給定場景中(第四列中指定連接的文件)。在“鏈接變化”分析Conefor將取代一雙特殊的值連接文件的補丁在第三列第四列中的值的文件,一般來說可能使一個鏈接出現或消失(二進制連接模型)或改變鏈接的j值相關聯(概率連接模型)。Conefor將重新計算網絡連接(根據Mafter對整個景觀的值進行評估)，然后將報告結果dM或varM值。這個更改將只對單個鏈接(一次一個)執行，因此dM或varM的值對應于連接更改(要么增加，要么減少)，該更改將在給定的鏈接中實現，而其他的都保持不變。如上所述，對于鏈路重要性分析的其他模式，IIC或PC測量的連接損失將對應正的dM和varM值，而連接收益將對應負的dM或varM值(這些變量的公式見第9節)。更改評估通過此選項可能對應于一個有效的距離增加或抵抗由于強化景觀矩陣的某一部分(例如高速公路的發展或其他類型的障礙),增加景觀的滲透或人們頭腦矩陣,或許多其他類型和強度的變化,尤其是可能感興趣的案例研究和地區按照給定的連通性分析的目標。注意,事實上“鏈接刪除”和“改進”鏈接選項只是特殊情況下的“鏈接變化”形態,但與前兩個不需要包括一個連接文件中第四列(因為他們假設所有評估鏈接變化完全相同的狀態,這是失蹤的鏈接或無限改進質量的一個鏈接,分別)。如果您使用“鏈接更改”選項，并且您的連接文件是一個距離文件，那么如果您將第四列全部設置為0，那么“鏈接更改”結果將與“鏈接改進”的結果相同。如果在相同的情況下，您將第四列中的所有值設置為任意大(無限)值，那么“鏈接更改”的結果將與“刪除鏈接”的結果相同。如果你的連接文件概率文件或鏈接文件,然后第四列中的所有值都設置為零將提供相同的結果在“鏈接刪除”選項,而第四列中的所有值都設置為一個將提供相同的結果在改善“鏈接”選項。“減少計算”選項不適用于“鏈接更改”分析(它只影響“刪除鏈接”和“鏈接改進”模式)。15。計算精度(高或標準)Conefor作為輸出的值的計算精度可以設置為“高”或“標準”。在版本2.2中使用了標準精度(在該版本中不可能進行任何選擇)，這對于要使用該版本的應用程序來說是可以的。但是，當IIC和PC的三個分量(intra、flux、connector)分別計算(如本新版本提供的)時，最好能提供更高的精度，以便為這三個分量提供更準確的結果，特別是在大型圖形/棲息地網絡中。因此，在這個新版本中，高精確度是默認值。高精度會消耗更多的內存和處理時間需要稍微高于標準的精度(取決于網絡和計算機的大小特征),但這并沒有什么顯著差異對于大多數的用戶(除非你的網絡太大或RAM內存太小,你被迫使用標準的精度,使處理可行)。總之,你可以改變標準精度只有你不需要分離分數值(即你只會使用整個索引值M或總dMvarM值為每個節點),或者你的電腦不能夠處理更要求高精度的圖像模式。16。其他關于Conefor2.6的評論保存DBF文件的選項在這個新版本中被禁用，但是如果需要，您可以使用任何其他外部軟件將文本文件(結果的輸出格式為Conefor)轉換為DBF格式。幾乎任何軟件包(GIS、電子表格、統計數據等)都能夠直接讀取Conefor生成的文本文件。只要每個列都有一個適當的頭(Conefor生成的一些文件已經為每個列包含了這些頭)，ArcGIS就能夠直接打開并將它們作為表使用;對于其他的文本編輯器，您可以輕松地將它們添加到新的(第一行)文本中)。在ArcGIS的特殊情況下，列標題的名稱中不允許包含括號之類的字符;這意味著您應該手動更改節點重要性文件(例如BC_IIC和BC_PC)中的BC(IIC)或BC(PC)指標的標頭，如果選擇這些指標進行計算，那么在您可以在ArcGI