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文檔簡(jiǎn)介
1本文件規(guī)定了營(yíng)養(yǎng)基因組學(xué)的檢測(cè)方法、試劑和儀器、樣本的采集和檢測(cè)、質(zhì)量控制、結(jié)果判讀、檢測(cè)報(bào)告出具及基因位點(diǎn)的臨床意義解讀。本文件適用于醫(yī)院、第三方實(shí)驗(yàn)室的臨床研究、科研、常規(guī)檢測(cè)等營(yíng)養(yǎng)基因組學(xué)項(xiàng)目的結(jié)果解讀。2規(guī)范性引用文件本文件沒(méi)有規(guī)范性引用文件。3術(shù)語(yǔ)和定義下列術(shù)語(yǔ)及定義適用于本文件。3.1脫氧核糖核酸deoxyribonucleicacid,DNA核酸的一種,是由特殊序列的脫氧核糖核苷酸單元(dNTP)構(gòu)成的多聚核苷酸,起攜帶遺傳信息的功能。DNA為一種雙鏈分子,通過(guò)核苷酸堿基對(duì)間的氫鍵維系。DNA包含的類(lèi)型的DNA:來(lái)自染色體的基因組DNA(gDNA)和線粒體DNA(mtDNA)。3.2基因gene遺傳物質(zhì)的最小功能單位,是指具有一定生物學(xué)意義的一段DNA。3.3單核苷酸多態(tài)性Singlenucleotidepolymorphism由單個(gè)核苷酸-A、T、C或G的改變而引起的DNA序列的改變,造成包括人類(lèi)在內(nèi)的物種之間染色體基因組的多樣性。3.4營(yíng)養(yǎng)基因組學(xué)Nutrigenomics研究營(yíng)養(yǎng)素和植物化學(xué)物質(zhì)對(duì)機(jī)體基因的轉(zhuǎn)錄、翻譯表達(dá)及代謝機(jī)理的科學(xué)。3.5聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法polymerasechainreaction,PCR一種分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的DNA片段,可看作生物體外的特殊DNA復(fù)制。23.6實(shí)時(shí)熒光定量PCR法real-timequantitativepcr,qPCR在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中加入熒光基團(tuán),以熒光信號(hào)累積實(shí)時(shí)檢測(cè)每次PCR循環(huán)后產(chǎn)物總量,進(jìn)而對(duì)待測(cè)樣品中的目的序列進(jìn)行定量分析的方法。3.7原位雜交法insituhybridization,ISH用特定標(biāo)記的已知堿基序列核酸作為探針與組織、細(xì)胞中待檢測(cè)核酸按堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則在原位進(jìn)行特異性結(jié)合,形成雜交體,然后用與標(biāo)記物相應(yīng)的監(jiān)測(cè)系統(tǒng),通過(guò)免疫組織化學(xué)方法在被檢測(cè)核酸原位進(jìn)行細(xì)胞內(nèi)核酸定位。3.8Sanger測(cè)序Sangersequencing英國(guó)人FrederickSanger發(fā)現(xiàn)在DNA復(fù)制過(guò)程中摻入ddNTP,會(huì)產(chǎn)生一系列末端終止DNA鏈,能通過(guò)電泳按長(zhǎng)度分辨。由此誕生了以Sanger命名的測(cè)序原理即雙脫氧鏈終止法測(cè)序原理。3.9臨床實(shí)驗(yàn)室自建項(xiàng)目LaboratoryDevelopedTest,LDT臨床實(shí)驗(yàn)室自建項(xiàng)目是指醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)部門(mén)自行開(kāi)發(fā)建立,并自發(fā)在實(shí)驗(yàn)室和臨床進(jìn)行技術(shù)研發(fā)論證,遵循質(zhì)量控制體系和管理標(biāo)準(zhǔn)的檢測(cè)方法。4技術(shù)要求4.1營(yíng)養(yǎng)基因組學(xué)基因檢測(cè)4.1.1檢測(cè)方法選擇常用于靶標(biāo)檢測(cè)的方法包括實(shí)時(shí)熒光定量PCR法、PCR-電泳分析法、PCR-高分辨率熔解曲線法、PCR-核酸質(zhì)譜法、原位雜交(ISH)法、PCR-基因芯片法、PCR-Sanger測(cè)序法、PCR-焦磷酸測(cè)序法、高通量測(cè)序法。應(yīng)根據(jù)國(guó)家的體外診斷試劑分類(lèi)要求和實(shí)驗(yàn)室基因檢測(cè)的用途選擇合適的檢測(cè)方法。34.1.2試劑選擇和要求臨床檢測(cè)試劑應(yīng)為國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NationalMedicalProductsAdministration,NMPA)批準(zhǔn)的試劑盒,如果無(wú)法滿足臨床檢測(cè)需求,可采用符合國(guó)家《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)LDT研制技術(shù)規(guī)范(試行版)》要求的實(shí)驗(yàn)室自用方法(Laboratorydevelopedtest,LDT)試劑,所用標(biāo)準(zhǔn)品或標(biāo)準(zhǔn)參考物應(yīng)符合國(guó)家衛(wèi)生健康委臨床檢驗(yàn)中心推薦的標(biāo)準(zhǔn)和要求?!獙?duì)于國(guó)家批準(zhǔn)的商業(yè)化試劑盒,可按照說(shuō)明書(shū)進(jìn)行性能驗(yàn)證。——對(duì)于LDT試劑,應(yīng)按照《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)質(zhì)量保證指南(試行版)》和《個(gè)體化醫(yī)學(xué)檢測(cè)LDT研制技術(shù)規(guī)范(試行版)》的要求進(jìn)行性能驗(yàn)證。4.1.3儀器選擇和要求實(shí)驗(yàn)室可參考生產(chǎn)商提供的操作說(shuō)明書(shū)編寫(xiě)書(shū)面的、有案可查的預(yù)防性維護(hù)及校準(zhǔn)計(jì)劃,確定儀器設(shè)備的維護(hù)周期,建立儀器設(shè)備日常維護(hù)的標(biāo)準(zhǔn)操作程序(StandardOperatingProcedure,SOP)。——用于基因擴(kuò)增及產(chǎn)物分析的機(jī)器應(yīng)有省級(jí)及以上藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的注冊(cè)號(hào)?!獙?duì)于某些計(jì)量分析儀器,應(yīng)依照我國(guó)計(jì)量法規(guī)定,由計(jì)量檢定機(jī)構(gòu)定期進(jìn)行校驗(yàn),并保存好校驗(yàn)證書(shū)?!獞?yīng)對(duì)加熱系統(tǒng)及冰箱等設(shè)備的溫度進(jìn)行監(jiān)測(cè)?!獌x器維護(hù)過(guò)程中要注意清潔劑的使用,尤其是儀器的光路系統(tǒng)?!颗_(tái)儀器應(yīng)配備專(zhuān)用的清潔工具?!诶袃x器的維護(hù)和保養(yǎng)后,應(yīng)填寫(xiě)儀器設(shè)備維修保養(yǎng)記錄表。4.2檢測(cè)流程4.2.1分析前樣本處理樣本的采集、運(yùn)送和保存應(yīng)按照NMPA批準(zhǔn)的檢測(cè)試劑說(shuō)明書(shū)和LDT試劑的SOP嚴(yán)格進(jìn)行。4.2.2樣本的采集——用于基因檢測(cè)的樣本類(lèi)型主要為全血樣本,也可以為唾液樣本。4——靜脈血液采集之前應(yīng)按要求對(duì)預(yù)采血的部位徹底消毒?!獦颖静杉枰诿荛]、一次性采樣系統(tǒng)中完成,所用的材料如注射器、棉簽、——無(wú)論采集哪種類(lèi)型的樣本,采樣時(shí)都必須戴手套,以避免樣本中病原微生物感4.2.3DNA核酸提取4.2.4靶標(biāo)檢測(cè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行實(shí)驗(yàn)室SOP,不能擅自修改,以保證檢測(cè)各環(huán)節(jié)標(biāo)準(zhǔn)、有序地進(jìn)行,確保檢測(cè)結(jié)果的真實(shí)性、準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。4.3個(gè)體化營(yíng)養(yǎng)建議4.3.1參考標(biāo)準(zhǔn)參考美國(guó)食品藥品管理局(FoodandDrugAdministration,FDA)、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心(ChineseCenterforDiseaseControlandPrevention,CDC)和Pubmed等發(fā)布的最新指南、專(zhuān)家共識(shí)或公開(kāi)發(fā)表的高質(zhì)量臨床研究,參照營(yíng)養(yǎng)基因組學(xué)檢測(cè)結(jié)果,結(jié)合慢病患者個(gè)體臨床實(shí)際診療情況,給出個(gè)體化營(yíng)養(yǎng)和注釋。4.3.2基因結(jié)果臨床解釋綜合分析患者的健康問(wèn)題,結(jié)合基因檢測(cè)結(jié)果,對(duì)患者本身存在的飲食問(wèn)題進(jìn)行干預(yù)。飲食建議會(huì)跟隨客戶的健康狀況的變化而變化,有必有進(jìn)行周期性隨訪。4.3營(yíng)養(yǎng)相關(guān)檢測(cè)位點(diǎn)表5鹽NPPA鈣鐵鋅碘鈉鉀鎂NBPF3表1.營(yíng)養(yǎng)相關(guān)檢測(cè)位點(diǎn)表6參考文獻(xiàn)[1]Nutrigenomics:the[3]DronamrajuK.Profilesingenetics:Ar[4]孫長(zhǎng)顥.分子營(yíng)養(yǎng)學(xué)的定義及發(fā)展簡(jiǎn)史[J].營(yíng)養(yǎng)健康新觀察,2004[6]RayS.PersonalizedModificationofBreastMiCommunication[J].CurrentResearchinNutrition&Food
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