基于模糊k最近鄰規(guī)則的葛根類藥材的模式識別_第1頁
基于模糊k最近鄰規(guī)則的葛根類藥材的模式識別_第2頁
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文檔簡介

1、    基于模糊k最近鄰規(guī)則的葛根類藥材的模式識別【摘要】 目的: 探討模糊k最近鄰算法運用于葛根類藥材模式識別的可行性。 方法 :選擇6種化學成分的含量,對不同產(chǎn)地的多種葛根類中藥的藥理抗內(nèi)毒素活性建立了模糊k最近鄰規(guī)則識別模式。結(jié)果: 模糊k最近鄰規(guī)則對葛根類中藥的藥理抗內(nèi)毒素活性識別正確率達100%,優(yōu)于經(jīng)典k最近鄰法與Bayers判別法。結(jié)論:模糊k最近鄰算法可用于中藥模式識別 研究 。 【關(guān)鍵詞】 模糊k最近鄰算法; k最近鄰算法; 模式識別; 葛屬模式識別技術(shù)是一種借助數(shù)學方法和 計算 機技術(shù)來對樣品的內(nèi)部 規(guī)律 及隱含性質(zhì)進行 分析 的綜合

2、技術(shù),包括判別分析、聚類分析、機器 學習 等多種方法。該技術(shù)已經(jīng)廣泛 應用 于各個領(lǐng)域,隨著中藥 現(xiàn)代 化進程,該項技術(shù)逐漸在中藥領(lǐng)域深入應用。k最近鄰法已被廣泛應用于模式識別的分類器設計,所謂k最近鄰法(KNN)就是取未知樣本的k個近鄰,看這k個近鄰多數(shù)屬于哪一類,就把其歸于哪一類,在分類過程中KNN是采用簡單多數(shù)投票法來確定未知樣本的分類1。 問題 是,當學習樣本類別分布不均的時候,如果僅考慮排序后的k個最近鄰而忽視樣本間的不同距離,勢必會降低KNN的分類精度2。模糊k最近鄰算法(FuzzyKNN,FKNN)就是將模糊 理論 與k最近鄰法相結(jié)合的一種監(jiān)督學習技術(shù),它有效解決了上述問題,它將

3、未知樣本與k個最近鄰的距離模糊化,并為每個類別都設置了相應的隸屬度,而不象KNN那樣簡單的將未知樣本的歸類定為“屬于”或者“不屬于”3。FKNN已被成功的應用于多個領(lǐng)域,在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測3及文本分類2都有著不錯的性能,本研究將FKNN應用于中藥的模式識別, 目前 國內(nèi)尚未見報道。1 FKNN算法的原理及實現(xiàn)本研究的FKNN算法4不同于聶生冬等5將模糊c均值聚類與KNN簡單結(jié)合,而是在KNN的基礎上結(jié)合模糊理論進行歸類決策實現(xiàn)的,其具體算法安排如下: 設已知樣本集合Pp1, p, pn,n為已知分類的樣本數(shù),c代表分類數(shù),u代表一個c×n的矩陣; 確定未知樣本的最近鄰數(shù)k的值; 選擇歐

4、式距離范數(shù)d作為距離測度; 對每個未知樣本x: 計算n個距離dd(x,pj),并對其進行排序:piP,且x Pd(1)d(2)d(3) dd(k+1) d(n)其中d(1)到d是未知樣本x的k個最近鄰與x的距離。 在u中找出對應于k個最近鄰距離的k個列uj,其中j1,2, k。 利用上一步從u中獲得的k個列uj,計算4:ui(x)=kj=1uij1d(x,pj)2m-1 kj=11d(x,pj)2m-1其中m為模糊權(quán)重調(diào)節(jié)因子,對于z1,2, ,c,如果ui(x)=maxuz(x),zi,則x屬于第i類。取下一個未知樣本轉(zhuǎn)到(4)繼續(xù),上述算法不是迭代過程,每個未知樣本都必須按照上述算法處理一

5、遍。2 中藥葛根類藥材的模式識別中藥模式識別通常是根據(jù)中藥所含化學成分的整體進行分類或描述,識別該中藥的真?zhèn)闻c優(yōu)劣。葛根為豆科植物野葛或甘葛藤的干燥根,全世界已知的葛屬植物大約有18種,我國是葛屬植物的原產(chǎn)地之一,分布極其廣泛,葛屬植物有9個種和2個變種,其中7種與藥用有關(guān), 研究 結(jié)果表明,不同葛屬植物中藥用成分異黃酮含量和組分差異顯著。曾明等7對8個來源共17個藥材樣本的葛屬植物的總黃酮X1、葛根素X2、大豆苷X3、大豆苷元X4、3甲氧基葛根素X5及多糖X6,6個化學成分進行了測定6,并測定了相應的抗內(nèi)毒素活性強度,按照 文獻 8 方法 對各藥材的抗內(nèi)毒素活性強度進行分類,強度較弱者記為1

6、,強度較強者記為2,結(jié)果見表1。本研究運用模糊k最近鄰算法以6個化學成分的含量為輸入變量,藥理活性強度分類為目標類別建立模式識別模型。從表1原始數(shù)據(jù)隨機選取5個作為未知數(shù)據(jù)進行測試,剩余12個作為已知數(shù)據(jù)進行 學習 ,將各數(shù)據(jù)進行歸一化處理后,運行FKNN算法,算法實現(xiàn)語言為MATLAB。對于FKNN,k值對分類器的性能有顯著 影響 ,表2是不同k值下FKNN的分類精度。由表2結(jié)果可見當k值大于等于7時,F(xiàn)KNN具有最好的分類精度,對未知數(shù)據(jù)集及整個數(shù)據(jù)集的識別正確率都達到了100%,在本例中k取7進行建模識別,識別結(jié)果見表1。我們也嘗試用經(jīng)典KNN法對數(shù)據(jù)進行分類,結(jié)果見表3,可見,在相同k

7、值下FKNN都要比KNN表現(xiàn)出更好的分類性能。就本例數(shù)據(jù)而言,無論我們怎么調(diào)整參數(shù),KNN法的分類精度都不能令人滿意。張漢明等8也對同樣的數(shù)據(jù)進行了Bayers判別 分析 ,結(jié)果回判的識別正確率也僅有88%與94%。表1 17個藥材樣品的化學與藥理模式數(shù)據(jù)(*為測試數(shù)據(jù))(略)表2 不同k值下FKNN的分類精度(略)表3 不同k值下KNN的分類精度(略)3 結(jié)果與討論FKNN作為一種監(jiān)督學習技術(shù),將對每一個未知樣本進行相同的算法處理,且由于其算法不是迭代過程,因此也不存在不收斂的現(xiàn)象。另外,對于模糊權(quán)重調(diào)節(jié)因子m的取值, 理論 上可以是任意的,根據(jù)文獻4,本研究取值m=2,我們也對m在1,3范

8、圍內(nèi),以0.1為步長考察了不同m值對FKNN分類精度的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)并無差異。在m=2,k=7時FKNN對17種葛根類中藥的藥理抗內(nèi)毒素活性識別正確率達100%,識別精度要優(yōu)于k最近鄰法及文獻8的Bayers判別法,F(xiàn)KNN可以用于中藥的模式識別研究。【 參考 文獻】1 Jiawei Han,Micheline Kamber. 著. 范明,孟曉峰,等譯. 數(shù)據(jù)挖掘概念與技術(shù). 北京:機械 工業(yè) 出版社,2001:209.2 Shang Wenqian,Qu Youli,Huang Houkuan,etal. Fuzzy knn text classifier based on gini ind

9、ex. Journal of Guangxi Normal University:Natural Science Edition,2006,24(4):8790.3 Rajkuar Bondugula,Ognen Duzlevski,Xu Dong. Profiles and Fuzzy knearest neighbor algorithm for protein secondary structure prediction. AsiaPacific Bioinformatics Conference, 2005:8594.4 J. M. Keller,M. R. Gray,J. A. Givens. A fuzzy knearest neighbor algorithm. IEEE Trans on SMC, 1985,15(4):580585.5 聶生東,聶斌,章魯,等. 基于模糊k近鄰規(guī)則的多譜磁共振腦圖像分割方法的研究.  中國 生物醫(yī)學工程學報,2002,21(5):471477.6 曾明,張漢明,鄭水慶,等. 葛屬植物根的異黃酮類成分分析. 第二軍醫(yī)大學學報,1998

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