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文檔簡介
代謝調節與代謝工程演示文稿代謝調節與代謝工程本文檔共45頁;當前第1頁;編輯于星期一\9點39分優選代謝調節與代謝工程本文檔共45頁;當前第2頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(1)同功酶調節——isoenzyme定義:催化相同的生化反應,而酶分子結構有差別的一組酶。意義:在一個分支代謝途徑中,如果在分支點以前的一個較早的反應是由幾個同功酶催化時,則分支代謝的幾個最終產物往往分別對這幾個同功酶發生抑制作用。———某一產物過量僅抑制相應酶活,對其他產物沒影響。舉例:大腸桿菌的天冬氨酸族氨基酸合成的調節本文檔共45頁;當前第3頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程本文檔共45頁;當前第4頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(2)協同反饋抑制定義:分支代謝途徑中幾個末端產物同時過量時才能抑制共同途徑中的第一個酶的一種反饋調節方式。舉例:谷氨酸棒桿菌(Corynebacteriumglutamicum) 多粘芽孢桿菌(Bacilluspolymyxa) 天冬氨酸族氨基酸合成中天冬氨酸激酶受賴氨酸和蘇氨酸的協同反饋抑制和阻遏。本文檔共45頁;當前第5頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程
天冬氨酸 E,R
4-磷酸天冬氨酸
E 天冬氨酸半醛 E,R E二氫吡啶二羧酸 同型絲氨酸 同型絲氨酸磷酸
E,R R O-琥珀酰同型絲氨酸 蘇氨酸
E,R六氫吡啶二羧酸 胱硫醚 2-酮丁酸
R
二氨基庚二酸 同型半胱氨酸
R
賴氨酸 甲硫氨酸 異亮氨酸天冬氨酸族
(谷氨酸棒桿菌)本文檔共45頁;當前第6頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程本文檔共45頁;當前第7頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程合作反饋抑制定義:兩種末端產物同時存在時,共同的反饋抑制作用大于二者單獨作用之和。舉例:在嘌呤核苷酸合成中,磷酸核糖焦磷酸酶受AMP和GMP(和IMP)的合作反饋抑制,二者共同存在時,可以完全抑制該酶的活性。而二者單獨過量時,分別抑制其活性的70%和10%。本文檔共45頁;當前第8頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(3)積累反饋抑制定義:每一分支途徑末端產物按一定百分比單獨抑制共同途徑中前面的酶,所以當幾種末端產物共同存在時它們的抑制作用是積累的,各末端產物之間既無協同效應,亦無拮抗作用。本文檔共45頁;當前第9頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程Try16%CTP14%氨甲酰磷酸13%AMP41%……積累反饋抑制——E.coli谷氨酰胺合成酶的調節本文檔共45頁;當前第10頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(4)順序反饋抑制一種終產物的積累,導致前一中間產物的積累,通過后者反饋抑制合成途徑關鍵酶的活性,使合成終止。舉例:枯草芽孢桿菌芳香族氨基酸合成的調節本文檔共45頁;當前第11頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程分支途徑上游的某個酶受到另一條分支途徑的終產物,甚至于本分支途徑幾乎不相關的代謝中間物的抑制或激活,使酶的活力受到調節,此即代謝互鎖。
(5)代謝互鎖本文檔共45頁;當前第12頁;編輯于星期一\9點39分微生物代謝調節機制的多樣性代謝調節與代謝工程本文檔共45頁;當前第13頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程避開微生物固有代謝調節,過量生產代謝產物工業發酵的目的:大量積累人們所需要的微生物代謝產物。代謝的人工控制:人為地打破微生物的代謝控制體系,使代謝朝著人們希望的方向進行。人工控制代謝的手段:改變微生物遺傳特性(遺傳學方法);控制發酵條件(生物化學方法);改變細胞膜透性;本文檔共45頁;當前第14頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程工業發酵的目的——大量地積累人們所需要的微生物代謝產物。在正常生理條件下
微生物通過其代謝調節系統吸收利用營養物質用于合成細胞結構,進行生長和繁殖,它們通常不浪費原料和能量,也不積累中間代謝產物代謝的人工控制人為地打破微生物的代謝控制體系,就有可能使代謝朝著人們希望的方向進行本文檔共45頁;當前第15頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(1)對于直線式代謝途徑:選育營養缺陷性突變株只能積累中間代謝產物
AaBbCcDdE
1)營養缺陷型菌株的應用
末端產物E對生長乃是必需的,所以,應在培養基中限量供給E,使之足以維持菌株生長,但又不至于造成反饋調節(阻遏或抑制),這樣才能有利于菌株積累中間產物C。遺傳學方法本文檔共45頁;當前第16頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程(2)分支代謝途徑:情況較復雜,可利用營養缺陷性克服協同或累加反饋抑制積累末端產物,亦可利用雙重缺陷發酵生產中間產物ABCDEFG本文檔共45頁;當前第17頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程各圖成立的條件:1.限量添加E;2.限量添加E;3.限量添加E和G;4.限量添加E和G;5.限量添加I“┄”表示營養缺陷突變位置;“≠”表示反饋調節解除要根據其不同反饋控制機制本文檔共45頁;當前第18頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程谷氨酸棒桿菌的代謝調節與賴氨酸生產E:表示反饋抑制;R:表示反饋阻遏
高絲氨酸脫氫酶(HSDH)天冬氨酸激酶(AK)賴氨酸生產菌:高絲氨酸缺陷型本文檔共45頁;當前第19頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程分支途徑——①賴氨酸發酵
(谷氨酸棒桿菌的代謝調控)本文檔共45頁;當前第20頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程分支途徑——②肌苷酸發酵
(IMP合成途徑的代謝調控)調控理論的實踐應用本文檔共45頁;當前第21頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程P124表3-12用營養缺陷型菌株生產的各種氨基酸本文檔共45頁;當前第22頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程2)抗反饋控制突變株的應用★抗反饋控制突變株——是指對反饋抑制不敏感或對阻遏有抗性,或兩者兼有之的菌株。★抗反饋控制突變株可以從終產物結構類似物抗性突變株和營養缺陷性回復突變株中獲得。★獲得方法及其原理:本文檔共45頁;當前第23頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程目標產物結構類似物賴氨酸S-(2氨基乙基)-L半胱氨酸-(AEC)蘇氨酸-氨基--羥基戊酸(AHV)異亮氨酸乙硫氨酸精氨酸D-精氨酸苯丙氨酸對氟苯丙氨酸本文檔共45頁;當前第24頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程營養缺陷型回復突變株調節酶的變構特性是由其結構基因決定的,如果調節酶的基因發生突變而失活,則有兩種可能性:一是催化亞基和調節亞基的基因均發生突變;另一種可能僅僅是催化亞基發生突變。一是催化亞基和調節亞基恢復到第一次突變前的活性水平。如果前者發生回復突變,則又有兩種可能性另一種是催化亞基得以恢復,而調節亞基喪失了調節的功能。營養缺陷型回復突變本文檔共45頁;當前第25頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程DABCEFG2.生物化學方法添加前體繞過反饋控制點:亦能使某種代謝產物大量產生(-)(-)(-)發酵與分離過程耦合:控制發酵的培養基成分:本文檔共45頁;當前第26頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程控制細胞膜滲透性使胞內的代謝產物迅速滲漏出去,解除末端產物的反饋抑制。(1).用生理學手段——直接抑制膜的合成或使膜受缺損如:在Glu發酵中把生物素濃度控制在亞適量可大量分泌Glu;控制生物素的含量可改變細胞膜的成分,進而改變膜透性;當培養液中生物素含量較高時采用適量添加青霉素的方法;再如:產氨短桿菌的核苷酸發酵中控制因素是Mn2+;Mn2+的作用與生物素相似。(2).利用膜缺損突變株——油酸缺陷型、甘油缺陷型如:用谷氨酸生產菌的油酸缺陷型,培養過程中,有限制地添加油酸,合成有缺損的膜,使細胞膜發生滲漏而提高谷氨酸產量。甘油缺陷型菌株的細胞膜中磷脂含量比野生型菌株低,易造成谷氨酸大量滲漏。應用甘油缺陷型菌株,就是在生物素或油酸過量的情況下,也可以獲得大量谷氨酸。本文檔共45頁;當前第27頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程控制細胞膜的通透性生物素是脂肪酸生物合成中乙酰CoA羧化酶的輔基,該酶催化乙酰CoA的羧化生成丙二酸單酰CoA,進而合成細胞膜磷脂的主要成分脂肪酸只要控制生物素的含量就可以改變細胞膜的成分,進而改變膜的通透性,影響到代謝產物的分泌。甘油缺陷型菌株添加適量的青霉素油酸缺陷型菌株本文檔共45頁;當前第28頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程谷氨酸發酵一、谷氨酸發酵菌種:CorynebacteriumpekinenseCorynebacteriumglutamicumBrevibacteriumflavu二、發酵機理:①谷氨酸以-酮戊二酸為碳架;當以糖質為發酵原料時,合成途徑包括EMP,HMP,TCA循環,乙醛酸循環等;②谷氨酸產生菌的-酮戊二酸脫氫酶活力很弱或缺少,而谷氨酸脫氫酶的活力要很高;③生物素是谷氨酸產生菌必需的一種維生素,在谷氨酸生物合成中起著重要作用,缺乏或量太高都會使谷氨酸合成受阻。生物素通過影響細胞膜的通透性而影響谷氨酸發酵。本文檔共45頁;當前第29頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程回補順序谷氨酸+NH3谷氨酸脫氫酶-酮戊二酸脫氫酶本文檔共45頁;當前第30頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程1.谷氨酸生產菌中存在2個糖酵解途徑EMP/HMP生物素參與糖代謝作用:增加糖代謝的速度而丙酮酸氧化脫羧的速度未改變丙酮酸積累乳酸積累2.α-酮戊二酸脫氫酶缺失TCA環阻斷,α-酮戊二酸積累本文檔共45頁;當前第31頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程3.四碳二羧酸的來源Δ在生產菌中檢出CO2固定反應酶活性磷酸烯醇丙酮酸(PEF)羧化酶和蘋果酸酶谷氨酸對糖的轉化率達到81.7%Δ
DCA循環標志酶:異檸檬酸裂解酶在谷氨酸發酵中,DCA環一方面可以作為TCA循環有缺陷時C4二羧酸的補充在谷氨基酸生產菌的生長中提供能量作用谷氨酸生成期中要封閉DCA環?通過DCA環提供C4二羧酸時谷氨酸對糖的轉化率僅為54.4%本文檔共45頁;當前第32頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程4.異檸檬酸脫氫酶活力強提供NADPH,用于還原α-酮戊二酸生成谷氨酸,形成氧化還原共扼體系5.氨的導入合成谷氨酸的反應有3種:α-酮戊二酸+NH4+NADPH+谷氨酸H2ONADP++谷氨酸脫氫酶α-酮戊二酸+天冬氨酸或丙氨酸谷氨酸轉氨酶谷氨酸α-酮戊二酸+α-酮戊二酸+谷氨酰胺NADPH+2谷氨酸NADP+谷氨酸合成酶本文檔共45頁;當前第33頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程生產菌中谷氨酸轉氨酶活力低,轉氨作用可以不考慮谷氨酸合成酶由于不受高濃度谷氨酸抑制,其作用值得重視谷氨酸脫氫酶是合成積累谷氨酸的主要酶氨的導入時生物素缺乏,NH4+影響糖代謝速度:提高糖代謝速度高效合成谷氨酸生物素充足時,NH4+不影響糖代謝速度6.谷氨酸合成的調節機制谷aa比天冬aa優先合成谷aa脫氫酶谷aa對其反饋抑制和反饋阻遏檸檬酸合成酶TCA的關鍵酶,受能荷調節,谷aa反饋阻遏,烏頭酸反饋抑制異檸檬酸脫氫酶α-酮戊二酸反饋抑制α-酮戊二酸脫氫酶先天喪失或微弱PEP受天冬aa反饋抑制,受谷aa和天冬aa反饋阻遏本文檔共45頁;當前第34頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程7.細胞膜通透性控制本文檔共45頁;當前第35頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程生物素阻斷脂肪酸的合成影響細胞膜的合成表面活性劑對生物素有拮抗阻斷脂肪酸的合成影響細胞膜的合成在對數生長期添加青霉素抑制細胞壁合成細胞膜損傷甘油缺陷型磷脂的合成受阻影響細胞膜的合成油酸缺陷型阻斷不飽和脂肪酸的合成影響細胞膜的合成本文檔共45頁;當前第36頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程三磷酸腺苷(ATP)是為許多反應提供能量的高能磷酸化物,細胞中的ATP、ADP和AMP含量處于相對平衡的狀態——細胞中的能量狀態能荷(Energycharge)能荷(Energycharge)來表示細胞中的能量狀態。能荷(EC)可用下式來表示:
系統中只有ATP時,EC值為1;只有AMP時,EC值等于0。本文檔共45頁;當前第37頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程能荷不僅能調節分解代謝形成ATP的酶活性,也能調節合成代謝利用ATP的酶活性。細胞能荷可調節酶活性高能荷抑制異檸檬酸脫氫酶和磷酸果糖激酶等檸檬酸和ATP都是磷酸果糖激酶活性的抑制劑,從而限制了葡萄糖的利用速度。有氧條件下,大量合成ATP,細胞能荷增加異檸檬酸脫氫酶受到ATP抑制,導致檸檬酸的積累本文檔共45頁;當前第38頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程在厭氧條件下,酵母菌無法通過呼吸鏈產生ATP,細胞能荷較低。ADP和AMP激活磷酸果糖激酶,使利用葡萄糖生產酒精的速度加快。本文檔共45頁;當前第39頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程第十二章工業微生物發酵產品調節點主要在三個激酶,即己糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶。它們是糖酵解途徑中的關鍵酶,是糖酵解途徑的三個不可逆步驟糖代謝的調節主要是能荷的控制本文檔共45頁;當前第40頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程無機聚磷酸的代謝與功能磷酸鹽和能量的儲存。重金屬陽離子的解毒作用。本文檔共45頁;當前第41頁;編輯于星期一\9點39分代謝調節與代謝工程活性污泥中的聚磷菌
生活在營養豐富的環境中,在將進入對數生長期時,為大量分裂作準備,細胞能從廢水中大量攝取溶解態的正磷酸鹽,在細胞內合成多聚磷酸鹽。細菌經過對數生長期而進入靜止期時,若環境中的磷源仍有剩余,細胞又有一定的能量時,仍能從外界吸收磷元素,
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