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文檔簡介
利用16SrDNA鑒定細菌的種屬精選課件1.什么是16SrDNA?16SrRNA為原核生物核糖體RNA的一個亞基,16SrDNA就是編碼該亞基的基因。原核生物的rRNA含有3種類型:23S、16S、5SrRNA,它們分別含有2900、1540和120個核苷酸。2.用16SrDNA進行細菌鑒定的原因16SrDNA在原核生物中普遍存在。16SrDNA的相對分子量大小適中,約1500bp,便于序列分析。在16SrRNA分子中,既含有高度保守的序列區域,又有中度保守和高度變化的序列區域,因而它適用于進化距離不同的各類生物親緣關系的研究。bp=basepair精選課件圖
16SrDNA基因組成〔灰色為保守區,綠色為可變區〕
16SrDNA基因全長1542bp,由9個可變區和10個保守區組成。其中保守區反映了生物物種間的親緣關系,而可變區那么說明物種間的差異,且變異程度與細菌的系統發育密切相關。精選課件精選課件DNA的提取挑取單菌落,然后置于裝有100μLPrepManUltra的離心管中,渦旋震蕩混勻30s左右,然后100℃水浴10min后,以離心機最大轉速離心3min,取10μL上清液與490μLddH2O〔即稀釋50倍〕,混勻作為下步PCR的模板DNA。提取的DNA于-20℃保存。檢測:核酸蛋白儀/瓊脂糖凝膠電泳精選課件1525R5'AAGGAGGTGWTCCARCC3'精選課件PCR反響條件試劑使用量〔20μL體系〕模板DNA〔10ng~100ng〕2μLTaq酶(5U/μL)0.2μL10×TaqBuffer(Mg2+)2μLdNTPs(2.5mM)1μL引物F(10μM)0.5μL引物R(10μM)0.5μLddH2O13.8μL1min30s精選課件判斷16SrDNA序列擴增是否成功:經瓊脂糖凝膠電泳在1500bp附近出現條帶,說明16srDNA已經擴增成功。精選課件精選課件s:///精選課件精選課件精選課件精選課件精選課件精選課件精選課件精選課件精
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