李春英北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館2017年1月文摘索引型數(shù)據(jù)庫檢索與利用內(nèi)容提要文摘庫概述PubMed文摘索引型數(shù)據(jù)庫概述報道和揭示文獻的外部特征（題名、著者、出處、卷期、頁碼、時間、文獻類型、語種），同時對文獻的內(nèi)容進行摘要性描述的檢索工具。文摘報道和揭示的一般是單篇文章生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中外文摘索引數(shù)據(jù)庫美國全科醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫(Medline)荷蘭醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(Embase)美國生物學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(BIOSISPreviews)美國化學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫(SciFinder)美國科學(xué)引文索引數(shù)據(jù)庫（SCI）中國生物醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫（CBM）中文生物醫(yī)學(xué)期刊文獻數(shù)據(jù)庫（CMCC）文摘索引數(shù)據(jù)庫特點提供原文的摘要信息摘要信息包括：題目、作者、刊名，或同論文相關(guān)信息數(shù)據(jù)量大，文獻類型多、信息量大收錄文獻回溯年代長收錄文獻期刊種類多出版形式多樣文摘索引數(shù)據(jù)庫使用情況文摘數(shù)據(jù)庫的作用

1.可了解和把握某課題領(lǐng)域研究動態(tài)和研究現(xiàn)狀2.找到全文的重要和必要線索3.判斷自己課題的新穎性對不熟悉的語種文章，看英文摘要即可科研評價（學(xué)位）論文選題、開題、課題查新時文獻調(diào)研的重要途徑文摘索引數(shù)據(jù)庫掌握要領(lǐng)1.數(shù)據(jù)庫的概況2.數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)3.數(shù)據(jù)庫的檢索界面4.數(shù)據(jù)庫的檢索技巧與方法PubMed數(shù)據(jù)庫主要內(nèi)容1.數(shù)據(jù)庫概況2.數(shù)據(jù)庫檢索機制3.數(shù)據(jù)庫的組成結(jié)構(gòu)4.檢索界面5.檢索方法與技巧PubMed概況1.創(chuàng)建機構(gòu)：美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI)2.類型：Web數(shù)據(jù)庫3.網(wǎng)址：/pubmed4.特色：具有收錄范圍廣、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點，部分文獻還可在網(wǎng)上直接免費獲得全文。5.學(xué)科范圍：生物醫(yī)學(xué)、生命科學(xué)、行為科學(xué)、生物工程、化學(xué)等學(xué)科。6.與Medline光盤數(shù)據(jù)庫的區(qū)別：檢索機制、檢索界面、檢索方法以及收錄文獻數(shù)量不同。PubMed數(shù)據(jù)來源1.MEDLINE：包括OLDMEDLINE

2.InProcessCitations：每天收錄，尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。3.Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的電子文獻，每條記錄標有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。PubMed檢索機制1．自動截詞轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)對于輸入的檢索詞，PubMed先按一定的詞表順序進行對照匹配和轉(zhuǎn)換，再進行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是：MeSH表(MeSHtranslationtable)、期刊刊名表(Journaltranslationtable)、全體作者表(Fullauthortranslationtable)、作者索引(AuthorIndex)、全體調(diào)查者表(Fullinvestigatortranslationtable)、調(diào)查者索引(InvestigatorIndex)。如果在以上6個表中都找不到相匹配的詞，PubMed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上的過程，檢索時各個詞之間是AND邏輯關(guān)系。2．短語檢索(PhraseSearching)也可稱為強迫詞組檢索，即，如果要將短語作為一個詞組進行檢索，可用雙引號“”將其引起來。如：“drugtherapy”作為詞組進行檢索的詞，系統(tǒng)不進行自動轉(zhuǎn)換匹配，也不進行MeSH詞的擴檢。1.邏輯運算符：邏輯與：AND，邏輯或：OR，邏輯非：NOT。當(dāng)一個檢索表達式中同時含有三個運算符時，運算順序從左至右，括號可以改變運算順序。2.截詞符：*，一個詞或字拼寫出部分字母后面加上一個截詞符，chem*表示用詞根進行檢索。Heartattack*會關(guān)閉自動轉(zhuǎn)換匹配檢索詞，myocardial

infarction,

myocardialstunning,

shock等詞3.雙引號：“”，表示對引號中的短語進行檢索。4.檢索字段標識符：[tag]，tag為字段名稱。[ti]，[au]，[ta]，[so]，[la]，[pt]。PubMed檢索運算符常用字段組成標識符字段名稱TITitleAUAuthorADAffiliationABAbstractDPPublicationDateEDATEntrezDateSOSourceTAJournalTitleAbbreviationMHMeSHTermsPTPublicationType

檢索界面基本檢索高級檢索MeSH

Database檢索限定檢索期刊查詢(JournalsDatabases)引文匹配器(CitationMatcher)臨床查詢(ClinicalQueries)打開搜狗瀏覽器用戶名：jf20120001 密碼：123456PubMed檢索方法1.基本檢索：在基本檢索界面下完成的檢索方法2.高級檢索：高級檢索界面下進行的檢索方法3.MeSHDatabase檢索：MeSH主題詞界面下進行的檢索方法基本檢索基本檢索1.關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語：2.作者：SmithJS或Smith[au]3.期刊刊名：GENETHERAPY[TA]，JAMA[TA]4.截詞：CHEMO*5.復(fù)雜表達式：CANCERANDTHERAPY6.#1AND#2

艾滋病的藥物治療AidsdrugtherapySearchdetails檢索過程("acquiredimmunodeficiencysyndrome"[MeSHTerms]OR("acquired"[AllFields]AND"immunodeficiency"[AllFields]AND"syndrome"[AllFields])OR"acquiredimmunodeficiencysyndrome"[AllFields]OR"aids"[AllFields])

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改后的檢索結(jié)果高級檢索高級檢索MeSHDatabase檢索輸入查找的主題詞Aidsdrugtherapy主題詞注釋樹狀結(jié)構(gòu)表款目詞檢索步驟查看檢索歷史限定檢索1.限制檢索或條件檢索：Limits(1)日期：①Dateofpublication[DP]原始文獻出版日期；②EntrezDate[EDAT]文獻首次錄入PubMed日期；③MeSHDate[MHDA]文獻被MeSH詞條標引日期。(2)地址：單個詞加標識符[ad](3)帶有摘要文獻的檢索：CANCERANDhasabstract(4)數(shù)據(jù)庫子集的限定：特殊主題的檢索AMERICANANDhistory[sb]2.限定檢索結(jié)束后，及時取消限定條件

限定檢索限定檢索點擊取消PubMed幾種檢索方法的選擇基本檢索高級檢索MeSH

Database檢索舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻基本檢索1.檢索表達式：

childrenasthmadrugtherapy2.直接輸入檢索框中，進行檢索檢索過程（Search

details）

("child"[MeSHTerms]OR"child"[AllFields]OR"children"[AllFields])

AND

("asthma"[MeSHTerms]OR"asthma"[AllFields])AND

("drugtherapy"[Subheading]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields])OR"drugtherapy"[AllFields]OR"drugtherapy"[MeSHTerms]OR("drug"[AllFields]AND"therapy"[AllFields]))修改檢索式：

child[MeSH

Terms]ANDasthma[MeSH

Terms]AND"drugtherapy"[Subheading]舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻MeSH

Database檢索1.確定主題詞：childasthma

drugtherapy(副主題詞)2.查找主題詞舉例：兒童哮喘的藥物治療方面文獻高級檢索1.確定檢索詞：childasthmadrugtherapy2.選擇檢索字段3.輸入檢索詞JournalsDatabases主題、刊名全稱或縮寫、ISSN單篇文獻匹配器臨床咨詢特殊專題咨詢檢索結(jié)果顯示保存打印顯示格式Summary(簡要格式)Abstract（文摘格式）MEDLINE保存格式1.File(文件)2.Format（格式）檢索策略的存儲和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊保存檢索策略定期瀏覽新的檢索結(jié)果注冊或登錄個人帳號注冊后的功能保存、修改、刪除檢索式其它功能全文鏈接相關(guān)文獻鏈接相關(guān)數(shù)據(jù)庫的鏈接RSS閱讀器的使用全文鏈接全文鏈接檢索練習(xí)1.檢索有關(guān)“禽流感(birdflu)預(yù)防控制方面”的文獻2.檢索微量元素缺乏(traceelements)與皮膚病(skindiseases)關(guān)系的文獻（限英文綜述）3.利巴韋林（ribavirin）治療SARS方面的綜述文獻4.眼結(jié)核(oculartuberculosis)引起失明(blindness)的文獻5.北京大學(xué)韓濟生教授發(fā)表的英文文獻6.CANCERLETTERS期刊上查找有關(guān)基因治療方面的文獻1.檢索過程和步驟2023/2/575（1）分析課題，提煉出兩個主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)系如下：預(yù)防控制禽流感事物與特征的關(guān)系2023/2/576（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數(shù)據(jù)庫中即為選擇MeSH入口進行檢索。（3）編制檢索策略。

InfluenzainBirds/preventionandcontrol

（禽流感/預(yù)防控制）

其中主題詞為：InfluenzainBirds（禽流感）副主題詞為：preventionandcontrol（預(yù)防控制）2.檢索過程和步驟2023/2/577（1）分析課題，提煉出兩個主題概念，并明確概念之間的相互關(guān)系如下；皮膚病微量元素缺乏因果關(guān)系此外，課題還要求只要英文綜述文獻。綜述英文+2023/2/578（2）選擇檢索方式為敘詞檢索，在PUBMED數(shù)據(jù)庫中即為選擇MeSH入口進行檢索。此外，PUBMED數(shù)據(jù)庫提供有檢索結(jié)果濾鏡（ResultFilters），可對檢索結(jié)果按照不同分面進行顯示，其中有按照文獻語種、文獻類型等分面的顯示。2023/2/5782023/2/579（3）編制檢索策略。

TraceElements/deficiency（