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文檔簡介
醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)“三基”訓(xùn)練
實(shí)驗(yàn)理論與技能分冊
北京老年病醫(yī)療研究中心
科研處編
首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院
200年
分子生物學(xué)
基本概念,基本理論
1、什么是分子生物學(xué)?
答:分子生物學(xué)是1945年由WilliamAstbury首次提出的,指的是對(duì)生物大分子的化學(xué)和物理結(jié)構(gòu)的研究。
隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,它已滲透到各個(gè)學(xué)科,成為各學(xué)科領(lǐng)域的不可分割的部分。
2、生物大分子主要包括哪幾類?
答:生物大分子主要有三類:蛋白質(zhì)、核酸和多糖,它們分別是氨基酸、核甘酸和糖的多聚體,分子量相
當(dāng)大(104?1012)?
3、蛋白質(zhì)的基本概念是什么?
答:蛋白質(zhì)是由若干個(gè)氨基酸構(gòu)成的多聚物,也稱為多肽。相鄰的氨基酸之間通過肽鍵相連。蛋白質(zhì)一端
具有一個(gè)游離的-Nh,稱作氨基端或N端,另一端具有一個(gè)游離的-COOH,稱作按基端或C端。
4、核酸的基本概念是什么?
答:核酸是由核甘酸組成的多聚物,每個(gè)核甘酸由下列三種成分組成:
(1)戊糖(五碳糖):在RNA為核糖,在DNA為2,脫氧核糖。
(2)堿基:連接在糖的1'-碳原子上的啜吟堿基(腺噤吟A和鳥噤吟G)或喀陡堿基(胞喀陡C、胸
腺啥嚏T和尿啥嚏U)DNA和RNA都含AGC,T只在DNA中發(fā)現(xiàn),U只在RNA中發(fā)現(xiàn)。
(3)磷酸基:磷酸基接在糖的5'碳原子上。
(1)和(2)組成核甘,核甘和磷酸組成核甘磷酸,即核甘酸。
5、多糖的基本概念是什么?
答:多糖是糖(最常見的是葡萄糖)的多聚物或糖的衍生物的多聚體。
6、決定蛋白質(zhì)和核酸三維結(jié)構(gòu)的非共價(jià)作用有哪些?
答:有氫鍵、疏水鍵、離子鍵、范德瓦耳斯鍵。
7、什么是DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)?
答:DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)是指DNA的核甘酸順序。研究DNA的核甘酸順序是進(jìn)一步研究基因的結(jié)構(gòu)、調(diào)控
及DNA高級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)。
8、什么是DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)?
答:DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)分兩類,一類是右手螺旋。如A、B、C型DNA,另一類是局部的左手螺旋,即Z-DNA。
9、什么是DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)?
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答:DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)也稱超螺旋結(jié)構(gòu),是指DNA雙螺旋鏈的扭曲。DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)使DNA處于能量
最低的狀態(tài)。
10、筒述DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)(Watson-Crick模型)
答:DNA由兩條鏈彼此盤繞形成雙股螺旋,糖-磷酸骨架在分子的外側(cè)沿螺旋軌跡運(yùn)行,堿基在中央成螺
旋排列,一條鏈的堿基與另?條鏈的堿基氫鍵配對(duì),形成噪吟與喀咤堿基對(duì)A-T和G-C。每一個(gè)堿基對(duì)的
兩個(gè)堿基位于同一平面,垂直于螺旋軸,每相鄰的堿基對(duì)旋轉(zhuǎn)36℃,相距3.4A。因此每匝螺旋有10對(duì)堿
基,長34A。雙螺旋的直徑是20A。螺旋外部有兩個(gè)螺旋形槽,深寬的稱為大溝,淺窄的稱為小溝。
11、簡述DNA的堿基配對(duì)原則?
答:[A]=[T],[G]=[C],A-T之間有兩對(duì)氫鍵,G-C之間有三對(duì)氫鍵。
12、什么叫DNA的變性?
答:雙鏈DNA(或天然DNA)兩條鏈之間的結(jié)合力遭到破壞,兩條鏈分離成單鏈DNA的過程叫做變性。
通常用加熱或高PH的方法使DNA變性。
13、什么是熔解曲線?什么是Tm值?
答:當(dāng)DNA溶液通過加熱變性時(shí),其性質(zhì)的變化與溫度之間的關(guān)系圖稱為解鏈曲線或熔解曲線。
檢測DNA變性的方法可以是測定DNA溶液在260nm波長處的紫外光吸收值[A260J,隨溫度的升高,A260
升高,當(dāng)A260升高達(dá)到最大值一半時(shí)的溫度,稱作解鏈溫度;用Tm表示。
14、什么是DNA的呼吸現(xiàn)象?
答:DNA雙鏈的某些區(qū)域被打開變成單鏈的泡,這種現(xiàn)象稱作DNA的“呼吸”,可使特定的蛋白質(zhì)與DNA
分子發(fā)生相互作用和“閱讀”它編碼的信息。
A-T區(qū)比富含G-C區(qū)更容易發(fā)生呼吸。
15、什么是DNA的復(fù)性?
答:變性DNA溶液經(jīng)處理后可重新形成天然DNA,這一過程稱作變性或退火。
16、RNA主要有幾種類型?各有什么功能?
答:RNA主要有三種類型:核糖體RNA(rRNA)、轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)和信使RNA(mRNA)。rRNA為
蛋白質(zhì)的合成場所、tRNA是氨基酸的搬運(yùn)工具,mRNA貯存編碼信息。
17、什么是DNA的復(fù)制?
答:DNA以原來的分子為模板合成新的DNA分子的過程,叫DNA復(fù)制。
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18、什么是DNA的半保留復(fù)制?
答:DNA復(fù)制時(shí)首先雙鏈之間氫鍵斷開,以每條單鏈作為模板合成新鏈,因此新的DNA雙螺旋,一條來
自親代鏈、一條為新合成的子鏈。DNA的這種復(fù)制方式叫做DNA的半保留復(fù)制。
19、什么是復(fù)制叉和復(fù)制子?
答:DNA復(fù)制是由一個(gè)固定的起始點(diǎn)進(jìn)行的,DNA雙鏈在此點(diǎn)上解旋成雙股單鏈呈叉形,稱復(fù)制叉。-
般把一個(gè)生物體的單獨(dú)復(fù)制單位稱為一個(gè)復(fù)制子。一個(gè)復(fù)制子只含一個(gè)復(fù)制起點(diǎn)。
20、什么是拓?fù)洚悩?gòu)酶?
答:拓?fù)洚悩?gòu)酶能使DNA產(chǎn)生各種拓?fù)鋵W(xué)的變化,最常見的是產(chǎn)生負(fù)超螺旋性和消除超螺旋性。多見的
有兩類,拓?fù)洚愇锩窱和拓?fù)洚愇锩窱I。
21、DNA復(fù)制的特點(diǎn)有哪些?
答:(1)半保留復(fù)制(2)忠實(shí)性(3)半不連續(xù)復(fù)制。
22、DNA復(fù)制過程中有哪幾種聚合酶參與?有哪些共同點(diǎn)?
答:DNA聚合酶I(POII)和DNA聚合酶III(POLIII)在DNA復(fù)制過程中起作用。
其共同點(diǎn)是:
(1)同時(shí)要有帶一個(gè)游離3,-0H基團(tuán)的引物和一個(gè)模板。
(2)聚合作用是生長鏈末端的3'-0H基團(tuán)與加上去的核昔-5-'三磷酸之間的反應(yīng)。因此鏈的生長是
自5'f3'方向進(jìn)行的。
23、P0LI有哪些生物活性?
答:(1)5,-3Z聚合酶活性:使DNA復(fù)制進(jìn)行。
(2)3'-5'外切酶活性:可以切除誤配對(duì)的堿基,也稱poll的校對(duì)功能。
(3)5'->3'外切酶活性:主要功能是切除核糖核甘酸引物。
24、POL川具有哪些生物活性?
答:
(1)5,一3,聚合酶活性:DNA復(fù)制的主要聚合酶。
(2)3'-5,外切酶活性:DNA復(fù)制中起校對(duì)功能。
25、什么是DNA連接酶?
答:DNA連接酶能把3'-0H基因與5,-P基因相連接,在DNA復(fù)制過程和其他重要過程中發(fā)揮作用。
26、什么是DNA的不連續(xù)復(fù)制:什么是岡崎片段?
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答:DNA復(fù)制時(shí),在不同點(diǎn)形成許多小片段,再連接成整鏈,這稱作DNA的不連續(xù)復(fù)制,這些小片段稱岡
崎片段。
27、什么是DNA的0復(fù)制?
答:大部分DNA分子以環(huán)狀結(jié)構(gòu)進(jìn)行復(fù)制,這些環(huán)像希臘字母。,所以習(xí)慣稱其為。復(fù)制。環(huán)復(fù)制引起的
拓?fù)鋵W(xué)問題靠DNA促旋醐來解決。
28、DNA復(fù)制起始時(shí)前導(dǎo)鏈或引物的合成是由什么酶催化完成的?
答:一種是RNA聚合酶,另一種是引物合成酶。
29、DNA復(fù)制起始時(shí)雙螺旋的解鏈?zhǔn)巧绞裁疵复呋瓿傻模?/p>
答:解旋酶。
30、什么是ssb蛋白?
答:大腸桿菌DNA復(fù)制時(shí),為了避免單鏈區(qū)退火或形成鏈內(nèi)氫鍵,有一種蛋白結(jié)合在單鏈DNA匕稱單鏈
結(jié)合蛋白(ssbprotein)。
31、簡述大腸桿菌DNA的復(fù)制過程?
答:解旋酶由ATP水解所驅(qū)動(dòng),并可能借助于ssb蛋白的結(jié)合把螺旋解開。不配對(duì)的堿基為ssb蛋白所覆
蓋。前導(dǎo)鏈由polHI催化加上核甘酸而沿著一條親鏈前進(jìn)。DnaB蛋白復(fù)合物沿另一條親鏈移動(dòng),預(yù)引發(fā)它
使引物合成酶合成引物RNA。polHI把核甘酸加到引物匕從而合成了前體片段。這種合成繼續(xù)到前一個(gè)前
體片段的引物;這時(shí)由polI取代polIH,通過切口平移除去RNA,并山DNA取代,RNA一旦除去,DNA連
接酶就封閉切口,從而使前體片段參入后隨鏈。復(fù)制又繼續(xù)前進(jìn)直至完成復(fù)制。
32、DNA復(fù)制的起始有哪兩種方式?
答:(1)全程起始:其中前導(dǎo)鏈從頭開始。
(2)共價(jià)延伸:其中前導(dǎo)鏈共價(jià)連接到親鏈。
33、DNA復(fù)制主要有哪種方式?
答:(1)線性DNA雙向復(fù)制。
(2)環(huán)狀DNA。型復(fù)制。
(3)環(huán)狀DNA滾環(huán)復(fù)制。
(4)環(huán)狀DNAD-環(huán)復(fù)制。
34、什么是D環(huán)?
答:在DNA復(fù)制的全程起始中,前導(dǎo)鏈的合成先于后隨鏈的合成。在第一個(gè)前體片段合成開始前,存在
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著一個(gè)復(fù)制泡,是由一個(gè)雙鏈分去(由一條親鏈與前導(dǎo)鏈配對(duì)而成)和一個(gè)單鏈分去(是未復(fù)制的第二條
親鏈)所組成。因?yàn)榍皩?dǎo)鏈置換了未復(fù)制的親鏈,所以這個(gè)泡稱為置換環(huán)或D環(huán)。
35、什么叫滾環(huán)復(fù)制或S復(fù)制?
答:DNA雙螺旋環(huán)產(chǎn)生一含3'-0H和5'-P末端的切口,在解旋酶和ssb影響下,形成一復(fù)制叉。前導(dǎo)鏈
的合成從3,-0H端開始延伸,并與后隨鏈的親鏈共價(jià)連接。后隨鏈以新合成的前導(dǎo)鏈為模板合成。這-
復(fù)制模式的結(jié)果是產(chǎn)生帶有線狀分去的環(huán),類似于希臘字母6,被稱為6復(fù)制或滾環(huán)復(fù)制。
36、什么是雙向復(fù)制?
答:DNA分子通過兩個(gè)復(fù)制叉沿著環(huán)按相反方向移動(dòng),稱為雙向復(fù)制。
37、真核生物DNA的復(fù)制與原核生物DNA復(fù)制的相同點(diǎn)和不同點(diǎn)有哪些?
答:相同點(diǎn):都是半保留復(fù)制,半不連續(xù)復(fù)制,復(fù)制過程都存在引發(fā)、延長和終止三個(gè)階段,都必須有相
應(yīng)功能的蛋白質(zhì)(如ssb)和醐(如DNA聚合酶)參與等等。
相異之處在于:(1)真核生物每條染色質(zhì)上可以有多處起始點(diǎn),而原核生物的起始點(diǎn)只有一個(gè),(2)真
核生物的染色體在全部復(fù)制完成之前,各個(gè)起始點(diǎn)上DNA的復(fù)制不能再開始;而原核生物在起始點(diǎn)上可以
連續(xù)地開始新的DNA復(fù)制,表現(xiàn)為雖有一個(gè)復(fù)制子,但可有多個(gè)復(fù)制叉。
38、真核細(xì)胞中存在哪幾種DNA聚合酶?
答:在真核細(xì)胞中存在四種DNA聚合酶,通常將這些醐依次稱為DNA聚合酶a、B、y和線粒體DNA聚合
的。其中a酶在細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制中起關(guān)鍵作用,B前在DNA損傷修復(fù)中起作用,Y酶在分裂細(xì)胞的DNA復(fù)
制調(diào)控方面起作用。
39、DNA復(fù)制的調(diào)控有哪幾方面?
答:(1)復(fù)制起點(diǎn)的調(diào)節(jié):通過復(fù)制起點(diǎn)區(qū)反轉(zhuǎn)重復(fù)順序的變構(gòu)與一些特異蛋白結(jié)合來調(diào)節(jié)復(fù)制的方向、
速度等。
(2)起始蛋白的調(diào)節(jié):起始蛋白與DNA起始部位的結(jié)合,導(dǎo)致局部結(jié)構(gòu)變化,從而引起DNA復(fù)制。
(3)復(fù)制過程的調(diào)節(jié):DNA復(fù)制過程中常受到一些蛋白及DNA聚合酶的調(diào)節(jié)。
(4)復(fù)制頻率的調(diào)節(jié):每種生物體DNA復(fù)制與其細(xì)胞周期有關(guān)。如真核生物每個(gè)細(xì)胞周期有一次全
DNA的復(fù)制,而原核生物中某些質(zhì)粒在細(xì)菌細(xì)胞一個(gè)細(xì)胞周期中可以復(fù)制若干拷貝。
(5)生物膜可能參與DNA復(fù)制的起始過程。
40、引起DNA分子改變的原因有哪些?
答:有3種機(jī)制改變DNA的結(jié)構(gòu):(1)復(fù)制過程中的堿莽置換;(2)由堿基或N-糖糖鍵固有的化學(xué)不穩(wěn)
定性所引起的堿基變化:(3)其他化學(xué)物質(zhì)和環(huán)境因素的作用所引起的變化。
41、DNA分子改變的類型有哪幾種?
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答:
(1)堿基置換:山于復(fù)制過程中校對(duì)功能的遺漏,基自發(fā)脫氨作用使嘴啜變?yōu)槟蚩εK或使腺噂吟變?yōu)?/p>
次黃噂吟,使一條鏈上的錯(cuò)誤堿基不能與另?條鏈的相應(yīng)堿基形成氫鍵。
(2)堿基丟失:喋吟核甘酸的N-糖首鍵在生理溫度下自發(fā)斷裂,使喋吟從DNA上脫落,這一過程稱
為脫喋吟作用。
(3)堿基改變:許多化學(xué)試劑和物理因素能使堿基變成截然不同的化合物。如紫外線照射形成的胸腺
喀咤二聚體。
(4)單鏈斷裂:許多試劑能裂解磷酸二酯鍵,如過氧化物、硫基化合物和某些金屬離子(如Fe?+和Cu2+)
單鏈斷裂往往通過DNA連接酶的作用來修復(fù)。
(5)雙鏈斷裂:足夠多的單鏈斷裂可使雙鏈彼此相對(duì),結(jié)果就出現(xiàn)雙螺旋斷裂。雙鏈斷裂往往不能修
復(fù)。
(6)交聯(lián):某些抗生素(如絲裂霉素C)和某些試劑(亞硝酸離子)能使DNA分子一條鏈上的堿基與
互補(bǔ)鏈上的相應(yīng)堿基形成共價(jià)連接。
42、胸腺喀嚏二聚體的修復(fù)途徑有哪些?
答:有4條途徑:①光修復(fù)②切割修復(fù)③重組修復(fù)④SOS修復(fù)。
43、什么是轉(zhuǎn)錄?
答:遺傳信息從DNA分子傳遞到RNA分子的過程叫轉(zhuǎn)錄。
44、RNA的合成包括哪幾個(gè)階段?
答:RNA的合成包括4個(gè)階段:①RNA聚合酶結(jié)合在模板的特定部位上②起始③鏈延伸④鏈終止和
釋放。
45、RNA合成的基本特性是什么?
答:
①RNA合成的前體是4種5'-核昔三磷酸(rNTP)即ATP,GTP,CTP和UTP。
②在聚合反應(yīng)中,一個(gè)核甘酸上的3'-0H基因與第二個(gè)核甘酸上的5,磷酸基團(tuán)發(fā)生反應(yīng),釋放出焦磷酸
二酯鍵。
③RNA分子的堿基順序由DNA的堿基順序所決定。A-U,T-A,G-C,C-G。
④DNA分子的雙鏈中,只有一條鏈作模板。
⑤RNA鏈按5'-3'方向延伸。
⑥RNA聚合酸能起始鏈的生長,也就是說,它不需要引物。
46、大腸桿菌RNA聚合醐由哪兒個(gè)亞基組成?
答:由5個(gè)亞基組成,2個(gè)相同的a亞基,6,6'和6亞基各1個(gè)。完整的酶稱為全酶,不含6亞基的
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酶稱為核心酶。
47、什么是Pribnow順序?什么是“保守的T”?
答:大腸桿菌DNA轉(zhuǎn)錄起始時(shí),拷貝出的mRNA的第一個(gè)堿基左側(cè)的5-10個(gè)堿基區(qū)域是Pribnow順序的右
末端,其全部順序都可認(rèn)為是基本順序TATAATG的變式。黑體的T是Pribnow順序中的第6個(gè)堿基,在至
今定序的所有啟動(dòng)子中都有這堿基,因此被稱作“保守的T”,通常把保守的T垂直對(duì)齊即可比較不同的
順序。Pribnow順序被認(rèn)為是給RNA聚合酶取向的順序,使從左到右進(jìn)行合成;它也是打開雙螺旋形成開
放啟因子復(fù)合物的區(qū)域。
真核生物中相應(yīng)的一致順序是TATAAAA,稱TATA順序或Hogness順序。
48、什么是-35順序?
答:真核生物啟動(dòng)子中,拷貝出的mRNA的第個(gè)堿基左側(cè)第35個(gè)堿基位置有9個(gè)堿基的區(qū)域,被認(rèn)為
是RNA聚合酶結(jié)合的起始點(diǎn),習(xí)慣稱作-35順序。
49、什么是開放啟動(dòng)復(fù)合物(Open-promotercomplex)?
答:開放啟動(dòng)復(fù)合物由RNA聚合酶和啟動(dòng)子結(jié)合形成,是一種高度穩(wěn)定的復(fù)合物,是鏈起始中的活性中間
物。在這個(gè)復(fù)合物中,DNA雙螺旋的局部松開(“解鏈”)從Pribnow順序左側(cè)的10個(gè)堿基開始一直擴(kuò)展到
轉(zhuǎn)錄的第一個(gè)堿基部位。這種解鏈?zhǔn)沁M(jìn)入的核甘酸進(jìn)行配對(duì)所必需。
50、RNA聚合前起始部位結(jié)合哪種核甘三磷酸?
答:只結(jié)合喋吟核昔三磷酸,即ATP和GTP。其中之■(往往是ATP)是鏈中的第一個(gè)核甘酸。
51、RNA合成的終止順序有什么特征?
答:RNA合成的終止發(fā)生在DNA分子的特定堿基順序上,它們有三個(gè)重要區(qū)域:
(1)第一區(qū)域是中央含非重復(fù)片段的反向重復(fù)堿基順序;如ABCDEF-XPZ-F'E'DzCB'AS其中A-A'、
B-Bz等是互補(bǔ)的堿基。因此這個(gè)順序能在鏈內(nèi)堿基配對(duì),在RNA轉(zhuǎn)錄物中和可能在DNA鏈中形成
莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
(2)第二個(gè)區(qū)域是在莖的近環(huán)端(有時(shí)全在莖內(nèi)),是一個(gè)G+C富集的順序。
(3)第三個(gè)區(qū)域(有時(shí)不存在)是A-T配對(duì)的順序,使RNA中產(chǎn)生6-8個(gè)尿口密咤,其后往往跟隨一個(gè)
腺噂吟。
52、什么是3循環(huán)?
答:RNA合成過程中,鏈延伸約8個(gè)核甘酸時(shí),RNA聚合酶結(jié)構(gòu)改變,6亞基脫落;當(dāng)合成終止時(shí),核心
酶從DNA上解離,核心酶與6亞基重新結(jié)合形成全酶。這一過程稱6循環(huán)。
53、什么是有義鏈和反義鏈?
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答:DNA轉(zhuǎn)錄成RNA時(shí),只有雙鏈中的一條鏈轉(zhuǎn)錄,這條鏈就叫有義鏈。未被轉(zhuǎn)錄的DNA鏈稱為反義鏈。
54、什么是順反子(Cistron)?
答:相應(yīng)于一條多肽鏈的DNA片段加上起始信號(hào)和終止信號(hào),被稱作順反子。編碼單個(gè)多肽的mRNA稱作
單順反子mRNA;編碼不同的多肽鏈的mRNA稱作多順反子mRNA。
55、什么是前導(dǎo)區(qū)(Leader)?弱化子(attenuator)?間隔順序(spacer)?
答:mRNA分子編碼區(qū)之前的非翻譯區(qū)段稱為前導(dǎo)區(qū)。前導(dǎo)區(qū)中含有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)合成速度的調(diào)節(jié)區(qū),稱為弱
化子。多順反子mRNA分子可能含有順反子間順序,長達(dá)幾萬個(gè)堿基,稱間隔順序(spacer)。
56、核糖體RNA(rRNA)和轉(zhuǎn)移RNA(tRNA)經(jīng)過轉(zhuǎn)錄后修飾后有哪些性質(zhì)?
答:rRNA和tRNA經(jīng)過轉(zhuǎn)錄后修飾或加工具有下列3個(gè)性質(zhì):
①分子的末端為5,-單磷酸,而非初級(jí)轉(zhuǎn)錄物的末端三磷酸;
②rRNA和tRNA分子比初級(jí)轉(zhuǎn)錄物小得多;
③所有tRNA分子都含有A,G,C,U以外的堿基,這些所謂的“稀有”堿基并不存在于初級(jí)轉(zhuǎn)錄物中。
57、真核生物與原核生物轉(zhuǎn)錄有什么區(qū)別?
答:真核生物中的轉(zhuǎn)錄和mRNA的基本特性與細(xì)菌中的相類似,然而有下列5個(gè)明顯的區(qū)別。
①真核生物細(xì)胞含3大類核內(nèi)RNA聚合酶,負(fù)責(zé)各類RNA的合成。
②許多mRNA是長壽的。
③5'和3'末端都受到修飾:5'末端形成“帽子(CAP)結(jié)構(gòu)",3'末端有一多聚腺甘酸順序(Poly(A)
)。
④用作蛋白質(zhì)合成的mRNA模極只占初級(jí)轉(zhuǎn)錄物的1/10,在mRNA加工過程中,切除稱為內(nèi)含子(intron)
的內(nèi)插順序,留下的片段重新連接。⑤所有真核生物的mRNA分子都是單順反子。
58、真核生物RNA聚合醐有兒類,分別參與哪種RNA的合成?
答:真核生物含3類RNA聚合前,分別以I、II、IH表示。第I類存在于核仁內(nèi),參與rRNA的合成;第
II類存在于核質(zhì)內(nèi),參與mRNA的合成;第IH類存在于核質(zhì)內(nèi),參與tRNA和5sRNA的合成。
59、什么是真核生物mRNA的帽子結(jié)構(gòu)?
答:真核生物mRNA分子的5'-端有甲基化的鳥背衍生物7-甲基鳥苜(7-MeG),呈異常的5'-5'鏈連到
5'端核甘酸上,偶爾相鄰核甘酸的糖也被甲基化。7-(MeG)-5'-ppp-(G或A,可能甲基化的核糖)-3'
-P-,這一結(jié)構(gòu)被稱為帽子(Cap),其中,P和PPP分別代表單磷酸和三磷酸基因。帽子的功能可能是保護(hù)
mRNA免受核酸酶的降解、或?yàn)榈鞍踪|(zhì)合成提供識(shí)別特征。
60、什么是RNA的拚接(RNASplicing)?
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答:真核生物mRNA分子中內(nèi)含子切除和外顯子連接成成熟mRNA分子的過程,稱作RNA拚接。
61、什么是斷裂基因?
答:由于基因中有內(nèi)含子,使編碼一個(gè)蛋白質(zhì)或多肽的DNA順序在基因上呈不連續(xù)狀,稱斷裂基因。
62、什么是翻譯(translation)?
答:細(xì)胞內(nèi)DNA指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程叫做翻譯。包括編碼和蛋白質(zhì)合成兩步。編碼就是將DNA的堿基順
序翻譯成肽鏈的氨基酸順序。蛋白質(zhì)合成包括合成起始、鏈的延伸終止、釋放、折疊及合成后修飾過程。
63、什么密碼子?有哪些特點(diǎn)?
答:密碼子是指對(duì)應(yīng)于各種氨基酸的mRNA分子上的堿基順序,通常由3個(gè)堿基組成,密碼子有下述特性:
①通用性:在所有生物中,密碼子-氨基酸關(guān)系都是相同的(線粒體、葉綠體除外);②簡并性:編碼同一
氨基酸的密碼子往往不止一個(gè)(甲硫氨酸和色氨酸除外),它們往往只是第3個(gè)堿基不同;③起始密碼子
標(biāo)志著肽鏈合成的起始,即AUC,編碼甲硫氨酸;④終止密碼子,3種密碼子標(biāo)志著肽鏈合成的終止,即
UAA,UAG和UGA。
64、什么是解碼作用?
答:解碼作用是把mRNA分子中的堿基順序變成翻譯到蛋白質(zhì)分子中的氨基酸順序,這是由mRNA分子和氨
酰tRNA合成酶完成的。
65、簡述tRNA分子的二維結(jié)構(gòu)特征?
答:tRNA分子的二維結(jié)構(gòu)類似平面的三葉草形,包括以下幾個(gè)結(jié)構(gòu)區(qū):
①受體臂:3'-0H端有一個(gè)4堿基組成的單鏈區(qū),順序?yàn)镃CA-3'-011,稱CCA或受體臂,其中A為氨基
酸結(jié)合部位。
②有三個(gè)大的單鏈環(huán)。(a)反密碼子環(huán):含有反密碼子,由3個(gè)堿基組成,與mRNA中的密碼子順序進(jìn)行
堿基配對(duì)。(b)二氫尿喀咤環(huán)(DHULOOP):含有二氫尿口密咤。(c)TWC環(huán):含有『W-C順序;¥為假尿
喀咤。
③有四個(gè)稱為干(臂)的雙鏈區(qū).
④有一額外臂(extaarm)。
66、什么是搖擺假說(wobblehypothesis)?
答:搖擺假說是用來解釋某些tRNA分子對(duì)應(yīng)于幾種密碼子的現(xiàn)象。這種假說認(rèn)為,因?yàn)榉疵艽a子位于單
鏈RNA環(huán)中,密碼子-反密碼子相互作用也許不需要形成雙螺旋常見的空間結(jié)構(gòu),這樣對(duì)密碼子的第三個(gè)
位置上的堿基要求是不太嚴(yán)格的,這樣通過結(jié)構(gòu)的稍稍搖擺,在密碼子和反密碼子之間可以存在其他的堿
基對(duì)如AT,U-I,C-I和G-U等等,這樣就解釋了--種tRNA分子可對(duì)應(yīng)于幾種密碼子。也就是說,密碼
子的簡并現(xiàn)象是由密碼子第三個(gè)堿基配對(duì)時(shí)搖擺引起的。
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67、什么是重疊基因(orerlappinygene)?
答:一個(gè)DNA片段含有多重讀框,從而編碼多種不同的蛋白分子,這種現(xiàn)象稱重疊基因。
68、肽鏈合成分哪幾個(gè)階段?各階段主要特征是什么?
答:肽鏈合成分三個(gè)階段:①起始階段:mRNA結(jié)合到核糖體匕選擇起始密碼子,和攜帶第一個(gè)氨基酸的
?;痶RNA結(jié)合;②延伸階段:通過肽鍵把兩個(gè)氨基酸相連,mRNA和核糖體彼此相對(duì)移動(dòng),使密碼子能成
功地翻譯。③終止階段:合成好的蛋白質(zhì)從合成機(jī)構(gòu)上解離,釋放出核糖體開始另一輪合在成。
69、筒述大腸桿菌核糖體的結(jié)構(gòu)?
答:大腸桿菌核糖體的完整顆粒稱為70s核糖體(S為沉降速率),含兩個(gè)亞基,分別為30s和50S。每個(gè)
30S亞基含1個(gè)16SrRNA分子和21種蛋白質(zhì);第個(gè)50S亞基含2個(gè)rRNA分子(1個(gè)5srRNA分子和1個(gè)
23SrRNA分子)和32種蛋白質(zhì)。
70、什么是Shine-Daigarno順序?
答:在原核生物mRNA分子中有一特定的堿基順序AGGAGGU,能夠識(shí)別作為起始信號(hào)的特定AUG密碼子,稱
作Shine-Dalgarno順序或核糖體結(jié)合部位。
71、什么是30s前起始復(fù)合物和70s起始復(fù)合物?
答:細(xì)菌中多肽合成由30s亞基、mRNA分子、f'Met-tRNA、起始因子以及GTP一起組成30s前起始復(fù)合物,
再與50S亞基連接形成70s起始復(fù)合物。
72、什么是質(zhì)粒?質(zhì)粒有哪些基本特性?
答:質(zhì)粒是獨(dú)立于細(xì)菌染色體之外的?些雙鏈閉環(huán)的DNA分子,是能夠進(jìn)行復(fù)復(fù)和遺傳的輔助性遺傳單位,
其大小范圍從1Kb至200Kb以上不等。質(zhì)粒的基本特性如下:
(1)復(fù)制能力和不相容性:質(zhì)粒DNA能夠依賴于宿主編碼的酶和蛋白質(zhì)來進(jìn)行復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。利用同?
復(fù)制系統(tǒng)的不同質(zhì)粒不能穩(wěn)定的和平共處,可稱之為不相容質(zhì)粒。當(dāng)兩個(gè)上述質(zhì)粒被導(dǎo)入同一細(xì)
胞時(shí),它們在復(fù)制及隨后分配到子細(xì)胞的過程中彼此競爭,細(xì)胞生長幾代后,占少數(shù)的質(zhì)粒將會(huì)
喪失殆盡。
(2)轉(zhuǎn)移性:在自然條件下,很多質(zhì)粒都可以通過一種稱為細(xì)菌接合的作用轉(zhuǎn)移到新宿主內(nèi)。
(3)選擇性標(biāo)記:質(zhì)粒能夠編碼一些可識(shí)別性表型,稱作可選擇標(biāo)記。最常用的可選擇標(biāo)記是抗生素
抗性基因,所涉及的抗生素包括氨芳青霉素、四環(huán)素、氯霉毒和卡那霉素(或新霉素)等。
73、質(zhì)粒DNA小量制備過程中容易出現(xiàn)的問題及對(duì)策有哪幾種?
答:
(1)質(zhì)粒DNA不能被限制前所切割,主要是由于從細(xì)菌沉淀或從核酸沉淀中去除所有上清液時(shí)注意得
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不夠。大多數(shù)情況下,用酚氯仿對(duì)溶液進(jìn)行抽提可以去除小量制備物中的雜質(zhì)。若問題依然存在,
可用離心柱層析法純化DNAo
(2)個(gè)別小量制備物會(huì)出現(xiàn)無質(zhì)粒DNA的現(xiàn)象,這幾乎肯定是由于核酸沉淀顆粒已同乙醇一起被棄去。
74、在大量制備質(zhì)粒DNA過程中,可通過什么方法來提高質(zhì)粒的產(chǎn)量?
答:將細(xì)菌在豐富的培養(yǎng)基中37℃振搖一定時(shí)間(約25小時(shí)),所得培養(yǎng)物的0優(yōu)。。達(dá)到約0.4,此時(shí)加氯
霉素溶液,使終濃度為170ug/ml,于37℃劇烈振搖,繼續(xù)培養(yǎng)12-16小時(shí)。
75、用于去除質(zhì)粒DNA中RNA的酶的名稱是什么?一般工作濃度是什么?
答:核糖核酸酶A,習(xí)慣稱無DNA酶的胰RNA酶。一般工作濃度為20ug/ml。
76、影響外源DNA片段和質(zhì)粒載體連接的因素有哪些?
答:(1)外源DNA片段末端的性質(zhì),見下表:
外源DNA片段所克隆的要求說明
帶末端
平端要求高濃度的DNA和連接酶①非重組體克隆的背景可能較高
②質(zhì)粒和外源DNA接合處的限制酶切位
點(diǎn)消失
③重組質(zhì)粒會(huì)帶有外源DNA的串聯(lián)拷貝
不同的突出端用兩種限制酶消化后,需純化質(zhì)①質(zhì)粒與外源DNA接合處的酶切位點(diǎn)常
粒載體以晝提高連接效率可保留
②非重組體克隆的背景較低
③外源DNA只以一個(gè)方向插入到重組質(zhì)
粒中
相同的突出端線狀質(zhì)粒DNA常用磷酸酶處理①質(zhì)粒與外源DNA接合處的限制酶切位
點(diǎn)??杀A?/p>
②外源DNA會(huì)以兩個(gè)方向插入
③重組質(zhì)粒會(huì)帶有外源DNA的串聯(lián)拷貝
(3)質(zhì)粒載體和外源DNA中限制酶切位點(diǎn)的性質(zhì):有兩種方案可以解決質(zhì)粒與外源DNA限制酶切位
點(diǎn)的不匹配:A.在線狀質(zhì)粒的末端和(或)外源DNA片段的末端接上合成的接頭或銜接頭;B.控
制反應(yīng)條件,用大腸桿菌DNA聚合酶IKlenow片段部分補(bǔ)平帶3'凹端的DNA片段。
77、對(duì)于常規(guī)的連接反應(yīng)來講,質(zhì)粒DNA與外源DNA的比率應(yīng)為多少?
答:對(duì)于常規(guī)的連接反應(yīng),質(zhì)粒DNA與外源DNA的比率應(yīng)〈1,這樣將可得到數(shù)量相宜的有效重組體。
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78、平端DNA的連接需要哪些基本條件?
答:平端連接是低效反應(yīng),它要求以下4個(gè)條件:
(1)低濃度(0.5mmol/l)的ATP;(2)不存在亞精胺一類的多肽;(3)極高濃度的連接酶(50Weiss
單位/ml);(4)高濃度的平端。
79、在平端DNA連接時(shí),常常在反應(yīng)混合物中加入凝聚劑,常用的有哪些?它們的作用是什么?
答:在平端DNA連接時(shí)一,常常在反應(yīng)混合物中加入一些可促進(jìn)大分子群聚作用并可導(dǎo)致DNA分子凝聚成聚
集體的物質(zhì),常用的有聚乙二醇和氯化六氨合高鉆。在連接反應(yīng)中,這些物質(zhì)具有兩個(gè)作用:
(1)它們可使平端DNA的連接效率加大1-3個(gè)數(shù)量級(jí),因此可使連接反應(yīng)在酶和DNA濃度不高的條件
下進(jìn)行。
(2)它們可以改變連接產(chǎn)物的分布,分子內(nèi)連接受到抑制,所形成的連接產(chǎn)物一律是分子間連接的產(chǎn)
物。
80、影響轉(zhuǎn)化效率的因素有哪些?
答:下述3個(gè)因素對(duì)于獲得持續(xù)高的轉(zhuǎn)化效率來說是至關(guān)重要的:
(1)轉(zhuǎn)化緩沖液中試劑的純度:務(wù)必使用所能得到的最高質(zhì)量的試劑,這些試劑應(yīng)分裝成小份,避光
保存于冷處。
(2)細(xì)胞的生長狀態(tài):由于一些不清楚的原因,直接用貯存于-70℃冰凍培養(yǎng)基中的貯存原種接種而進(jìn)
行培養(yǎng)的細(xì)菌,所得到的轉(zhuǎn)化效率最高,不應(yīng)使用在實(shí)驗(yàn)室中連續(xù)傳代,貯存于4℃或貯存于室溫
的培養(yǎng)物。
(3)玻璃和塑料器皿的清潔度:痕量的去污劑或其它化學(xué)物質(zhì)的存在可能大大地降低細(xì)菌的轉(zhuǎn)化效率,
所以最好拔出一批玻璃器皿專用于制備感受態(tài)細(xì)菌,而不作它用。這些玻璃器皿應(yīng)用手洗刷,再
灌滿純水(Milli-Q級(jí)或其相當(dāng)?shù)募?jí)別),然后高壓滅菌,臨用前才把水倒掉。
81、鑒定含重組質(zhì)粒的細(xì)菌菌落的方法有哪些?
答:常用4種方法來鑒定含重組質(zhì)粒的細(xì)菌菌落:
(1)小規(guī)模制備質(zhì)粒DNA進(jìn)行限制酶切分析;
(2)a互補(bǔ)
(3)插入失活
(4)雜交篩選
82、簡述a-互補(bǔ)的原理?
答:現(xiàn)在使用的許多載體(如PUC系列)都帶有一個(gè)大腸桿菌DNA的短片段,其中含有*半乳糖甘酶
基因(lacZ)的調(diào)控序列和頭146個(gè)氨基酸的編碼信息。這個(gè)編碼區(qū)中插入了一個(gè)多克隆位點(diǎn),它并不破
壞讀框,但可使少數(shù)幾個(gè)氨基酸插入到半乳糖甘酣的氨基端,而不影響功能。這種載體適用于可編碼
B-半乳糖首酶C端部分序列的宿主細(xì)胞。雖然宿主和質(zhì)粒編碼的片段各自都沒有酶活性,但它們可以融
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為一體,形成具有酶學(xué)活性的蛋白質(zhì)。這樣lacZ基因上缺失近操縱基因區(qū)段的突變體與帶有完整的近操
縱基因區(qū)段的6-半乳糖甘酶陰性的突變體之間實(shí)現(xiàn)互補(bǔ),這訓(xùn)互補(bǔ)現(xiàn)象叫a互補(bǔ)。由a互補(bǔ)而產(chǎn)生的
lac+細(xì)菌易于識(shí)別,因?yàn)樗鼈冊谏孜?-溟-4-氨-3』引味-B-D-半乳糖甘(X-lac)存在下形成藍(lán)色菌落,
然而外源DNA片段插入到質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)后,幾乎不可避免地導(dǎo)致產(chǎn)生無a互補(bǔ)能力的氨基端片段。
因此,帶重組質(zhì)粒的細(xì)菌形成白色菌落。這一簡單的顏色試驗(yàn)大大簡化了在這種質(zhì)粒載體中鑒定重組體的
工作,通過目測即可識(shí)別可能帶有重組質(zhì)粒的菌落。
83、X噬菌體的復(fù)制方式有哪幾種?
答:X噬菌體有下述兩種復(fù)制方式:
(1)在裂解性生長過程中,環(huán)狀病毒DNA分子被復(fù)制了許多倍,X噬菌體基因產(chǎn)物大量合成,并組裝
成子代X噬菌體顆粒,最終宿主細(xì)胞裂解,釋放出許多感染性顆粒。
(2)在溶源性生長過程中,X噬菌體基因組通過位點(diǎn)專一重組整合入宿主菌DNA分子中,隨宿主菌DNA
復(fù)制并轉(zhuǎn)入子代細(xì)菌中。在溶源狀態(tài)下,只有一個(gè)X噬菌體基因,即CI基因,處于表達(dá)狀態(tài),
它編碼一個(gè)阻抑物。
84、X噬菌體載體有哪兩種類型?
答:
(1)只有一個(gè)限制酶切位點(diǎn)可供插入入源DNA的載體,稱作插入性載體。
(2)在可被外源DNA置換的X噬菌體DNA非必需區(qū)兩側(cè)有一對(duì)限制酶切位點(diǎn)的載體稱作置換性載體。
85、簡述Agt11載體的特征。
答:Xgt11載體是一個(gè)常用的,可用于免疫學(xué)篩選的載體。DNA片段(可達(dá)7.2Kb)插入lacZ內(nèi)的單一
ECORI位點(diǎn),如果插入片段的讀框與lacZ的讀框相吻合,就可表達(dá)出融合蛋白。該載體需要SupF宿主
菌進(jìn)行增殖和篩選。在非抑制性宿主菌內(nèi),由于Sam100突變的存在可以防止細(xì)菌裂解,所以表達(dá)的融合
蛋白就會(huì)在細(xì)菌內(nèi)累積。該載體帶有red和gam基因,可以在recA-宿主菌內(nèi)生長。載體上的溫度敏感阻
抑物可用來控制筮菌體的復(fù)制和融合蛋白的表達(dá)。
86、X噬菌體大規(guī)模制備的方法有哪兩種?
答:大規(guī)模制備X噬菌體有下述兩種方法:(1)低復(fù)數(shù)感染;(2)高復(fù)數(shù)感染。
87、純化X噬菌體的方法有哪幾種?
答:(1)氯化葩梯度離心;(2)沉淀噬菌體顆粒;(3)甘油分級(jí)梯度離心;(4)氯化鈉平衡離心。
88、用A噬菌體進(jìn)行克隆包括哪些步驟?
答:用人噬菌體進(jìn)行克隆包括5個(gè)步驟:
(1)用適當(dāng)限制酶消化的載體DNA的制備;
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(2)酶切的載體與帶匹配粘端的外源DNA片段的連接;
(3)將連接的DNA包裝入噬菌體顆粒中,在適當(dāng)?shù)乃拗骶闲纬墒砂撸?/p>
(4)帶有目的外源DNA序列的X噬菌體重組體的鑒定;
(5)對(duì)選出的重組噬菌體進(jìn)行噬斑純化,然后進(jìn)行外源DNA的分析。
89、大腸桿菌絲狀噬菌體有哪兒種?它們有什么用途?
答:大腸桿菌絲狀噬菌體包括M13噬菌體、fl噬菌體和fd噬菌體。這些噬菌體均含一個(gè)約6400個(gè)核甘酸
的單鏈閉環(huán)DNA分子。在用作克隆載體時(shí),這些噬菌體有一個(gè)得天獨(dú)厚的優(yōu)點(diǎn),即可以產(chǎn)生大量含有外源
DNA某一條鏈的DNA分子。這種單鏈DNA分子可以在下列工作中用作模板:
(1)用雙脫氧鏈終止法進(jìn)行DNA序列測定
(2)制備僅有一條鏈得到放射性標(biāo)記的雜交用DNA探針
(3)利用寡核甘酸進(jìn)行定點(diǎn)誘變。
90、什么是限制性內(nèi)切酶?分兒類?
答:限制性內(nèi)切的是指能特異性地結(jié)合于一段特殊DNA序列之內(nèi)或其附近的特異位點(diǎn)上,并在此切割雙鏈
DNA的一類蛋白質(zhì)。它可分3類。I類和IH類限制酶在分子克隆中不常用,常規(guī)應(yīng)用于分子克隆中的限制
酶為H類。
91、什么是同裂酶?
答:不同來源的限制醐可切割同一靶序列,這些醐即稱為同裂酶。
92、大腸桿菌DNA聚合酶I有哪些活性?在切口平移法標(biāo)記DNA時(shí)利用的是哪一活性?
答:DNA聚合酶I具有3種活性:(1)5,一3,DNA聚合酶活性;(2)5,-3Z外切核酸酶活性;(3)3,
-5'外切核酸酶活性。在切口平移法標(biāo)記DNA中利用的是其5,一3'外切核酸醵活性。
93、什么是大腸桿菌DNA聚合酶I大片段(Klenow段)?在分子克隆中有哪些用途?
答:利用蛋白酶解作用(如枯草桿菌蛋白酶)去除大腸桿菌DNA聚合酶I的5,一3'外切核酸酶活性,而
聚合酶活性3'-5'外切核酸酶活性切不受影響。這種經(jīng)蛋白酶作用后的DNA聚合酶I就叫做DNA聚合酶
I大片段或Klenow片段。
用途:(1)補(bǔ)平限制酶切割切割DNA產(chǎn)生的3'凹端。
⑵用[32P]dNTP補(bǔ)平3'凹端;對(duì)DNA片段進(jìn)行末端標(biāo)記;
(3)對(duì)帶3'突出端的DNA進(jìn)行末端標(biāo)記;
(4)在cDNA克隆中,用于合成cDNA第二鏈;
(5)在體外誘變中,用于從單鏈模板合成雙鏈DNA;
(6)應(yīng)用Sanger雙脫氧末端終止法進(jìn)行DNA測序;
(7)消化某些限制酶作用后產(chǎn)生的3,突出端;
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(8)也可用于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)o
94、T,噬菌體DNA聚合酶的用途有哪些?
答:(1)補(bǔ)平或標(biāo)記限制酶消化的3'凹端;
(2)對(duì)帶有3'突出端的DNA分子進(jìn)行末端標(biāo)記;
(3)標(biāo)記用作探針的DNA片段;
(4)將雙鏈DNA的末端轉(zhuǎn)化成平端;
(5)使結(jié)合于單鏈DNA模板上的誘變寡核甘酸引物得到延伸。
95、什么是測序酶(Sequenase)?
答:測序酶是經(jīng)修飾的「噬菌體DNA聚合酶,其99%以上的3,一5,外切核酸酶活性由氧自由基介導(dǎo)的位
點(diǎn)特異性修飾作用而滅活,但其聚合能活性則無明顯改變,它是用雙脫氧鏈終止法對(duì)長段DNA進(jìn)行測序的
理想用酶。
96、什么是TaqDNA聚合酶?其用途有哪些?
答:TaqDNA聚合酶是一種耐熱的依賴于DNA的TagDNA聚合酶(分子量65000D)它最初是從極度嗜熱的
棲熱水生菌Thermusaquaticus中純化而來的。
TaqDNA聚合酶可用于對(duì)DNA進(jìn)行測序及通過聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)對(duì)DNA分子的特定序列進(jìn)行體外擴(kuò)增。
TaqDNA聚合酶作用時(shí)需要Mg";磷酸鹽緩沖液抑制TaqDNA聚合酶的活性,因此忌用之。
97、什么是連接的?主要有哪兒種?
答:用于將兩段DNA拼接起來的酶叫連接酶。分子克隆中最常用的連接酶是T,菌體DNA連接酶,還有一種
大腸桿菌DNA連接酶。
98、常用的核酸酶有哪些?各有什么活性?
答:
①BAL31核酸酶:3,外切核酸酶活性和內(nèi)切核酸酶活性。
②&核酸酶:降解單鏈DNA或RNA,產(chǎn)生帶5'磷酸的單核甘酸或寡核甘酸
③綠豆核酸酶:降解單鏈DNA,產(chǎn)生帶5'磷酸的單核甘酸或寡核甘酸。
④核糖核酸酶A:RNA酶A是內(nèi)切核糖核酸酶,可特異地攻擊RNA上喀咤殘基的T端,切割與相鄰核甘酸
形成的磷酸二酯鍵。產(chǎn)生帶啥呢3'磷酸的寡核甘酸或瞪吃3'磷酸。
⑤核糖核酸酶RNA酶*是內(nèi)切核糖核酸酶,它特異地作用于鳥口票吟核甘酸3'磷酸并切割與相鄰核昔
酸相連的磷酸二酯鍵。產(chǎn)物為鳥喋嶺核昔3,磷酸或帶鳥噤吟核甘3'磷酸的寡核甘酸。
⑥脫氧核糖核酸酶I:DNA酶I為一內(nèi)切核酸酶。它優(yōu)先從嚓臟核甘酸的位置水解雙鏈或單鏈DNA,產(chǎn)物
為5'磷酸單核甘酸及寡核甘酸的混合物。
⑦外切核甘酸m:從雙鏈DNA的3'羥基端逐一去除單核甘酸,結(jié)果是在雙鏈DNA上產(chǎn)生長的單鏈區(qū)。
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⑧入噬菌體外切核酸酶:可催化從雙鏈DNA中持續(xù)地逐一釋放5'單核甘酸的反應(yīng)。
99、影響瓊脂糖凝膠DNA遷移速率的因素有哪些?
答:
①DNA的分子大?。篋NA在凝膠中的遷移速率與其分子大小成反比。
②瓊脂糖濃度:DNA電泳遷移率與凝膠濃度成反比。
③DNA的構(gòu)象:分子量相同的超螺旋環(huán)狀(I型)、帶切口環(huán)狀(H型)及線狀(III型)DNA通過凝膠時(shí)速
度不一。
④所加電壓:在低電壓時(shí),線狀DNA片段的遷移速率與所加電壓成正比
⑤電場方向:通過電場方向周期性改變,可分辨極大的DNA分子。
⑥堿基組成與溫度:4-30C之間影響不明顯。
⑦嵌入染料的存在:漠化乙錠可使線狀DNA的遷移率降低15%。
⑧電泳緩沖液的組成:電泳緩沖液的組成及其離子強(qiáng)度影響DNA的電泳遷移率。
100、從凝膠中回收DNA的常用方法有哪幾種?
答:
①電泳到DEAE-纖維素膜上。
②電洗脫到透折袋中。
③利用低熔點(diǎn)瓊脂糖凝膠。
101、聚丙烯酰胺凝膠與瓊脂糖凝膠相比有哪些優(yōu)點(diǎn)?
答:有3個(gè)主要優(yōu)點(diǎn):①分辨力很強(qiáng),長度僅僅相關(guān)0.2%的DNA分子即可分開;②所能裝載的DNA量遠(yuǎn)遠(yuǎn)
大于瓊脂糖凝膠;③從聚丙烯酰胺凝膠中回收的DNA純度很高,可適用于要求最高的實(shí)驗(yàn)(如鼠胚微注射)。
102、RNA提取和純化過程中應(yīng)怎樣控制RNA酶的活性?
答:①實(shí)驗(yàn)程序中控制RNA酶活性:
A、玻璃制品、塑料制品和電泳槽:滅菌的一次性使用的塑料制品基本上無RNA酶,可以不經(jīng)預(yù)處理
直接用于制備和貯存RNAo實(shí)驗(yàn)室用的普通玻璃器Hl和塑料制品經(jīng)常有RNA酶污染,使用前必須于180℃
干烤8小時(shí)以上(玻璃器皿)或用氯仿沖洗(塑料制品)。另一種方法是用0.1%焦碳酸二乙酯(DEPC)的
水溶液浸泡用于制備RNA的燒杯、試管和其它用品。灌滿DEPC的器皿在37℃放置2小時(shí),然后用滅菌水
淋洗數(shù)次,并于100℃干烤15分鐘,在15lbf/in2(1.034X105Pa)高壓下滅菌15分鐘。
用于RNA電泳的電泳槽應(yīng)用去污劑洗凈,再用水沖洗,用乙醇干燥,然后灌滿3%的溶液;于室溫
放置10分鐘,然后用0.1%DEPC處理過的水徹底沖洗電泳槽。
最好能留出一些玻璃品皿、塑料制品和電泳槽作上特殊標(biāo)記,存放在指定地點(diǎn);為RNA實(shí)驗(yàn)專用。
B、研究人員的手是RNA前最主要的潛在污染源,因此在準(zhǔn)備分離和分折RNA的材料和溶液時(shí),以及
在涉及RNA的一切操作過程中,都應(yīng)戴一次性手套,按觸“臟的”物品后,手套就可能污染上RNA
17
酶,因此進(jìn)行RNA實(shí)驗(yàn)時(shí)應(yīng)勤換手套。
C、溶液配制:用高壓滅菌的水和RNA研究專用的化學(xué)試劑配制溶液,同干烤過的藥匙稱取試劑,將
溶液裝入無RNA酶的玻璃器皿。可能的話,溶液均應(yīng)用0.1%DEPC于37c至少處理12小時(shí),然后
于100℃加熱15分鐘或在15lbf/in2(l.034X105Pa)的高壓下蒸氣滅菌15分鐘。
②RNA酶的抑制劑:主要有下述3種。
A、RNA酶的蛋白質(zhì)抑制劑:從胎盤分離的一種蛋白質(zhì)可與多種RNA能緊密結(jié)合,形成非共價(jià)結(jié)合的
等摩爾復(fù)合物,使RNA酶失活。
B、氧鈕核糖核昔復(fù)合物:它能與多種RNA酶結(jié)合并幾乎能百分之百地抑制RNA的活性。
C、Macalod(硅藻土):是??種粘土,能吸附RNA的。
③破碎細(xì)胞和滅活RNA酶同步進(jìn)行:用強(qiáng)烈變性劑如鹽酸胭或硫氟酸服溶液能迅速溶解蛋白質(zhì),導(dǎo)致
細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎,核蛋白由于其二級(jí)結(jié)構(gòu)的破壞而從核酸上解離下來。
103、進(jìn)行RNA分折的方法有哪些?
答:①Northern雜交(RNA印亦法);②斑點(diǎn)和鐵線雜交;③進(jìn)行RNA的8核酸酣或核糖核酸前作圖I;
④引物延伸法;⑤溶液雜交;⑥濾膜雜交。
104.Northern雜交主要有哪些步驟?
答:
①變性RNA瓊脂糖凝膠電泳。
②分級(jí)分離的RNA轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜或尼龍膜。
③同放射性標(biāo)記的探針對(duì)固定在膜上的RNA進(jìn)行雜交。
105、構(gòu)建CDNA文庫常見的步驟有哪些?
答:①制備用于CDNA克隆的mRNA。②CDNA第一鏈的合成。③CDNA第二鏈的合成。④雙鏈CDNA的分
子克?。ê铣山宇^的加入和雙鏈CDNA克隆入X噬菌體載體)。
106、從哺乳動(dòng)物細(xì)胞中分離DNA的方法有哪些?
答:下面介紹從哺乳動(dòng)物細(xì)胞中分離DNA的三種程序:
①利用蛋白酶K,SDS和酚,所獲DNA的大?。?00T50kb)適用于在噬菌體載體上的構(gòu)建基因組DNA
文庫;
②用蛋白酶K消化,用高濃度甲酰胺使DNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物解離,以及通過火棉膠透折袋透折除去殘存
的蛋白酶K等步驟,這樣得到的DNA分子量非常大,但濃度頗低。
③用鹽酸服裂解細(xì)胞,所生成的DNA較?。s80Kb),用于Southern雜交,效果極佳。
107、簡述Southern雜交的步驟。
答:①瓊脂糖凝膠電泳分離哺乳動(dòng)物基因組DNA的限制酶切片段。
18
②將DNA從瓊脂糖凝膠轉(zhuǎn)移到固相載體上。
③放射性標(biāo)記的探針與固定化的核酸雜交。
108、將DNA或RNA從凝膠轉(zhuǎn)移到大相支持體(硝酸纖維素濾膜或尼龍膜)的方法有哪幾種?
答:
①毛細(xì)管轉(zhuǎn)移:核酸片段由液流攜帶從凝膠轉(zhuǎn)移并聚集于固相支持體表面。
②電轉(zhuǎn)移:不適用于硝酸纖維素膜。適用于尼龍膜。
③真空轉(zhuǎn)移:
109、雜交試驗(yàn)中常用降低背景的封閉劑有哪些?
答:
①Denhardt試劑:適用于Southern,Northern雜交
②BLOTTO:適用于Grusteiu-Hoyness雜交。
③肝素:適用于Southern雜交;原位雜交。
④經(jīng)變性并被打斷的鯉精DNA:適用于Southern,Northern雜交。
110、放射性標(biāo)記核酸探針的方法有哪幾種?
答:
①磷酸化法:由T4噬菌體多核甘酸激酶催化,將ATP的丫磷酸轉(zhuǎn)移到DNA或RNA的5'羥基端;
②切口平移法:利用大腸桿菌DNA聚合醐I,把雙鏈DNA未標(biāo)記的核甘酸置換成a」2P標(biāo)記的核甘酸。
③將克隆化DNA區(qū)段體外轉(zhuǎn)錄成高比活度的單鏈RNA。
11K篩選表達(dá)文庫時(shí)所用的配體有哪幾類?
答:篩選表達(dá)文庫時(shí),要利用一個(gè)能與目的蛋白特異結(jié)合的配體,這樣的配體分成3類:
①已知可在體內(nèi)與目的蛋白作用的蛋白質(zhì)或小分子化合物;
②抗目的蛋白抗原表位的免疫球蛋白;
③可被蛋白質(zhì)識(shí)別的小段DNA序列,比如真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)系統(tǒng)中的反式作用因子。
112、目前常用的DNA序列測定方法有哪幾種?
答:酶法和化學(xué)
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