大白菜主要農藝性狀QTL定位及葉球發育相關基因表達分析大白菜（BrassicarapaL.ssp.pekinensis,AA）屬于十字花科蕓薹屬蕓薹種,是我國最重要的蔬菜作物。大白菜種質資源豐富,生態類型多樣,且葉片及葉球發育等重要農藝性狀多為數量性狀,遺傳基礎復雜,有必要在分子水平研究這些性狀的調控機制。近年,大白菜葉片和葉球發育相關性狀的分子標記和部分候選基因的鑒定研究初見報道,但對關鍵基因的認知及其調控作用尚不清楚;大白菜chiifu401全基因組序列分析顯示,生長素（AUXIN）相關基因可能是影響形態器官發育的重要基因家族。這些信息為系統開展大白菜葉片及葉球發育等重要農藝性狀的基因定位和表達調控研究提供了條件。本研究以179份不同基因型大白菜為試材,對形態學性狀進行了變異分析和關聯作圖基因定位;以不結球白菜PC-101和結球大白菜CC-48為親本構建的雙單倍體DH88和F₂兩個分離群體為試材,在構建高密度分子遺傳圖譜的基礎上,結合群體單株不同生育期的葉片及葉球發育等農藝性狀的表型變異分析,進行了大白菜目標性狀的QTL（數量性狀位點）定位研究;以8份代表不同類型（合抱、疊抱、束心和不結球）和不同結球性（早、中、晚）的大白菜基因型為試材,選取與葉球發育及生長素相關的10個基因,分析了在8個發育時期的實時定量（qRT-PCR）表達模式。旨在揭示大白菜葉片和葉球發育等重要農藝性狀的遺傳變異特點,檢測調控這些性狀的主要染色體區域,發掘與QTL共分離的候選基因和分子標記,解析所選候選基因的表達調控模式。獲得的主要結果如下:1.179份不同基因型大白菜的33個形態學性狀的表型變異分析表明,葉球抱合方式的變異系數最高,為66.41%;其次,變異系數在40%以上的性狀有8個,依次為中肋橫切面形狀、葉球的外露性、短縮莖形狀、短縮莖縱徑、球形指數、中肋色、單株總重和葉球內葉色澤。葉球重也表現出了較大的變異,其變異系數為39.2%。而結球性、外葉寬、外葉長和株展的變異系數較低。2.通過對33個表型性狀和161個InDel和SSR標記的關聯分析,檢測到分布于9個連鎖群的36個標記位點與20個性狀顯著相關,18個標記與性狀關聯度極高。其中,A03-2-1與短縮莖形狀高度相關;A10-3-2和A10-3-3與抽薹性高度相關;A01-S156#01、A05-4-2、A05-8-1、A05-8-3、A06-1-2、A06-S24#01和A10-2-2與球葉抱合方式高度相關;A06-S24#01與球葉數高度相關;A01-S155#03與葉球橫徑和外葉寬均高度相關;A03-2-2、A04-8-2和A06-1-2與中肋色高度相關;A04-10-2、A06-1-2和A10-2-2與球形指數高度相關;A03-2-2和A06-1-2與外葉色高度相關;A04-S60#01和A06-S24#02與短縮莖側芽萌發能力高度相關;A05-8-3與中肋橫切面形狀高度相關;A04-8-1與葉球縱徑高度相關;A10-2-3與結球性高度相關。另外,檢測到13個標記同時與2個以上的性狀關聯,其中A03-2-2、A06-1-2均與外葉色和中肋色相關;A06-S24#01均與球葉抱合方式和球葉數相關;檢測到10個性狀分別具有3個以上的分子標記,與球葉抱合方式相關的分子標記數最多,為13個。3.利用DH88,構建了一張含1603個SNP標記、10個連鎖群的遺傳圖譜,總長度為1469.5cM,標記間平均距離為0.92cM;利用F₂群體,構建了一張含135個標記（99個InDel標記和36個SNP標記）、10個連鎖群的遺傳圖譜,總長度為1145.7cM,標記間平均距離為8.93cM。二者存在36個共同的SNP標記,分別含有899個和64個基因特異標記。DH88和F₂群體遺傳連鎖圖譜上標記順序總體上與其物理圖譜順序基本一致。4.QTL分析表明,在DH88和F₂群體中共檢測到26個性狀（10個葉球發育相關性狀、13個葉片發育相關性狀和3個其它性狀）的QTL位點95個,分布于10個連鎖群。其中,與葉球發育相關性狀的QTL48個,與葉片發育相關性狀的QTL37個,控制蓮座期葉數、葉色和葉毛3個性狀的QTL10個;同時檢測到控制4個以上葉片發育相關性狀的主要染色體區域6個,分別位于連鎖群A03上部、A03中部、A04中部、A06中部、A08下部和A09下部;控制結球相關性狀的主要染色體區域4個,分別位于A05中部、A06中部、A08下部和A09下部。檢測到葉片及葉球相關性狀的85個QTL區域內可能相關的候選基因58個。在葉毛QTL區域檢測到大白菜葉毛發育基因BrGL1,距離最近標記163Kb。5.從10個候選基因的相對表達量和表達時期分析,基因BSA-g4在8份材料中的總體相對表達量最高,其次是Bra015396、BSA-g1和BSA-g2,BSA-g3、Bra023570、Bra008613、Bra033844和Bra005465的相對表達量較低,最低的是Bra002479;所選基因在8份材料的相對表達量差異主要體現在播種后29-60天（苗期、蓮座期和結球初期）,苗期或蓮座期的相對表達量較高,而播種后73天和88天（結球中后期）很低;其中8個基因最高相對表達量在播種后29和36天（以苗期為主）,2個基因的最高相對表達量為在播種后36天和40天（以蓮座期為主）。6.從10個候選基因的表達模式分析,基因在3個不同發育階段（29和36天/苗期;40、46、53和60天/蓮座期和結球初期;73和88天/結球中后期）的表達方式包括4種類型:5個基因表現為高-中-低,相對表達量播種后29和36天較高;2個基因表現為高-高-低,相對表達量播種后29-60天較高;2個基因表現為高-低-低,相對表達量播種后29和36天較高;1個基因表現為低-中-低,相對表達量播種后40-60天較高。7.從10個候選基因調控葉球發育特點分析,3個基因BSA-g1、BSA-g2和BSA-g4在蓮座期和結球初期相對表達量有明顯增加,可能與葉球發育相關;2個基因BSA-g3和Bra023570在苗期相對表達量較高,基因早期表達可能與葉球抱合方式或結球早晚有一定相關性;3個基因Bra008613、Bra005465和Bra