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文檔簡介
1、關于生物信息的傳遞上轉錄第一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月一、基本概念生物體以DNA為模板合成RNA的過程 。轉錄(transcription) :第三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月參與轉錄的物質原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板:DNA酶: RNA聚合酶其他蛋白質因子RNA合成方向:5 3第四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第五張,
2、PPT共九十二頁,創作于2022年6月轉錄的不對稱性: 在RNA的合成中,DNA的二條鏈中僅有一條鏈可作為轉錄的模板,稱為轉錄的不對稱性。編碼鏈與模板鏈與mRNA序列相同的那條DNA鏈稱為編碼鏈;將另一條根據堿基互補原則指導mRNA合成的DNA鏈稱為模板鏈。第六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月模板鏈并非永遠在同一條單鏈上轉錄方向5335模板鏈編碼鏈編碼鏈模板鏈轉錄方向DNA分子上轉錄出RNA的區段,稱為結構基因。結構基因:第八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月幾個概念第九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月轉錄單位RNA鏈的
3、轉錄,起始于DNA模板的一個特定位點,并在另一位點終止,此轉錄區域稱為一個轉錄單位。一個轉錄單位可以是一個基因(真核),也可以是多個基因(原核)。基因的轉錄是有選擇性的,細胞不同生長發育階段和細胞環境條件的改變,將轉錄不同的基因。轉錄的起始由DNA上的啟動子區控制,轉錄的終止由DNA上的終止子控制,轉錄是通過DNA指導的RNA聚合酶來實現的 第十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月二、參
4、與轉錄起始的關鍵酶與元件(一) RNA聚合酶原核生物RNA聚合酶(大腸桿菌為例)全酶=核心酶+ 因子第十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月大腸桿菌RNA聚合酶的組成分析亞基基因相對分子量亞基數組分功能rpoA365002核心酶核心酶組裝,啟動子識別rpoB1510001核心酶和共同形成RNA合成的活性中心rpoC1550001核心酶?110001核心酶?rpoD700001因子存在多種因子,用于識別不同的啟動子第十六張,PPT共九十二頁,創作
5、于2022年6月 真核生物RNA聚合酶酶位置轉錄產物相對活性對-鵝膏蕈堿的敏感性RNA聚合酶核仁rRNA50-70%不敏感RNA聚合酶核質hnRNA20-40%敏感RNA聚合酶核質tRNA約10%存在物種特異性真核細胞的三種RNA聚合酶特征比較第十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月RNA聚合酶與DNA聚合酶的區別RNA聚合酶DNA聚合酶大小(M)大,4.8105dol小,1.09105dol引物無有產物較短,游離較長,與模板以氫鍵相連作用方式一條鏈的某一段兩條鏈同時進行外切酶活性無5 3,3 5校對合成能力無有修復能力無有第十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月(二) 啟動子
6、(promoter)啟動子定義:指能被RNA聚合酶識別、結合并啟動基因轉錄的一段DNA序列。 第十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 原核生物啟動子結構Pribnow41-44bp第二十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月開始轉錄T T G A C AA A C T G T-35 區(Pribnow box)T A T A A T Pu A T A T T A Py-10 區1-30-5010-10-40-205 3 3 5 原核生物啟動子保守序列RNA-pol辨認位點55RNA聚合酶保護區結構基因33第二十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 TTGACA區:提供了R
7、NA聚合酶全酶識別的信號 TATA區:酶的緊密結合位點(富含AT堿基,利于雙鏈打開) 第二十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月編碼鏈AACTGTATATTA模板鏈TTGACATATAAT35DNA轉錄起始點Probnow盒子啟動子35 10 +1轉錄區53RNA轉錄起點與新生RNA鏈第一個核甘酸相對應DNA鏈上的堿基。第二十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月大腸桿菌RNA聚合酶全酶所識別的啟動子區T85T83G81A61C69A52T89A89T50A65A100第二十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月典型啟動子的結構 -35 -10 轉錄起點TTGACA 16-
8、19bp TATAAT 5-9bp第二十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月Initiation第二十六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 真核生物啟動子真核有三種不同的啟動子和有關的元件啟動子最為復雜,它和原核的啟動子有很多不同真核生物啟動子的結構核心啟動子(core promoter)上游啟動子元件(upstream promoter element,UPE)第二十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月1、核心啟動子 定義:指保證RNA聚合酶轉錄正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括轉錄起始位點及轉錄起始位點上游TATA區作用:選擇正確的轉錄起始位點,保證精確起始T
9、ATA 常在-25bp左右,相當于原核的-10序列T85A97T93A85A63A83A50第二十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第二十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月2、上游啟動子元件包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等作用:控制轉錄起始頻率。CAAT:-70 - -80bpGGGCGG:-80 - -110bp第三十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月SV40 早期啟動子組蛋白H2B TATACAATGC第三十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月(三) 轉錄起始復合物 原核生物轉錄起始復合物第三十二張,PPT共九十二頁,創作于2022
10、年6月 轉錄因子 轉錄復合體TBPTAFsTFIIATFIIB TFIIF Pol IITFIIE RNA pol 的轉錄起始 真核生物轉錄起始復合物第三十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第三十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月三、轉錄的基本過程1、起始位點的識別:RNA聚合酶與啟動子DNA雙鏈相互作用并與之相結合的過程。2、轉錄起始RNA鏈上第一個核甘酸鍵的產生第三十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第三十
11、六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月3、RNA鏈的延伸 亞基脫落,RNApol聚合酶核心酶變構,與模板結合松弛,沿著DNA模板前移;在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。核心酶 DNA RNA第三十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月4、轉錄終止 終止子(terminator,t) 強終止子內部終止子 弱終止子 需要因子(rho factor) 又稱為依賴性終止子 (Rho-dependent terminator)不依賴Rho ()因子的轉錄終止依賴Rho ()因子的轉錄終止第三十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月不依賴因子的終止 終止位點上游一般存在一
12、個富含GC堿基的二重對稱區,RNA形成發夾結構;在終止位點前面有一段由4-8個A組成的序列,RNA的3端為寡聚U第三十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月發夾式結構和寡聚U的共同作用使RNA從三元復合物中解離出來。第四十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 終止效率與二重對稱序列和寡聚U的長短有關,長度 效率第四十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月依賴因子的終止因子:六聚體蛋白、水解各種核甘三磷酸促使新生RNA鏈從三元轉錄復合物中解離出來,從而終止轉錄。第四十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第四十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第四十四張,PPT
13、共九十二頁,創作于2022年6月第四十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第四十六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月四、轉錄后加工第四十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月5端加帽3端加尾RNA的剪接RNA的編輯第四十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 5端的一個核苷酸總是7-甲基鳥核苷三磷酸(m7Gppp)。mRNA5端的這種結構稱為帽子(cap)。1、在5端加帽第四十九張,PPT共九十二頁,創作于202
14、2年6月m7Gppp鳥苷酸轉移酶第五十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 帽子結構功能: 能被核糖體小亞基識別,促使mRNA和核糖體的結合; m7Gppp結構能有效地封閉mRNA 5末端,以保護mRNA免受5核酸外切酶的降解,增強mRNA的穩定。第五十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月2、3端加尾多聚腺苷酸尾巴AAUAAA:準確切割加poly(A)第五十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第五十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月多聚腺苷酸尾巴功能:提高了mRNA在細胞質中的穩定性。第五十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月3、RNA的剪接地中海貧血病
15、人的珠蛋白基因,1/4第五十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月真核mRNA的剪輯第五十六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第五十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第五十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月生物體內內含子的主要類型:GU-AG、AU-AC、類內含子、類內含子5.AAGUAAGU .CURAY.(10-40)(U/C)11NCAG G.3 IntronexonexonPolyprimidine第五十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 5.AAGUAAGU .CURAY.(10-40)(U/C)11NCAG G.3 Intronexone
16、xonPolyprimidineCAG = UAG AAG GAG第六十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月參與RNA剪接的物質:snRNA(核內小分子RNA)snRNP(與snRNA結合的核蛋白) 第六十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第六十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月UACUACA - AGUGU4U5U6E1E2U1U2UACUACA - AGUGU6E1E2U1、U4、U5第六十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第六十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月類內含子的自我剪接第六十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月類內含子的自我
17、剪接第六十六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月4、RNA的編輯編輯(editing)是指轉錄后的RNA在編碼區發生堿基的突變、加入或丟失等現象。第六十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月C變為U堿基的突變第六十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月尿苷酸的缺失和添加1986.R.Benne在研究錐蟲線粒體mRNA轉錄加工時發現mRNA的多個編碼位置上加入或丟失尿苷酸,1990年在高等動物和病毒中也發現了編輯現象。第六十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 錐蟲coxII 基因的編輯第七十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月第七十一張,PPT共九十二頁,創作于
18、2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第七十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月五、原核生物與真核生物mRNA的特征比較1、原核生物mRNA的特征 半衰期短 多以多順反子的形式存在 多順反子mRNA:編碼多個蛋白質的mRNA。單順反子mRNA:只編碼一個蛋白質的mRNA。第七十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 結構基因Z: -半乳糖苷酶Y: 透過酶A:乙酰基轉移酶ZYAOPDNA第七十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 5 端無“帽子
19、”結構, 3 端沒有或只有較短的poly(A )結構。SD序列:mRNA中用于結合原核生物核糖體的序列。 第七十五張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月2、真核生物mRNA的特征 5 端存在“帽子”結構多數mRNA 3 端具有poly(A )尾巴(組蛋白除外)以單順反子的形式存在“基因”的分子生物學定義:產生一條多肽鏈或功能RNA所必需的全部核甘酸序列。第七十六張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月原核生物和真核生物mRNA結構的比較第七十七張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 基本概念 轉錄起始: RNA聚合酶、啟動子 轉錄的基本過程 轉錄后加工 原核生物與真核生物mRNA的特
20、征比較 RNA合成與DNA合成異同點Contents第七十八張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月六、RNA合成與DNA合成異同點相同點:1、都以DNA鏈作為模板2、合成的方向均為53 3、聚合反應均是通過核苷酸之間形成的3,5-磷酸 二酯鍵,使核苷酸鏈延長。第七十九張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月不同點:復制轉錄模板兩條鏈均復制模板鏈轉錄(不對稱轉錄)原料dNTPNTP酶DNA聚合酶RNA聚合酶產物子代雙鏈DNA(半保留復制)mRNA, tRNA, rRNA配對A-T;G-CA-U;T-A;G-C引物RNA引物無第八十張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月中國科學院2001
21、年碩士研究生入學考試 :名詞解釋:Transcription; Reverse transcription 第八十一張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月1、下列有關TATA盒(Hognessbox)的敘述,哪個是正確的:它位于第一個結構基因處它和RNA聚合酶結合它編碼阻遏蛋白它和反密碼子結合 B 第八十二張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月 2. 轉錄需要的原料是: dNTPB. dNDP C. dNMP D. NTP E . NMPD第八十三張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月3、DNA模板鏈為 5-ATTCAG-3 , 其轉錄產物是: A. 5 -GACTTA-3 B. 5 -CTGAAT-3 C. 5 -UAAGUC-3 D. 5 -CUGAAU-3 D第八十四張,PPT共九十二頁,創作于2022年6月4、 DNA復制和轉錄過程有許多相同點,下列描述哪項是錯誤的? A.轉錄以DNA一條鏈為模板,而以DNA兩條鏈為模板進行復制 B. 在這兩個過程中合成均為5-3方向 C. 復制的產物通常情況下大于轉錄的產物 D. 兩過程均需R
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