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文檔簡介

新冠病毒的檢測方法2020.05SARS-CoV-2檢測方法核酸檢測實時熒光PCR環介導等溫擴增技術(LAMP)重組酶聚合酶擴增技術(RPA)基于Cas酶的檢測技術免疫檢測膠體金技術檢測方法¥1

70SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測基于RNA的RNA聚合酶RNA-dependentRNApolymerase包膜蛋白基因Envelopegene核衣殼蛋白Nuclearcapsid主要檢測的基因¥1

70SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測熒光RT-PCR當完整的探針與目標序列配對時,熒光基團發射的熒光因與3’端的淬滅劑接近而被淬滅。但在進行延伸反應時,聚合酶的5'外切酶活性將探針進行酶切,使得熒光基團與淬滅劑分離,因而熒光基團發射出熒光信號。隨著擴增循環數的增加,釋放出來的熒光基團不斷積累。因此熒光強度與擴增產物的數量呈正比關系缺點:如需快速精準升降溫的PCR儀器,溫度范圍一般要求0~100℃,且反應時間長,操作要求高等。針對目的基因6個區域設計出4種特異引物F3、B3、FIP、BIP,在嗜熱脂肪芽孢桿菌鏈置換DNA聚合酶(BstDNApolymerase)的作用下,可在60~65℃實現恒溫擴增,15~60min即可實現109~1010倍的核酸擴增。具有操作簡單、終點可視檢測等提點。SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測環介導等溫擴增技術(loop-mediatedisothermalamplification,LAMP)¥1

70SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測等溫擴增技術之重組酶聚合酶擴增技術(Recombinase?Polymerase?Amplification,RPA)RPA技術主要依賴于3種酶:能結合單鏈核酸(寡核苷酸引物)的重組酶、單鏈DNA結合蛋白(SSB)和鏈置換DNA聚合酶。最佳溫度為37℃~42℃,擴增反應所需時間少于30min。重組酶首先與引物結合形成的蛋白質-引物復合體,能在雙鏈DNA中定位同源序列,發生鏈交換反應并啟動DNA合成,達到目標區域指數式擴增,被替換的DNA鏈與SSB結合,以防止進一步替換。整個過程一般可在10min之內獲得可檢出水平擴增的產物SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測

LAMP

RPASARS-CoV-2的檢測——核酸檢測基于Cas酶檢測技術之SHERLOCK技術

CRISPR/Cas系統是原核生物的適應性免疫系統,可保護古生菌和細菌免受外來遺傳因素(如噬菌體和質粒)的干擾。CRISPR/Cas存在于幾乎所有的古細菌和約40%的細菌中,但不存在于真核生物或病毒中。目前CRISPR/Cas系統分為2類,6型和30多種亞型。在Cas蛋白和CRISPRRNA(crRNA)形成效應復合物時,1類系統(包括Ⅰ型,Ⅲ型和Ⅳ型)需要多個Cas蛋白,而2類系統(包括Ⅱ型,Ⅴ型和Ⅵ型)只需單個多結構域的Cas蛋白。Cas13屬于2類CRISPR系統的Ⅵ型,只切割單鏈而不切割雙鏈RNA,當Cas13蛋白與crRNA結合后,形成的RNA靶向效應復合物具有RNA核糖核酸酶(RNase)活性,已成為可編程識別RNA的強大工具。基于Cas13非特異的RNA切割能力,Cas13已被開發為體外核酸檢測的高靈敏度診斷工具。該系統依賴于RNA熒光報告探針,其在RNA被切割之前不發射任何熒光,當Cas13a被靶RNA激活后切割RNA熒光報告探針從而發出熒光,由于Cas13a強大的RNase活性,一個靶RNA激活的Cas13a可切割數以千計的RNA探針,對反應體系里的靶RNA進行信號放大檢測。SHERLOCK(specifichigh-sensitivityenzymaticreporterunlocking)是2017年基于RPA技術開發的一種靶向RNA的新核酸診斷平臺,將CRISPR相關酶Cas13a改造成快速、廉價、高靈敏度的診斷工具。SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測基于Cas酶檢測技術之SHERLOCK技術

Cas13a在crRNA引導下,偵檢到靶RNA序列并結合目標序列時,會轉入一種酶促“激活”狀態,其無區分的RNA酶活性,會切割RNA報告分子當該報告分子被切割時,會釋放可檢測到的熒光信號.通常,為提高分析靈敏度,樣品中雙鏈DNA(dsDNA)或RNA首先要經RPA或RT-RPA擴增來提高樣品中目標含量水平,并與T7轉錄相結合,將擴增DNA轉化為RNA.經上述處理,SHERLOCK的靈敏度達到渺摩爾級(10-18mol/L),特異性達到單堿基錯配.SARS-CoV-2的檢測——核酸檢測基于Cas酶檢測技術之DETECTR技術

Cas12酶家族在crRNA的引導下,與目標序列結合后,便切換為激活狀態,瘋狂切割體系內其他的單鏈DNA(ssDNA)。Cas12a這一特點可被用于分子診斷領域,Doudna教授借鑒SHERLOCK技術,也引入RPA擴增步驟,創造RPA+Cas12a新的核酸分子檢驗技術,命名為DETECTR.與SHERLOCK相比,DETECTR無需將擴增后的DNA產物轉錄到RNA.SARS-CoV-2的檢測——免疫檢測膠體金免疫檢測原理圖膠體金標記的能與IgM/IgG抗體特異結合的抗原固定在結合墊上,NC膜上檢測線處固定抗人IgM/IgG抗體,質控線處固定特異識別重組抗原His/Fc等標簽抗體.當待測樣品滴加至樣品墊加樣處,樣品向試紙吸水墊處移動,如含有IgM/IgG抗體,抗體與結合墊上的金標抗原結合,形成抗原抗體復合物,隨后被檢測線上的抗人IgM/IgG抗體捕獲,并顯色.若待測樣品中不含IgM/IgG抗

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