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文檔簡介
江蘇省人民醫院南京醫科大學第一附屬醫院醫學信息學科建設的實踐與思考劉云2017年9月2日概況3概況江蘇省立醫政學院附屬診療所江蘇省工人醫院江蘇醫學院附屬醫院江蘇省人民醫院南京醫學院一附院江蘇省紅十字醫院江蘇省人民醫院南醫大一附院江蘇省紅十字醫4院江蘇省臨床醫學研究院5概況床位(張)占地面積(畝)建筑面積(m2)江蘇省人民醫院/南京醫科大學一附院452523 1845婦幼分院城北分院406概況集團化以品牌和技術為紐帶,共同發展區域協同戰略合作+技術支持60余家院府合作突出優質資源與政府主導對口支援送下去、接上來40余家概況國家重點學科國家重點學科培育點心血管病學內科學國家重點學科國家重點學科培育點心血管病學內科學聽力國際中國分中心WHO預防聾和聽力減退國家重點實驗室生殖醫學(臨床中心)省臨床醫學中心合WHO預防聾和聽力減退國家重點實驗室生殖醫學(臨床中心)省臨床醫學中心合作中心國家臨床重點專科建設單位18個省醫學重點學科國家藥物臨床試驗機構28個省級醫療診治中心個臨床醫學2個12個5個6個27個院國際院士概況長江學者國家杰出青年基金獲得者國家優秀青年基金獲得者國家有突出貢獻專家國家百千萬人才工程江蘇省雙創團隊江蘇省雙創人才省“333”工程人才層次15人省青藍工程人才24人省科教強衛工程杰出人才4人省科教強衛工程重點人才32人899概況診療人次(萬)2012年2013年2014年2015年2016年337.6343.9371.6395.4396.4出出院人次(萬)/手術臺次(萬)2012年2013年2014年2015年2016年8.79.411.212.313.95.05.36.06.57.4平平均住院日(天)2012年2013年2014年2015年2016年9.89.49.29.08.2學院學學學學院學學學液病學濕病學學科學總論科學外科學外科學科學形燙傷科診斷學射學技術學斷學生物檢驗學與性病學學學學臨床醫學工程學一臨床醫學院科學系中西醫結合學系系系學系醫學系科學系中西醫結合學系系系學系醫學系每年完成南京醫科大學各類教學任務(含帶教研究生折合課時)約8.6萬學10時國家住院醫師規范化培訓示范基地專業基地26個基本外科、泌尿外科通過英國愛丁堡皇家外科學院和香港外科醫學院認證專項技術培訓基地11個江蘇省臨床醫學教育研究所依托單位率先探索構建“5+3+X”人才培養體系臨床技能培訓通過美國心臟協會的生命支持課程體系認證相關課程通過英國皇家外科學院認證繼續教育全國職工教育培訓優秀示范點打造教育品牌“金陵臨床醫學高層論壇”“青年管理沙龍”11新平臺撐平臺轉化平臺中心寧生命科技轉基礎研究創新新平臺撐平臺轉化平臺中心寧生命科技轉基礎研究創新科研究所新藥與醫療器平臺學實驗室江蘇省臨床醫學研研究所良反應據庫臨床研究應用轉化研究所產品化產業化究所組心概況省臨床醫學研究院GCPGCP中心 (AHHARP認證)藥城轉化寧細胞治療中心析中心概況2012年2013年2014年2015年2016年科研項目(項)238274國自然(項)學術論文(篇)SCI論文(篇)38541345745559868937742人才建設經費(萬元)29708940274026932300獎項(項)242522作為牽頭單位承擔“十三五”國家重點研發計劃精準醫學專項1項全國醫療機構學術論文排行榜 (中國科技信息研究所)在全國醫療機構:Medline收錄論文列第6位表現不俗論文列第7位SCIE論文分別位列第12位引領江蘇,輻射周邊,在全國有重要地位和一定國際影響的國家級臨床醫學中心Dr.Colenisnotonlyaniconinourfield;heisalsothegrandfatherofthisrapidlychangingandDr.Colen,withopenbinder,explainspotentialusesofthecomputerinmedicalcaretoavisitingdelegationfromthrivingdisciperofMedicirnmg,sDCin1966.?1950s?1950s:開始嘗試使用尚處于開發階段的計算機處理生物醫學數據?1960s:醫學信息學最早的雛形:利用光譜和其他物理方法來分析探測可能的分子結構?1977:第三屆MEDINFO大會上,Dr.Morris闡明“MedicalInformatics”?1980s:隨著微型計算機和網絡技術的應用,推進醫學信息學發展?顛覆醫療:大數據時代的個人健康革命?數據密集型科學發現:利用計算機技術從大數據中發現和理解自然和世界?以需求為導向,健康醫療相關領域數據整合應用?對醫學進行一次“創造性破壞”?多元化的醫學信息學研究模式逐步形成絡技展催生醫學增長促使快速發展逐步形成-17-17概概念1是指探討生物學的、醫學的或者更廣義的健康數據的采集、存儲、交互和展現的過程的科學;探討如何利用信息科技來優化這些過程的科學;如何利用這些數據實現信息和知識層次的各種應用的科學。概概念2這是由不同學科相互交叉、滲透、融合,并在不同耦合點上進行創新和重建后形成的一門嶄新的、獨立學科。概概念3基礎研究包括編程以外的方法學上的創新,并把這些創新應用于醫學信信息處理信息組織信息檢索信息處理信息組織信息檢索臨床醫學醫學影像學護理學生物學公共衛生信息科學計算機科學醫學信息學信息處醫學信息學文本挖掘技術數據交互技術遠程通信技術醫療衛生科學MIMedicineinformation教育、科研新興交叉學科。——GreenesRA,ShortliffeEH.Medicalinformatics:anemergingacademicdisciplineandinstitutionalpriority.JAMA,1990,263:1114-1120.計算機科學(硬件)計算機科學(軟件)臨床醫學基礎生物醫學認知學生物工程學管理學計算機科學(硬件)計算機科學(軟件)臨床醫學基礎生物醫學認知學生物工程學管理學流行病統計學公衛信息學臨床信息學醫學信息學影像信息學生物信息學公共衛生個體器官組織細胞亞細胞基因分子自然語言處理(自然語言處理(Natural-languageprocessing)向向健康與生物信息學子學科健康與生物信息學子學科(HealthandBiomedicalInformaticsSubdiscipline)?臨床信息學(Clinicalresearchinformatics)?公眾健康信息學(Consumerhealthinformatics)?轉化醫學信息學(Translationalbioinformatics)……面向特定健康問題面向特定健康問題(HealthProblemAddressed)?臨床決策支持(ClinicalDecisionSupport)?慢性病管理(ManagementofChronicDisease)?個性化醫療(PersonalizedMedicine)……信息方法、系統和技術(InformationMethods、SystemsandTechnologies)?臨床系統(ClinicalSystems)?受控術語和詞匯表(Controlledterminologiesandvocabulary)……學科建設方面學科建設方面n美國的NIH(美國國立衛生研究院)、美國斯坦福大學等n法國的Rennes大學等n德國的海德堡大學、lubeck大學等n荷蘭的阿姆斯特丹大學,Erasmus大學等都建立了醫學信息學科。n據美國醫學信息學會(AMIA)統計,共有83家大學、研究所、圖書館開設了該專業,大學已經超過了60個,具備了完整的教學體系、課程設置、師資隊伍。醫學信息學在國外早已建立了完善的教育體系,并不斷優化發展n國際醫學信息學會(n國際醫學信息學會(IMIA)n醫療信息與管理系統協會(HIMSS)n歐洲醫學信息學聯盟(EFMI)n美國醫學信息學會(AMIA)n英國計算機學會衛生信息學會n德國醫學信息學會(GMIA)n美國醫療信息與管理系統學會(HIMSS) 國外本學科主要期刊有:《美國醫學信息學會期刊》、《國際醫學信息學期刊》、《生物醫學信息學期刊》、《醫學信息學方法》、《醫學信息學年鑒》、《理論醫學》、《醫學Informatics》等。HealthHealthinformatics相關國家政策相關國家政策2011年10月十部委《醫學科技發展“十二五”規劃》,首次明確提出“發展醫學信息學”,“開展數字化醫療技術研究”。2016年6月21日《國務院辦公廳關于促進和規范健康醫療大數據應用發展的指導意見》提出,要“加強健康醫療信息化復合型人才隊伍建設,強化醫學信設。”2016年8月26日中共中央政治局審議通過了“健康中國2030”規劃綱要(習近平主持會系”戰略構想。在我國數百所大專院校本科培養專業中,已經開設醫學信息專業我國目前大部分高校的醫學信息學的發展還只集中在以醫學圖書情報為主力軍,研究應用:集中在醫院信息系南通大學、華中科技大學、中國南通大學、華中科技大學、中國科技大學、上海大學、華南師范大學、廣西醫科大學等部部分院校關閉了該專業我國醫學信息工程的發展與國際先進水平相比有一定差距!19941997200020032006我國醫學信息工程的發展與國際先進水平相比有一定差距!.招收博士和碩士生.與歐美、澳大利亞合作–華東師大,數據科學與工程學院.以“應用驅動創新”為核心理念醫療機構企業單位醫療機構政府機關高政府機關n中國衛生信息學會n中華醫學會醫學信息學分會n中華醫院管理學會信息管理專業委員會(CHIMA)n中國醫藥信息學會n香港醫學信息學會(HongKongSocietyofMedicalInformatics)n中華醫院信息網絡大會(CHNIC)醫學信息學學科建設國內發展情況 信息》、《中國醫學信息學術研究》、《醫藥與計算機》等國內雜志具有一定的水準,但和國際影響力的雜志相比還有一定的距離!醫學信息學學科建設??學科體系的建設??專業人才隊伍??可持續發展醫學信息學學科建設我們的實踐將醫學信息工程納入科學建設體系在基礎理論研究、新技術研究和應用領域研究三個方面生成系統的專門知識進一步完善專業體系,拓寬學科范疇,助力醫學革新醫學信息工程學院醫學信息學與管理研究所醫學信息學學科建設我們的實踐醫學信息工程學院醫學信息學與管理研究所醫學信息工程專業醫學信息學學科建設我們的實踐建立建立醫學信息學與管理研究所,為醫學信息學科建設提供舞臺–2016年8月,南京醫科大學醫學信息學與管理研究所正式成立–2017年4月,舉行第一次學術會議我們的實踐醫學信息學學科建設我們的實踐?開展醫學信息學及管理領域熱點研究?醫學信息學標準研究?醫療大數據應用理論與實踐?新信息技術在醫療領域的應用?現代醫院信息化項目管理模式探討?醫學信息學人才培理論與實踐?產業孵化基地與轉化平臺,構建醫院信息化產業鏈。形成“產學研用”一體化運作平臺,促進關鍵應用技術的產業化,推進相關健康醫療產業的發展。?醫院信息人才培訓基地。為醫院提供各類專業化醫院信息人才培訓,有效解決當前醫院信息人才缺乏專業專門培訓機構、培訓基地的難題。聯合科研、開放共享?多家附屬醫院共同參與的組織構架?醫學信息學在科研維度實現專業化?定期舉行由工程師和科學家一起參ting?采用PI機制一、基本專業07學科門類:理學0710生物科學類071003生物信息學08學科門類:工學0826生物醫學工程類082601生物醫學工程二、特設專業08學科門類:工學0807電子信息類080711T醫學信息工程醫學信息學學科建設?4年制、工學學士懂懂醫療業務流程衛生信息化建設復合型具有人才熟悉醫學技術現代信息基礎技術息、信息安全、大數據等方面的專業的教師組成的碩士以上學歷比例占100%,博士研究生占80%以上特聘了美國德州大學、美國匹茲堡大學、臺灣陽明大學、南京大學等國內外高校在該領域的頂尖依托南京醫科大學各附屬醫院及相關軟件企業,一對一的“傳、幫、帶”指導,提高其實踐能力外專家多醫學信息領外專家多醫學信息領域發展方向和熱制定相應課程,做到因計算機基礎高等數學線性代數體育英語思想道德修養與法律基礎系統解剖學基礎醫學綜合信息論與編碼原理高等數學高級程序設計與數據結構物理學體育英語概率論與數理統計數字信號處理生理學病理學物理學英語毛澤東思想和中國特色社會主義醫學統計數字電子技術診斷學臨床醫學概論(上)信息資源管理計算機原理與匯編語言優化算法與運籌學專業英語醫學成像原理課程設計數據庫原理軟件工程與項目管理醫學圖像處理網絡技術及醫院網絡管理架構信息分析與預測腳本程序設計醫院管理學云計算英語信息安全數值分析醫院信息系統自然語言處理臨床醫學概論(下)醫學倫理學信息分析信息組織學機器學習人機交互醫學信息檢索與網絡資源臨床醫學綜合醫療物聯網技術醫學信息學學科建設我們的實踐醫學信息工程專業(四年制)培養方案(2017年)醫學信息學學科建設我們的實踐設立醫學信息設立醫學信息工程專業,為醫院信息化建設提供后備軍前期論證情況——醫學信息工程專業論證會我們的實踐參考參考臨床學科體系建設,提出構建醫院信息領域亞專科體系2012年定位--我院信息處是研究所學歷占比90%的隊伍,所以,醫院信息部門應該和臨床一樣,必須加強學科建設和人才培養模式。信信息處學科建設?管理制度重要制度,有信息化建設順院信息化領域各子領域都需度保障。同時索信息化建設度建設與實踐?安全制度?管理制度?培訓制度?薪酬制度?晉升制度?接待制度硬件、網絡、軟件、臨床業務硬件、網絡、軟件、臨床業務?新人輪轉機舉辦各類國家級、省級培訓班30余次,學員數量6000人次?科大學醫學信息相關專業的實習基地息人員繼續教育工作。科必修課程的見習帶教。2016年接待15個省36家兄弟醫院信息化建設領域的訪問交流。應邀參加國家衛計委“十三五”醫院信息互聯互通建設指南的編寫、醫院信息統計崗位人力資源配置的研討工作,引領信息學科的發展。人才梯隊不斷擴大,學術影響力不斷提升60《醫院信息互聯互通標準化成熟度測評與案例分析》《醫院信息安全實用技術與案例應用》?發表的代表性論文50多篇,其中SCI收錄2篇.–《2006-2013年肝癌患者住院費用的影響因素分析》置信水平為99%,可認為住院費用高于年齡較輕者。.–《2006-2013年肝癌患者住院費用的影響因素分析》?住院費用按負擔方式分析結果顯示,公費病人平均住院費用分別是醫療保險患者和自費病人的1.97倍和1.38倍。?進一步運用非參數Kruska-WallisH檢驗考察不同付費方式患者在住院費用上的差異,結果見表5,卡方值為185.141(P=0.000),進一步說明公費病人的平均住院費用顯著高于自費病人。?線性回歸模型R=0.579,R2=0.335,線性回歸方程擬合為:Y=9.571+0.003X1+0.034X2-0.460X3?根據表6模型的擬合效果可見,三個自變量均達到了0.000的顯著性水平,各因素對住院費用影響大小排列如下:住院天數(0.551)>付費方式(0.202)>年齡(0.037)隨著并發癥數量的增加,患者住院費用顯著性增加有效控制糖尿病并發癥數量,可有效控制住院費用,減輕患者痛苦,降低經濟負擔???論文發表gedstbutooabetcpatetsoto發年齡輕化趨勢,40歲以下糖尿病患者數量正在逐漸增多–《糖尿病患者衛生經濟學研究》均住院天數分布均住院天數分布天數分析者住院費用分布平均每天住院費用?糖尿病患者的住院天數、住院費用與患者年齡有直接關系,患者年齡越大,住院天數以及住院費用也越多。布布?非老年組患病率逐年提高.論文發表–《從2006-2013住院患者分析糖尿病與腫瘤相關性》?糖尿病與腫瘤近幾年發病例增長較快圖12006年-2013年糖尿病、腫瘤及糖尿病腫瘤百分比變化圖?患糖尿病并發腫瘤患者呈現男性發生率高于女性現象,而且近年來升高趨勢更??糖尿病合并腫瘤患者的發病率與年齡有顯著相關性2013住院患者分析糖尿病與腫瘤相關性》在男性患者中肝多,眾多男性飲酒、抽煙等不良生活糖尿病的平均住院費用近年來也在不斷上升?對于糖尿病并發腫瘤的患者平均住院費用普遍高于非腫瘤糖尿病患者,腫瘤的并發加重了患者負擔?在女性患者中子宮肌瘤和乳腺癌比例較多,有明顯的性別特征,從統計角度說明了糖尿病對性激素的影響?科研項目?科研項目?軟件著作獲得軟件著作權18項?醫療大數據應用技術工程實驗室與揚子國投、東南大學等單位共同組建醫療大數據應用技術工程實驗室。技術團隊孫嘯劉云陳峰滕皋軍包華東南大學信息與系統生物學系主任、江蘇省生物信息學專業委員會主任、中國細胞學會功能基因組信息學與系統生物學分會常務理事。江蘇省人民醫院副院長、中國醫學信息學會安全委員會委員、中國醫藥信息學會江蘇學會副理事長。南京醫科大學公共衛生學院院長、國際生物統計學會中國分會副理事長、中國衛生信息學會統計理論與方法專業委員會主任委員。東南大學附屬中大醫院院長、江蘇省分子影像與功能影像重點實驗室主任。揚子集團世和基因生物技術有限公司生物信息研發總監。美國印第安納州立大學Dr.美國印第安納州立大學Dr.Dixon’sVisit美國賓夕法尼亞州匹茨堡大學講座座師夷長技以自強71目前研究所和美國德州大學生物醫學信息學學院(SchoolofBiomedicalInformatics,TheUniversityofTexasHealthScienceCenter)基于醫療大數據研究與應用方面展開深度學術合作。使用軟件工具析、數據可視使用軟件工具析、數據可視化OMOPCDMVer.5.0?臨床大數據應用研究–慢性病診療路徑研究基于OMOPCDM的科研應用CDRCDR數據(2005.1.1—.12.31).臨床大數據應用研究–慢性病診療路徑研究年年百分比百分比年年圖3A三種慢病各年份用藥序列中只有一種藥的比例圖3B只有一輪用藥,且用的是最常用的一種藥百分比年圖3C第一輪用了最常用的一種藥醫學本體非結構化文書經NLP處理本體實例醫學本體非結構化文書經NLP處理本體實例?臨床大數據應用研究–自然語言處理將醫學領域本體與NLP技術相結合,實現傳統檢查報告、影像學、病理學、病程記錄、電子病歷等數據的結構化抽取。輔助臨床醫生決策,為后期數據深度應用結結構化數據應用影像學報告非影像學影像學報告非影像學檢查用藥情況病理報告?臨床大數據應用研究–乳腺癌風險預測ü在乳腺癌危險因素數據基礎上構建一個完善的乳腺癌風險預測模型。ü預測罹患乳腺癌風險度、患者復發風患者患者健康狀況……檢檢驗結果?臨床大數據應用研究–吡格列酮對2-型糖尿病患者心血管事件風險的分析研究糖尿病患者中服用件發生風險的?采用回顧性隊列分析?對比藥物——吡格列酮與二甲雙胍、磺脲類和阿卡波糖對比分析。?終點事件——心肌梗塞、腦卒中、心衰和冠心病。?協變量——胰島素用藥情況、是否發生過高血壓、在糖尿病診斷之前是否發生過冠心病、是否發生過高脂血癥、是否發送過慢性腎功能不全、是否服用過降血脂藥、是否服用過降血壓藥及Charlson評分。0.2)MI+Stroke201902(99.8)0?臨床大數據應用研究–吡格列酮對2-型糖尿病患者心血管事件風險的分析 PioglitazoneUseNoEventNEvent(N%)HRCI(lower-upper)
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