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文檔簡介
PubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫檢索方法與技巧1主要內(nèi)容PubMed概況
PubMed數(shù)據(jù)來源PubMed檢索機(jī)制PubMed檢索運(yùn)算符PubMed檢索方法結(jié)果的顯示、打印、保存其他輔助功能21.PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu):美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI)1997年6月開始向全球開放特色:具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn),部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文。32.PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE:
[pubmed-indexedformedline]InProcessCitations:每天收錄,尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations:由出版商提供的電子文獻(xiàn),每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。43.PubMed檢索機(jī)制自動轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)5對于輸入的檢索詞,PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對照匹配和轉(zhuǎn)換,再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是:MeSH表期刊刊名表短語表作者索引如果在以上4個表中都找不到相匹配的詞,PubMed將把短語分開,以單詞為單位,分別重復(fù)以上的過程,檢索時各個詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞,則用單個詞在所有字段查找,各個詞之間也是AND邏輯關(guān)系。3.1自動轉(zhuǎn)換匹配功能6人重組三葉因子(humanrecombinanttrefoilfactor)
("humans"[MeSHTerms]OR"humans"[AllFields]OR"human"[AllFields])
ANDrecombinant[AllFields]
AND("trefoilfactor"[SupplementaryConcept]OR"trefoilfactor"[AllFields])74.PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符8邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND:
檢索式寫成AandB,表示文獻(xiàn)中同時包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。
AIDSandtherapy②邏輯“或”運(yùn)算OR:
檢索式寫成AorB,表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時包含檢索詞A和B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。
AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運(yùn)算NOT:
檢索式寫成AnotB,表示包含檢索詞A同時不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。
HepatitisnotAnimal9IP地址:PubMed網(wǎng)址10基本檢索高級檢索主題檢索臨床咨詢115.PubMed檢索方法5.1基本檢索5.2高級檢索5.3主題檢索5.4臨床咨詢125.1基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊13關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語:⑴輸入任意關(guān)鍵詞:livercancer、Lungcancer;⑵帶有雙引號”
”作為短語檢索:”cancertherapy”;⑶帶有連接號”-”作為一個詞組檢索:interleukin-6。限制檢索字段:如livercancer[ti]作者:SmithJ、僅知道作者姓,則必須加上字段標(biāo)識,如:Smith[au]2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如:JoshuaLederberg5.1基本檢索14期刊刊名:⑴可用期刊全稱:GENETHERAPY[TA];
⑵可用期刊簡稱:JAMA[TA];(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)
復(fù)雜表達(dá)式:livercancerANDtherapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索:livercancerANDhasabstract5.1基本檢索15分析該檢索課題,包含兩個方面:肝癌:livercancer;酒精:alcohol兩個主題之間的邏輯關(guān)系是AND,即livercancerANDalcohol
基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系16基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系輸入:livercancerANDalcohol17“肝癌和酒精的關(guān)系”的基本檢索結(jié)果185.2高級檢索高級檢索195.2高級檢索20分析該檢索課題,包含兩個方面:作者為:馬大龍(madl);作者單位為:北京大學(xué)(pekinguniversity)。
高級檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)21高級檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入:madl輸入:pekinguniversity22高級檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)235.3主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性,利用主題詞進(jìn)行的研究,對提高查全率、查準(zhǔn)率會有相當(dāng)?shù)膸椭?。點(diǎn)擊MeSHDatabase打開主題檢索界面24高級檢索主題檢索基本檢索255.3主題檢索26主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)分析該檢索課題,有2個概念:長春新堿(Vincristine)、白血?。╨eukemia):對長春新堿來說是利用其治療疾病,故其應(yīng)組配副主題詞“治療應(yīng)用(therapeuticuse)”;對白血病來說是利用藥物來治療,故其應(yīng)組配副主題詞“藥物療法(drugtherapy)”。同時這兩個概念之間是AND的關(guān)系。27主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用28主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用29主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用副主題詞30主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用31主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用32主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法33主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法34主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法35主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法36主題檢索舉例:
長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)375.4臨床咨詢和系統(tǒng)評價可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn),如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等;也可以用它來檢索臨床實(shí)踐過程中遇到的一些具體問題,如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗(yàn)、循證醫(yī)學(xué)、實(shí)踐指導(dǎo)以及有關(guān)遺傳學(xué)方面的問題等。
385.4臨床咨詢和系統(tǒng)評價臨床咨詢系統(tǒng)評價檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究方面的文獻(xiàn)39406.結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印416.1結(jié)果的顯示顯示格式:系統(tǒng)提供的顯示格式很多,一般較常用的有以下4種:(1)Summary:為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語種等。(2)Abstract:顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外,還包括摘要信息,以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。42(3)MEDLINE:以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。6.1結(jié)果的顯示436.1結(jié)果的顯示44保存記錄在“sendto”下拉菜單中選擇“File”,可完成將記錄保存為文件。選擇“E-mail”,則可將結(jié)果發(fā)送至郵箱。在檢索結(jié)果顯示頁面可將某一次檢索的全部記錄或標(biāo)記記錄保存;而“Clipboard”頁面可用于保存一次或多次檢索的結(jié)果記錄。6.2檢索結(jié)果的保存
456.2檢索結(jié)果的保存
467其他輔助功能7.1檢索策略的存儲和調(diào)用7.2全文鏈接7.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接477.1檢索策略的存儲和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結(jié)果487.2全文鏈接-
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